同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00294

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 13

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00294

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00294 Chr07 16852453-17168510 Chr02 106391580-106734319 + High 13 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00294`	Chr07:16852453-17168510	Chr02:106391580-106734319	+	13	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 13 · 当前范围 1–13 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA07G063700 → LXL04_008696

61.4%

TkA07G063730 → LXL04_008697

99.3%

TkA07G063770 → LXL04_008699

96.8%

TkA07G063960 → LXL04_008700

99.7%

TkA07G063970 → LXL04_008701

93.6%

TkA07G063990 → LXL04_008702

100.0%

TkA07G064100 → LXL04_008705

98.5%

TkA07G064110 → LXL04_008706

100.0%

TkA07G064200 → LXL04_008707

83.8%

TkA07G064560 → LXL04_008711

100.0%

TkA07G064610 → LXL04_008712

100.0%

TkA07G064620 → LXL04_008713

99.1%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA07G063700`	`LXL04_008696`	`JCVI_TKOH_00294`	61.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G063730`	`LXL04_008697`	`JCVI_TKOH_00294`	99.3	94.737 / 95.031	Probable
`TkA07G063770`	`LXL04_008699`	`JCVI_TKOH_00294`	96.8	94.049 / 39.951	待复核
`TkA07G063960`	`LXL04_008700`	`JCVI_TKOH_00294`	99.7	100.0 / 71.533	Complex
`TkA07G063970`	`LXL04_008701`	`JCVI_TKOH_00294`	93.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G063990`	`LXL04_008702`	`JCVI_TKOH_00294`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G064100`	`LXL04_008705`	`JCVI_TKOH_00294`	98.5	100.0 / 100.0	待复核
`TkA07G064110`	`LXL04_008706`	`JCVI_TKOH_00294`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G064200`	`LXL04_008707`	`JCVI_TKOH_00294`	83.8	84.483 / 66.946	Complex
`TkA07G064560`	`LXL04_008711`	`JCVI_TKOH_00294`	100.0	100.0 / 91.316	Complex
`TkA07G064610`	`LXL04_008712`	`JCVI_TKOH_00294`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA07G064620`	`LXL04_008713`	`JCVI_TKOH_00294`	99.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G065020`	`LXL04_008714`	`JCVI_TKOH_00294`	100.0	100.0 / 100.0	Complex