同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00067
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 11
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00067

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00067 Chr02 99159755-99559426 Chr02 23168492-23821201 + High 11 anchors
Chr02 99159755-99559426 Chr02 23168492-23821201 JCVI_TKOH_00067 · 11 gene pairs TkA02G390610 | LXL04_006726 | 100.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G391100 | LXL04_006728 | 95.4% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA02G391250 | LXL04_006731 | 77.8% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G391260 | LXL04_006731 | 58.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G391350 | LXL04_006732 | 92.8% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G391460 | LXL04_006734 | 100.0% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA02G391490 | LXL04_006735 | 95.1% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G391670 | LXL04_006738 | 91.0% | non_reciprocal_best_hit | Complex TkA02G391720 | LXL04_006739 | 96.6% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G391740 | LXL04_006740 | 98.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G391750 | LXL04_006741 | 99.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00067 Chr02:99159755-99559426 Chr02:23168492-23821201 + 11 高置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 11 · 当前范围 1–11 · 页码 1/1

TkA02G390610 → LXL04_006726
100.0%
TkA02G391100 → LXL04_006728
95.4%
TkA02G391250 → LXL04_006731
77.8%
TkA02G391260 → LXL04_006731
58.0%
TkA02G391350 → LXL04_006732
92.8%
TkA02G391460 → LXL04_006734
100.0%
TkA02G391490 → LXL04_006735
95.1%
TkA02G391670 → LXL04_006738
91.0%
TkA02G391720 → LXL04_006739
96.6%
TkA02G391740 → LXL04_006740
98.0%
TkA02G391750 → LXL04_006741
99.0%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkA02G390610LXL04_006726JCVI_TKOH_00067100.0100.0 / 100.0Complex
TkA02G391100LXL04_006728JCVI_TKOH_0006795.4100.0 / 100.0待复核
TkA02G391250LXL04_006731JCVI_TKOH_0006777.897.674 / 23.633Complex
TkA02G391260LXL04_006731JCVI_TKOH_0006758.0100.0 / 89.258Complex
TkA02G391350LXL04_006732JCVI_TKOH_0006792.875.63 / 98.361Complex
TkA02G391460LXL04_006734JCVI_TKOH_00067100.0100.0 / 56.433待复核
TkA02G391490LXL04_006735JCVI_TKOH_0006795.174.453 / 100.0Complex
TkA02G391670LXL04_006738JCVI_TKOH_0006791.098.039 / 25.063Complex
TkA02G391720LXL04_006739JCVI_TKOH_0006796.6100.0 / 83.352Complex
TkA02G391740LXL04_006740JCVI_TKOH_0006798.0100.0 / 100.0Complex
TkA02G391750LXL04_006741JCVI_TKOH_0006799.0100.0 / 100.0Complex