ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 56 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA05G299260
Chr05:73806385-73807935 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020728
Chr04:107113553-107115103 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G299260 |
|
TkA05G299670
Chr05:73897690-73901712 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020731
Chr04:107209894-107212473 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G299670 |
|
TkA05G300050
Chr05:74020743-74022519 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020739
Chr04:107273335-107274755 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
77.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G300050 |
|
TkA05G301270
Chr05:74298545-74300307 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_023497
Chr05:45539476-45543760 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 48.899 |
TkA05G301270 | |
|
TkA05G302320
Chr05:74596482-74598658 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020752
Chr04:107840233-107841052 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G302320 |
|
TkA05G302480
Chr05:74635626-74636388 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_006215
Chr02:4072499-4073261 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G302480 | |
|
TkA05G302510
Chr05:74640258-74640698 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_026937
Chr06:5630602-5631083 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G302510 | |
|
TkA05G303900
Chr05:74978221-74988125 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_029321
Chr06:87431632-87436723 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
69.500 查询 28.025 / 对象 19.156 |
TkA05G303900 | |
|
TkA05G305880
Chr05:75437398-75441472 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020781
Chr04:108892386-108895303 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 96.814 / 对象 93.824 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G305880 |
|
TkA05G305890
Chr05:75442955-75443973 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_034605
Chr07:110056966-110060383 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.300 查询 100.000 / 对象 62.322 |
TkA05G305890 | |
|
TkA05G305900
Chr05:75444560-75445633 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_012404
Chr03:11656201-11657498 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.700 查询 100.000 / 对象 96.226 |
TkA05G305900 | |
|
TkA05G306350
Chr05:75588136-75588904 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_027318
Chr06:13492419-13492907 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.800 查询 63.566 / 对象 100.000 |
TkA05G306350 | |
|
TkA05G306870
Chr05:75753265-75762037 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_038771
Chr09:50030454-50030999 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.600 查询 42.455 / 对象 91.713 |
TkA05G306870 | |
|
TkA05G307530
Chr05:75912027-75913090 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_001957
Chr01:38008534-38009532 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.700 查询 100.000 / 对象 87.204 |
TkA05G307530 | |
|
TkA05G307660
Chr05:75940963-75941882 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_029620
Chr06:95637774-95639409 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 47.222 |
TkA05G307660 | |
|
TkA05G309500
Chr05:76392995-76393882 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_023320
Chr05:32545542-32550753 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.700 查询 86.935 / 对象 24.750 |
TkA05G309500 | |
|
TkA05G309930
Chr05:76484253-76486416 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020752
Chr04:107840233-107841052 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.200 查询 100.000 / 对象 88.462 |
TkA05G309930 | |
|
TkA05G309970
Chr05:76490221-76491244 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_034195
Chr07:89787484-89791393 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.900 查询 47.699 / 对象 61.957 |
TkA05G309970 | |
|
TkA05G310290
Chr05:76557505-76561582 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020781
Chr04:108892386-108895303 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 96.814 / 对象 93.824 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G310290 |
|
TkA05G311910
Chr05:76976103-76976918 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_035467
Chr08:23145395-23146249 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 72.143 / 对象 50.249 |
TkA05G311910 | |
|
TkA05G312530
Chr05:77117161-77117627 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_014726
Chr03:55635158-55635624 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G312530 | |
|
TkA05G312960
Chr05:77229556-77233599 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020815
Chr04:110021403-110025115 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G312960 |
|
TkA05G313380
Chr05:77353101-77355727 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020820
Chr04:110186886-110189110 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.700 查询 100.000 / 对象 57.512 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G313380 |
|
TkA05G314300
Chr05:77550146-77550508 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_011836
Chr03:1268183-1279131 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
71.700 查询 72.500 / 对象 36.131 |
TkA05G314300 | |
|
TkA05G314320
Chr05:77555041-77558269 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020824
Chr04:110354555-110357312 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G314320 |
|
TkA05G314980
Chr05:77734209-77734616 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020834
Chr04:110741576-110742402 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 54.217 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G314980 |
|
TkA05G315160
Chr05:77767432-77767902 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_010191
Chr02:141709092-141716251 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.100 查询 59.434 / 对象 15.633 |
TkA05G315160 | |
|
TkA05G315960
Chr05:77964577-77973700 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020846
Chr04:110919346-110926018 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 48.818 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G315960 |
|
TkA05G316560
Chr05:78130593-78130895 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_034755
