同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00031
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 39
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00031当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00031 |
Chr01:112026631-113952609 | Chr01:46359351-47725617 | mixed | 39 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 39 · 当前范围 1–39 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA01G448630 | LXL04_002390 | JCVI_TKOH_00031 | 89.2 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G448640 | LXL04_002389 | JCVI_TKOH_00031 | 99.1 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G448650 | LXL04_002388 | JCVI_TKOH_00031 | 93.6 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA01G449130 | LXL04_002386 | JCVI_TKOH_00031 | 79.1 | 99.454 / 39.887 | 待复核 |
TkA01G449210 | LXL04_002381 | JCVI_TKOH_00031 | 91.6 | 60.784 / 80.541 | 待复核 |
TkA01G449450 | LXL04_002379 | JCVI_TKOH_00031 | 85.2 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G449500 | LXL04_002378 | JCVI_TKOH_00031 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G449570 | LXL04_002377 | JCVI_TKOH_00031 | 99.3 | 97.945 / 72.959 | Probable |
TkA01G449580 | LXL04_002376 | JCVI_TKOH_00031 | 99.6 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G451690 | LXL04_002371 | JCVI_TKOH_00031 | 60.6 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G451960 | LXL04_002364 | JCVI_TKOH_00031 | 83.6 | 24.108 / 78.83 | Complex |
TkA01G452060 | LXL04_002363 | JCVI_TKOH_00031 | 96.6 | 73.418 / 30.851 | Complex |
TkA01G452130 | LXL04_002367 | JCVI_TKOH_00031 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G452210 | LXL04_002364 | JCVI_TKOH_00031 | 96.1 | 96.194 / 78.273 | Probable |
TkA01G452220 | LXL04_002363 | JCVI_TKOH_00031 | 99.7 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G452260 | LXL04_002362 | JCVI_TKOH_00031 | 100.0 | 100.0 / 74.634 | Complex |
TkA01G452470 | LXL04_002360 | JCVI_TKOH_00031 | 99.0 | 94.608 / 99.485 | 待复核 |
TkA01G452600 | LXL04_002359 | JCVI_TKOH_00031 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA01G452610 | LXL04_002358 | JCVI_TKOH_00031 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G452860 | LXL04_002355 | JCVI_TKOH_00031 | 85.2 | 99.435 / 33.911 | Complex |
TkA01G452870 | LXL04_002355 | JCVI_TKOH_00031 | 96.6 | 97.222 / 33.719 | 待复核 |
TkA01G452900 | LXL04_002355 | JCVI_TKOH_00031 | 100.0 | 100.0 / 26.975 | 待复核 |
TkA01G452910 | LXL04_002354 | JCVI_TKOH_00031 | 99.9 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G452930 | LXL04_002353 | JCVI_TKOH_00031 | 99.2 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G452960 | LXL04_002352 | JCVI_TKOH_00031 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G452970 | LXL04_002351 | JCVI_TKOH_00031 | 88.6 | 95.833 / 80.366 | 待复核 |
TkA01G453020 | LXL04_002350 | JCVI_TKOH_00031 | 99.4 | 98.837 / 92.896 | Complex |
TkA01G453050 | LXL04_002349 | JCVI_TKOH_00031 | 98.8 | 54.153 / 60.935 | Complex |
TkA01G453230 | LXL04_002348 | JCVI_TKOH_00031 | 98.5 | 87.111 / 84.483 | Strict |
TkA01G453250 | LXL04_002347 | JCVI_TKOH_00031 | 79.3 | 93.6 / 60.87 | 待复核 |
TkA01G453260 | LXL04_002346 | JCVI_TKOH_00031 | 84.3 | 100.0 / 99.422 | 待复核 |
TkA01G453330 | LXL04_002345 | JCVI_TKOH_00031 | 99.7 | 97.849 / 100.0 | Strict |
TkA01G453990 | LXL04_002340 | JCVI_TKOH_00031 | 98.2 | 82.266 / 49.701 | 待复核 |
TkA01G454000 | LXL04_002339 | JCVI_TKOH_00031 | 99.4 | 90.452 / 68.182 | 待复核 |
TkA01G454040 | LXL04_002338 | JCVI_TKOH_00031 | 99.2 | 100.0 / 17.687 | 待复核 |
TkA01G454050 | LXL04_002337 | JCVI_TKOH_00031 | 78.1 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G454130 | LXL04_002336 | JCVI_TKOH_00031 | 99.3 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G454330 | LXL04_002335 | JCVI_TKOH_00031 | 100.0 | 99.388 / 97.598 | Complex |
TkA01G454690 | LXL04_002334 | JCVI_TKOH_00031 | 99.4 | 81.218 / 94.395 | Strict |