同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00309

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 28

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00309

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00309 Chr07 79616342-81001276 Chr06 91787935-93181984 mixed High 28 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00309`	Chr07:79616342-81001276	Chr06:91787935-93181984	mixed	28	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 28 · 当前范围 1–28 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA07G317650 → LXL04_029531

94.5%

TkA07G318670 → LXL04_029526

99.4%

TkA07G319250 → LXL04_029521

97.8%

TkA07G319550 → LXL04_029520

100.0%

TkA07G319560 → LXL04_029519

77.7%

TkA07G319650 → LXL04_029518

100.0%

TkA07G319910 → LXL04_029517

98.7%

TkA07G320010 → LXL04_029515

87.1%

TkA07G320020 → LXL04_029513

97.4%

TkA07G320030 → LXL04_029512

98.9%

TkA07G320160 → LXL04_029511

98.9%

TkA07G320490 → LXL04_029509

99.8%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA07G317650`	`LXL04_029531`	`JCVI_TKOH_00309`	94.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G318670`	`LXL04_029526`	`JCVI_TKOH_00309`	99.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G319250`	`LXL04_029521`	`JCVI_TKOH_00309`	97.8	100.0 / 79.61	Complex
`TkA07G319550`	`LXL04_029520`	`JCVI_TKOH_00309`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA07G319560`	`LXL04_029519`	`JCVI_TKOH_00309`	77.7	99.668 / 98.201	Complex
`TkA07G319650`	`LXL04_029518`	`JCVI_TKOH_00309`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA07G319910`	`LXL04_029517`	`JCVI_TKOH_00309`	98.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G320010`	`LXL04_029515`	`JCVI_TKOH_00309`	87.1	92.218 / 78.613	Complex
`TkA07G320020`	`LXL04_029513`	`JCVI_TKOH_00309`	97.4	87.861 / 79.167	Complex
`TkA07G320030`	`LXL04_029512`	`JCVI_TKOH_00309`	98.9	96.809 / 47.314	待复核
`TkA07G320160`	`LXL04_029511`	`JCVI_TKOH_00309`	98.9	100.0 / 63.507	Complex
`TkA07G320490`	`LXL04_029509`	`JCVI_TKOH_00309`	99.8	97.528 / 46.318	待复核
`TkA07G320500`	`LXL04_029508`	`JCVI_TKOH_00309`	100.0	85.484 / 27.993	待复核
`TkA07G320680`	`LXL04_029506`	`JCVI_TKOH_00309`	100.0	44.079 / 26.693	Complex
`TkA07G320870`	`LXL04_029503`	`JCVI_TKOH_00309`	100.0	96.25 / 90.588	待复核
`TkA07G321030`	`LXL04_029502`	`JCVI_TKOH_00309`	95.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G321090`	`LXL04_029501`	`JCVI_TKOH_00309`	96.4	93.888 / 48.855	待复核
`TkA07G321120`	`LXL04_029500`	`JCVI_TKOH_00309`	99.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G321260`	`LXL04_029499`	`JCVI_TKOH_00309`	99.1	97.414 / 55.665	待复核
`TkA07G321290`	`LXL04_029498`	`JCVI_TKOH_00309`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G321300`	`LXL04_029497`	`JCVI_TKOH_00309`	97.0	100.0 / 36.496	待复核
`TkA07G321450`	`LXL04_029496`	`JCVI_TKOH_00309`	99.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G321640`	`LXL04_029495`	`JCVI_TKOH_00309`	98.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G322260`	`LXL04_029489`	`JCVI_TKOH_00309`	98.5	88.636 / 52.279	待复核
`TkA07G323070`	`LXL04_029487`	`JCVI_TKOH_00309`	98.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G323450`	`LXL04_029479`	`JCVI_TKOH_00309`	100.0	100.0 / 28.29	待复核
`TkA07G323470`	`LXL04_029482`	`JCVI_TKOH_00309`	81.2	94.824 / 17.211	Complex
`TkA07G323580`	`LXL04_029479`	`JCVI_TKOH_00309`	100.0	100.0 / 100.0	待复核