Chr07:115896733-115901655 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.700 查询 88.000 / 对象 27.500 |
TkA05G316560 | |
|
TkA05G317700
Chr05:78415064-78415639 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_009451
Chr02:126738793-126739374 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.300 查询 100.000 / 对象 98.658 |
TkA05G317700 | |
|
TkA05G318310
Chr05:78572148-78572759 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_021606
Chr04:133432728-133435381 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.900 查询 100.000 / 对象 23.541 |
TkA05G318310 | |
|
TkA05G318940
Chr05:78709516-78711918 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020861
Chr04:111684180-111686258 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G318940 |
|
TkA05G319040
Chr05:78749565-78750340 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019682
Chr04:36858983-36859758 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G319040 | |
|
TkA05G319050
Chr05:78752264-78752629 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_005051
Chr01:153835019-153837624 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.600 查询 95.868 / 对象 21.887 |
TkA05G319050 | |
|
TkA05G319720
Chr05:78900904-78903378 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_034062
Chr07:78842243-78844273 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
70.900 查询 54.500 / 对象 45.035 |
TkA05G319720 | |
|
TkA05G320240
Chr05:79039228-79039955 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_034802
Chr08:1667957-1668814 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.000 查询 70.423 / 对象 48.309 |
TkA05G320240 | |
|
TkA05G324030
Chr05:79893885-79894794 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_032534
Chr07:24840621-24842780 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.300 查询 41.176 / 对象 23.026 |
TkA05G324030 | |
|
TkA05G324180
Chr05:79923412-79925402 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_009765
Chr02:132862069-132866107 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 93.333 / 对象 52.142 |
TkA05G324180 | |
|
TkA05G326100
Chr05:80332343-80334026 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_006214
Chr02:4032599-4033528 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.000 查询 51.235 / 对象 94.318 |
TkA05G326100 | |
|
TkA05G326760
Chr05:80492600-80493127 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020890
Chr04:113110772-113111593 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 96.685 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G326760 |
|
TkA05G326860
Chr05:80526033-80527001 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020892
Chr04:113143157-113145471 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 100.000 / 对象 48.205 |
JCVI_TKOH_00240 | TkA05G326860 |
|
TkA05G331970
Chr05:81759027-81760443 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020908
Chr04:114709082-114710384 (+)
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CM104802.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.800 查询 100.000 / 对象 72.571 |
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96.700 查询 97.422 / 对象 59.815 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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86.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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|
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.000 查询 100.000 / 对象 42.522 |
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Chr04:120654942-120659430 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
77.200 查询 99.192 / 对象 73.596 |
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CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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CM104802.1
|
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|
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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CM104802.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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LXL04_021147
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.100 查询 90.351 / 对象 19.508 |
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TkA05G357730
Chr05:88733750-88736762 (+)
GWHBCHF00000006
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LXL04_021147
Chr04:122687735-122691684 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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TkA05G358150
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LXL04_021153
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CM104802.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.800 查询 99.526 / 对象 99.038 |
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TkA05G358700
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 100.000 / 对象 48.884 |
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TkA05G360840
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104804.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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TkA05G362510 | |
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TkA05G363260
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 98.995 / 对象 52.957 |
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TkA05G363270
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LXL04_021194
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CM104802.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.700 查询 100.000 / 对象 47.043 |
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CM104799.1
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85.200 查询 48.352 / 对象 98.876 |
TkA05G365410 | |
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TkA05G365440
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TkA05G365440 | |
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TkA05G367160
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CM104807.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 56.150 |
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94.100 查询 100.000 / 对象 50.599 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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Chr04:124962021-124962971 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 78.351 |
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