同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00208

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 31

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00208

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00208 Chr04 122134613-123368525 Chr09 53163010-54197783 mixed High 31 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00208`	Chr04:122134613-123368525	Chr09:53163010-54197783	mixed	31	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 31 · 当前范围 1–31 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA04G483440 → LXL04_038937

96.4%

TkA04G483460 → LXL04_038938

80.8%

TkA04G483510 → LXL04_038939

99.7%

TkA04G483570 → LXL04_038941

98.5%

TkA04G483630 → LXL04_038943

97.8%

TkA04G484530 → LXL04_038945

96.7%

TkA04G484540 → LXL04_038952

96.6%

TkA04G486500 → LXL04_038946

99.4%

TkA04G486510 → LXL04_038945

96.9%

TkA04G486580 → LXL04_038943

98.1%

TkA04G486610 → LXL04_038943

95.7%

TkA04G486670 → LXL04_038942

97.3%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA04G483440`	`LXL04_038937`	`JCVI_TKOH_00208`	96.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G483460`	`LXL04_038938`	`JCVI_TKOH_00208`	80.8	100.0 / 98.959	Complex
`TkA04G483510`	`LXL04_038939`	`JCVI_TKOH_00208`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G483570`	`LXL04_038941`	`JCVI_TKOH_00208`	98.5	93.706 / 31.829	待复核
`TkA04G483630`	`LXL04_038943`	`JCVI_TKOH_00208`	97.8	100.0 / 98.839	Complex
`TkA04G484530`	`LXL04_038945`	`JCVI_TKOH_00208`	96.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G484540`	`LXL04_038952`	`JCVI_TKOH_00208`	96.6	23.506 / 76.623	待复核
`TkA04G486500`	`LXL04_038946`	`JCVI_TKOH_00208`	99.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA04G486510`	`LXL04_038945`	`JCVI_TKOH_00208`	96.9	100.0 / 93.038	Complex
`TkA04G486580`	`LXL04_038943`	`JCVI_TKOH_00208`	98.1	100.0 / 98.839	Complex
`TkA04G486610`	`LXL04_038943`	`JCVI_TKOH_00208`	95.7	43.501 / 15.861	Complex
`TkA04G486670`	`LXL04_038942`	`JCVI_TKOH_00208`	97.3	82.09 / 43.137	待复核
`TkA04G486710`	`LXL04_038941`	`JCVI_TKOH_00208`	98.5	93.706 / 31.829	待复核
`TkA04G487040`	`LXL04_038939`	`JCVI_TKOH_00208`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G487050`	`LXL04_038938`	`JCVI_TKOH_00208`	81.7	100.0 / 98.959	Complex
`TkA04G487080`	`LXL04_038937`	`JCVI_TKOH_00208`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G487130`	`LXL04_038936`	`JCVI_TKOH_00208`	99.6	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G487180`	`LXL04_038935`	`JCVI_TKOH_00208`	99.8	95.968 / 39.113	待复核
`TkA04G487190`	`LXL04_038935`	`JCVI_TKOH_00208`	85.3	98.824 / 31.882	Complex
`TkA04G487210`	`LXL04_038934`	`JCVI_TKOH_00208`	77.0	99.01 / 67.742	Complex
`TkA04G487280`	`LXL04_038933`	`JCVI_TKOH_00208`	99.4	99.72 / 84.198	Complex
`TkA04G487330`	`LXL04_038932`	`JCVI_TKOH_00208`	97.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G487370`	`LXL04_038929`	`JCVI_TKOH_00208`	97.8	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G487380`	`LXL04_038928`	`JCVI_TKOH_00208`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G487410`	`LXL04_038927`	`JCVI_TKOH_00208`	99.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G487420`	`LXL04_038926`	`JCVI_TKOH_00208`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G487440`	`LXL04_038925`	`JCVI_TKOH_00208`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G487470`	`LXL04_038924`	`JCVI_TKOH_00208`	94.1	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G487760`	`LXL04_038922`	`JCVI_TKOH_00208`	89.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G487970`	`LXL04_038920`	`JCVI_TKOH_00208`	99.6	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G488020`	`LXL04_038918`	`JCVI_TKOH_00208`	100.0	100.0 / 100.0	Complex