同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00201

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00201

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00201 Chr04 90493806-91243394 Chr09 25312173-25975292 mixed High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00201`	Chr04:90493806-91243394	Chr09:25312173-25975292	mixed	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA04G359120 → LXL04_037940

91.2%

TkA04G359560 → LXL04_037943

64.0%

TkA04G360060 → LXL04_037916

67.6%

TkA04G360070 → LXL04_037921

91.8%

TkA04G360930 → LXL04_037935

98.3%

TkA04G360960 → LXL04_037933

54.1%

TkA04G360970 → LXL04_037932

64.0%

TkA04G361050 → LXL04_037931

100.0%

TkA04G361150 → LXL04_037929

100.0%

TkA04G361370 → LXL04_037927

94.9%

TkA04G361480 → LXL04_037922

67.9%

TkA04G361510 → LXL04_037916

73.9%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA04G359120`	`LXL04_037940`	`JCVI_TKOH_00201`	91.2	95.325 / 39.52	待复核
`TkA04G359560`	`LXL04_037943`	`JCVI_TKOH_00201`	64.0	91.436 / 57.895	Complex
`TkA04G360060`	`LXL04_037916`	`JCVI_TKOH_00201`	67.6	97.368 / 100.0	Complex
`TkA04G360070`	`LXL04_037921`	`JCVI_TKOH_00201`	91.8	95.652 / 34.385	Complex
`TkA04G360930`	`LXL04_037935`	`JCVI_TKOH_00201`	98.3	97.479 / 69.461	待复核
`TkA04G360960`	`LXL04_037933`	`JCVI_TKOH_00201`	54.1	65.896 / 90.654	待复核
`TkA04G360970`	`LXL04_037932`	`JCVI_TKOH_00201`	64.0	51.327 / 71.404	待复核
`TkA04G361050`	`LXL04_037931`	`JCVI_TKOH_00201`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G361150`	`LXL04_037929`	`JCVI_TKOH_00201`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA04G361370`	`LXL04_037927`	`JCVI_TKOH_00201`	94.9	100.0 / 100.0	Probable
`TkA04G361480`	`LXL04_037922`	`JCVI_TKOH_00201`	67.9	98.707 / 90.75	Complex
`TkA04G361510`	`LXL04_037916`	`JCVI_TKOH_00201`	73.9	70.492 / 79.279	Complex
`TkA04G361520`	`LXL04_037921`	`JCVI_TKOH_00201`	100.0	97.321 / 34.385	待复核
`TkA04G361590`	`LXL04_037919`	`JCVI_TKOH_00201`	96.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G361630`	`LXL04_037921`	`JCVI_TKOH_00201`	80.2	77.692 / 31.861	Complex
`TkA04G362320`	`LXL04_037946`	`JCVI_TKOH_00201`	94.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA04G362420`	`LXL04_037941`	`JCVI_TKOH_00201`	71.4	95.536 / 50.638	Complex
`TkA04G362470`	`LXL04_037947`	`JCVI_TKOH_00201`	99.6	99.794 / 93.07	Strict