同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00238

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 23

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00238

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00238 Chr05 56071595-64284010 Chr04 87352986-96101164 mixed High 23 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00238`	Chr05:56071595-64284010	Chr04:87352986-96101164	mixed	23	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 23 · 当前范围 1–23 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA05G224020 → LXL04_020526

78.3%

TkA05G224210 → LXL04_020530

100.0%

TkA05G224410 → LXL04_020529

95.7%

TkA05G224460 → LXL04_020532

92.0%

TkA05G231490 → LXL04_020560

99.4%

TkA05G233210 → LXL04_020580

94.3%

TkA05G237810 → LXL04_020575

97.8%

TkA05G242560 → LXL04_020584

99.9%

TkA05G243410 → LXL04_020586

97.8%

TkA05G245020 → LXL04_020590

88.3%

TkA05G245100 → LXL04_020591

98.8%

TkA05G248040 → LXL04_020602

94.9%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA05G224020`	`LXL04_020526`	`JCVI_TKOH_00238`	78.3	43.271 / 37.594	Complex
`TkA05G224210`	`LXL04_020530`	`JCVI_TKOH_00238`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G224410`	`LXL04_020529`	`JCVI_TKOH_00238`	95.7	76.86 / 39.574	Complex
`TkA05G224460`	`LXL04_020532`	`JCVI_TKOH_00238`	92.0	65.672 / 57.534	待复核
`TkA05G231490`	`LXL04_020560`	`JCVI_TKOH_00238`	99.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G233210`	`LXL04_020580`	`JCVI_TKOH_00238`	94.3	79.104 / 88.827	Complex
`TkA05G237810`	`LXL04_020575`	`JCVI_TKOH_00238`	97.8	100.0 / 54.192	待复核
`TkA05G242560`	`LXL04_020584`	`JCVI_TKOH_00238`	99.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G243410`	`LXL04_020586`	`JCVI_TKOH_00238`	97.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G245020`	`LXL04_020590`	`JCVI_TKOH_00238`	88.3	95.294 / 42.95	待复核
`TkA05G245100`	`LXL04_020591`	`JCVI_TKOH_00238`	98.8	100.0 / 100.0	待复核
`TkA05G248040`	`LXL04_020602`	`JCVI_TKOH_00238`	94.9	91.892 / 73.333	Complex
`TkA05G248950`	`LXL04_020604`	`JCVI_TKOH_00238`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G251050`	`LXL04_020602`	`JCVI_TKOH_00238`	94.9	91.892 / 73.333	Complex
`TkA05G251490`	`LXL04_020600`	`JCVI_TKOH_00238`	100.0	95.161 / 39.509	待复核
`TkA05G251510`	`LXL04_020599`	`JCVI_TKOH_00238`	100.0	95.652 / 50.993	待复核
`TkA05G251590`	`LXL04_020598`	`JCVI_TKOH_00238`	100.0	100.0 / 63.522	待复核
`TkA05G252240`	`LXL04_020596`	`JCVI_TKOH_00238`	96.7	99.282 / 88.902	Strict
`TkA05G253920`	`LXL04_020612`	`JCVI_TKOH_00238`	97.5	97.59 / 100.0	待复核
`TkA05G255520`	`LXL04_020614`	`JCVI_TKOH_00238`	78.1	95.88 / 67.588	Complex
`TkA05G257560`	`LXL04_020610`	`JCVI_TKOH_00238`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G258010`	`LXL04_020619`	`JCVI_TKOH_00238`	91.5	100.0 / 88.05	Complex
`TkA05G259290`	`LXL04_020622`	`JCVI_TKOH_00238`	99.2	100.0 / 100.0	待复核