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基因概览

LXL04_037935

当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 25590694-25591410 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

504 bp · LXL04_037935|LXL04_037935|OH1004|cDNA

ATGGCGAAGGTACTCACAAGTTTACTCAATTCAATTCGATTTTGTTTTGCATTTGTTTGTACAGTTGAGCTCAATTTGTGCAAATGGTTATGTACGCAGCAAAAGATTGTGGTGAAAATTACAATGCACAACGAAAAGAAAATTCGTAAGGCTCTGAAGATCGCTGTTAGTCTCTCCGGTGTTGAATCGGCGTCATTTGTTGGTTCAGATAAAACCCAGATCGCTGTGACCGGGGAAGATGTTGACTCGGTGGAACTAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

504 bp · LXL04_037935|LXL04_037935|OH1004|CDS

ATGGCGAAGGTACTCACAAGTTTACTCAATTCAATTCGATTTTGTTTTGCATTTGTTTGTACAGTTGAGCTCAATTTGTGCAAATGGTTATGTACGCAGCAAAAGATTGTGGTGAAAATTACAATGCACAACGAAAAGAAAATTCGTAAGGCTCTGAAGATCGCTGTTAGTCTCTCCGGTGTTGAATCGGCGTCATTTGTTGGTTCAGATAAAACCCAGATCGCTGTGACCGGGGAAGATGTTGACTCGGTGGAACTAGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

167 aa · LXL04_037935|LXL04_037935|OH1004|PROTEIN

MAKVLTSLLNSIRFCFAFVCTVELNLCKWLCTQQKIVVKITMHNEKKIRKALKIAVSLSGVESASFVGSDKTQIAVTGEDVDSVELVTLLRKGVGYTELVSVGPVEEKKPAAAKETKPMVAPLYVNPYQLDPFVEGVSYNISVNIFINKDPPFKPPRFKKSSNCCPF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_037935`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_037935

位置 Chr09:25590694-25591410 (-)

描述 Similar to HIPP16: Heavy metal-associated isoprenylated plant protein 16

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g07600`	可能的重金属结合蛋白。	暂无已核实直接文献
`At5g48290`	可能的重金属结合蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: F2VYU4`	疾病抗性（R）蛋白，特异性识别稻瘟病菌 M. oryzae 的 AVR-Pik 效应子复敏蛋白。	暂无已核实直接文献
`UniProt: B5UBC1`	疾病抗性（R）蛋白，特异性识别稻瘟病菌 M. oryzae 的 AVR-Pik 效应子复敏蛋白。	暂无已核实直接文献
`UniProt: F7J0N2`	抗病（R）蛋白，能够识别来自稻瘟病菌 M.oryzae 的 AVR-Pia 和 AVR1-CO39 效应子无毒化蛋白。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037935 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0051707 response to other organism 生物过程

GO:0062207 regulation of pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0043531 ADP binding 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G07600

ath:AT5G48290

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.409

排名 1 · LXL04_037935 · OH-1004

细胞核0.326

排名 2 · LXL04_037935 · OH-1004

细胞膜0.248

排名 3 · LXL04_037935 · OH-1004

内质网0.126

排名 4 · LXL04_037935 · OH-1004

线粒体0.088

排名 5 · LXL04_037935 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SSF0`	拟南芥	Heavy metal-associated isoprenylated plant protein 16	42.857%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q5PNZ7`	拟南芥	Heavy metal-associated isoprenylated plant protein 46	42.857%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`F2VYU4`	水稻	Disease resistance protein Pik-1	40.000%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`B5UBC1`	水稻	Disease resistance protein Pikm1-TS	38.889%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`F7J0N2`	水稻	Disease resistance protein RGA5	37.500%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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