同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00073

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 17

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00073

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00073 Chr02 128516962-128793138 Chr02 167312124-167720433 mixed High 17 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00073`	Chr02:128516962-128793138	Chr02:167312124-167720433	mixed	17	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 17 · 当前范围 1–17 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA02G501560 → LXL04_011561

99.7%

TkA02G501650 → LXL04_011562

93.5%

TkA02G501850 → LXL04_011565

100.0%

TkA02G501930 → LXL04_011567

58.4%

TkA02G501990 → LXL04_011568

95.3%

TkA02G502010 → LXL04_011569

43.9%

TkA02G502020 → LXL04_011569

74.0%

TkA02G502050 → LXL04_011570

95.4%

TkA02G502060 → LXL04_011570

99.1%

TkA02G502140 → LXL04_011574

70.9%

TkA02G502160 → LXL04_011575

91.5%

TkA02G502240 → LXL04_011576

92.7%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA02G501560`	`LXL04_011561`	`JCVI_TKOH_00073`	99.7	100.0 / 34.701	待复核
`TkA02G501650`	`LXL04_011562`	`JCVI_TKOH_00073`	93.5	95.208 / 89.306	Complex
`TkA02G501850`	`LXL04_011565`	`JCVI_TKOH_00073`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G501930`	`LXL04_011567`	`JCVI_TKOH_00073`	58.4	79.676 / 73.67	Complex
`TkA02G501990`	`LXL04_011568`	`JCVI_TKOH_00073`	95.3	98.966 / 16.835	待复核
`TkA02G502010`	`LXL04_011569`	`JCVI_TKOH_00073`	43.9	93.939 / 60.955	Complex
`TkA02G502020`	`LXL04_011569`	`JCVI_TKOH_00073`	74.0	98.953 / 19.73	Complex
`TkA02G502050`	`LXL04_011570`	`JCVI_TKOH_00073`	95.4	84.53 / 30.661	Complex
`TkA02G502060`	`LXL04_011570`	`JCVI_TKOH_00073`	99.1	91.525 / 21.643	待复核
`TkA02G502140`	`LXL04_011574`	`JCVI_TKOH_00073`	70.9	100.0 / 100.0	待复核
`TkA02G502160`	`LXL04_011575`	`JCVI_TKOH_00073`	91.5	92.166 / 67.509	Complex
`TkA02G502240`	`LXL04_011576`	`JCVI_TKOH_00073`	92.7	95.025 / 46.925	待复核
`TkA02G502250`	`LXL04_011577`	`JCVI_TKOH_00073`	100.0	91.622 / 97.977	Complex
`TkA02G502300`	`LXL04_011580`	`JCVI_TKOH_00073`	89.1	96.894 / 34.978	Complex
`TkA02G502420`	`LXL04_011580`	`JCVI_TKOH_00073`	96.4	91.88 / 100.0	Complex
`TkA02G502430`	`LXL04_011581`	`JCVI_TKOH_00073`	99.4	91.247 / 93.225	待复核
`TkA02G502450`	`LXL04_011582`	`JCVI_TKOH_00073`	92.2	83.838 / 76.147	Complex