基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_021159
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 122889272-122898010
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3765 bp · LXL04_021159|LXL04_021159|OH1004|cDNA
ATGTGGAGAAGAAGAGTTTTCACTTTGGTCCGATACTTCTCTTCTGAACCAGAAACCCCATCTCCTCCTTCCGTTTATTCCTTCCTCCAGCCTTCAATCTTTGCCGTAAGAAAACCTCAATCCAAACAAGCTCCCGAGTCTAACAATCAAACCCCCAAACCTGTAGCCGTAGATAACCAACTTACCCCCAATCTCGAATCCACTCTCCAATTATCTCTTCACGAAAATAACACAGACGAAGCTTGGAAGTGCTTCAAATC...
CDS
下载 CDS FASTA3765 bp · LXL04_021159|LXL04_021159|OH1004|CDS
ATGTGGAGAAGAAGAGTTTTCACTTTGGTCCGATACTTCTCTTCTGAACCAGAAACCCCATCTCCTCCTTCCGTTTATTCCTTCCTCCAGCCTTCAATCTTTGCCGTAAGAAAACCTCAATCCAAACAAGCTCCCGAGTCTAACAATCAAACCCCCAAACCTGTAGCCGTAGATAACCAACTTACCCCCAATCTCGAATCCACTCTCCAATTATCTCTTCACGAAAATAACACAGACGAAGCTTGGAAGTGCTTCAAATC...
1254 aa · LXL04_021159|LXL04_021159|OH1004|PROTEIN
MWRRRVFTLVRYFSSEPETPSPPSVYSFLQPSIFAVRKPQSKQAPESNNQTPKPVAVDNQLTPNLESTLQLSLHENNTDEAWKCFKSLSSSSSSLLPSKPLINSLITHLCSVRNDTHNLKRAFATLMFVLEANPEVLEHKTVETFLISMKVTNGAPAFALVKSMFKNRYFVPFSIWGNTLVEISRKTGRFCDFLEAFNENCRIAKEEKLDSLKPDLSACNAALEGCCHELESVTDAHKVLDIMSLLGVRPNETTFGYLAY...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_021159 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_021159 |
|---|---|
| 位置 | Chr04:122889272-122898010 (+) |
| 描述 | Similar to PAP1: Probable inactive purple acid phosphatase 1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0003993 acid phosphatase activity 分子功能 GO:0046872 metal ion binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G13750 ath:AT1G68980 ath:AT1G69290 ath:AT4G24890 ath:AT5G50400 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
质体0.773
高尔基体0.054
细胞膜0.049
溶酶体／液泡0.046
细胞质0.045
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF25245.1TPR_At1g6898059-213 aaPF23276.3TPR_24371-461 aaPF29070.1MSC6_N473-565 aaPF13041.13PPR_2509-552 aaPF01535.27PPR509-533 aaPF12854.14PPR_1509-533 aaPF17808.8fn3_PAP689-807 aaPF16656.12Pur_ac_phosph_N811-918 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_021159 | PF25245.1 | TPR_At1g68980 | 59 | 213 | 2.3e-62 | 210.4 |
| LXL04_021159 | PF23276.3 | TPR_24 | 371 | 461 | 2.3e-13 | 50.9 |
| LXL04_021159 | PF29070.1 | MSC6_N | 473 | 565 | 2.2e-09 | 37.6 |
| LXL04_021159 | PF13041.13 | PPR_2 | 509 | 552 | 6.4e-32 | 110.1 |
| LXL04_021159 | PF01535.27 | PPR | 509 | 533 | 4.2e-26 | 90.0 |
| LXL04_021159 | PF12854.14 | PPR_1 | 509 | 533 | 1.8e-12 | 47.5 |
| LXL04_021159 | PF17808.8 | fn3_PAP | 689 | 807 | 4.9e-39 | 133.8 |
| LXL04_021159 | PF16656.12 | Pur_ac_phosph_N | 811 | 918 | 8.1e-12 | 46.3 |
| LXL04_021159 | PF00149.34 | Metallophos | 931 | 1145 | 1.4e-16 | 62.3 |
| LXL04_021159 | PF14008.12 | Metallophos_C | 1170 | 1229 | 8.1e-16 | 59.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LMX4 | 拟南芥 | Probable inactive purple acid phosphatase 1 | 72.268% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q5MAU8 | 拟南芥 | Probable inactive purple acid phosphatase 27 | 67.875% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q8H1R2 | 拟南芥 | Probable inactive purple acid phosphatase 24 | 64.657% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
P0C7R4 | 拟南芥 | Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g69290 | 57.566% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9CAA5 | 拟南芥 | Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g68980, mitochondrial | 54.003% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |