ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 39 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA03G545840
Chr03:137721968-137723903 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010736
Chr02:152424231-152428762 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.700 查询 95.291 / 对象 53.991 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G545840 |
|
TkA03G545860
Chr03:137726411-137733153 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010738
Chr02:152436189-152441036 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G545860 |
|
TkA03G546030
Chr03:137769809-137772622 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010745
Chr02:152489640-152492338 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.200 查询 100.000 / 对象 87.844 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G546030 |
|
TkA03G546090
Chr03:137785660-137786695 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010747
Chr02:152500369-152503921 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 99.057 / 对象 69.307 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G546090 |
|
TkA03G547190
Chr03:138011224-138015586 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_018811
Chr04:18526957-18529260 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.800 查询 58.125 / 对象 35.496 |
TkA03G547190 | |
|
TkA03G547390
Chr03:138081993-138084338 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_023082
Chr05:22610340-22624844 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.600 查询 99.711 / 对象 26.142 |
TkA03G547390 | |
|
TkA03G547580
Chr03:138128055-138131658 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010760
Chr02:152772363-152775347 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 47.382 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G547580 |
|
TkA03G547900
Chr03:138198865-138207428 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_037593
Chr09:15567577-15576277 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.500 查询 99.387 / 对象 8.990 |
TkA03G547900 | |
|
TkA03G548110
Chr03:138274915-138277189 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010765
Chr02:152921184-152922976 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 95.714 / 对象 40.120 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G548110 |
|
TkA03G549240
Chr03:138948694-138949187 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_002156
Chr01:42883696-42884188 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA03G549240 | |
|
TkA03G549430
Chr03:139008252-139009876 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010796
Chr02:153640915-153642219 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 61.932 / 对象 43.254 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G549430 |
|
TkA03G549450
Chr03:139013532-139022086 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010797
Chr02:153646307-153654380 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.500 查询 97.818 / 对象 23.872 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G549450 |
|
TkA03G549530
Chr03:139061018-139077158 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010800
Chr02:153671660-153679316 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.100 查询 99.886 / 对象 99.717 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G549530 |
|
TkA03G550020
Chr03:139221883-139231729 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010818
Chr02:153931122-153933986 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
70.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G550020 |
|
TkA03G550010
Chr03:139223540-139224074 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010816
Chr02:153921774-153926084 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 13.896 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G550010 |
|
TkA03G550070
Chr03:139245704-139249625 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010170
Chr02:141318852-141320700 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
73.000 查询 100.000 / 对象 94.078 |
TkA03G550070 | |
|
TkA03G550630
Chr03:139348372-139351599 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_023625
Chr05:57020550-57021504 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.500 查询 93.220 / 对象 62.500 |
TkA03G550630 | |
|
TkA03G550780
Chr03:139406992-139408917 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010823
Chr02:154085786-154086804 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G550780 |
|
TkA03G550840
Chr03:139425171-139425791 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010827
Chr02:154103068-154104033 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
91.700 查询 100.000 / 对象 64.174 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G550840 |
|
TkA03G551260
Chr03:139574441-139575886 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010836
Chr02:154293548-154294906 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.200 查询 89.759 / 对象 98.894 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G551260 |
|
TkA03G551430
Chr03:139611298-139616802 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010345
Chr02:144635502-144640014 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
61.100 查询 69.424 / 对象 76.018 |
TkA03G551430 | |
|
TkA03G551560
Chr03:139663488-139664418 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010846
Chr02:154382092-154382732 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G551560 |
|
TkA03G552230
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_010854
Chr02:154417782-154419312 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G552230 |
|
TkA03G552240
Chr03:139815210-139815704 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010867
Chr02:154477723-154482410 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 17.735 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G552240 |
|
TkA03G552470
Chr03:139884797-139889261 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_036863
Chr08:49262025-49264007 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA03G552470 | |
|
TkA03G553200
Chr03:140066188-140068360 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010876
Chr02:154682473-154688207 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 96.117 / 对象 19.527 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G553200 |
|
TkA03G554640
Chr03:140425159-140425479 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_006650
Chr02:20956718-20957050 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
76.500 查询 48.113 / 对象 46.364 |
TkA03G554640 | |
|
TkA03G554720
Chr03:140447813-140449140 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010895
Chr02:154982777-154983914 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 83.456 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G554720 |
|
TkA03G554760
Chr03:140451468-140455970 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010897
Chr02:154996869-154999973 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.300 查询 74.214 / 对象 67.429 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G554760 |
|
TkA03G554770
Chr03:140457199-140457783 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010898
Chr02:155001862-155002860 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 58.434 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G554770 |
|
TkA03G554950
Chr03:140502065-140502739 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010905
Chr02:155048943-155049926 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 68.502 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G554950 |
|
TkA03G555070
Chr03:140539644-140541979 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010910
Chr02:155081185-155083649 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G555070 |
|
TkA03G555100
Chr03:140551414-140554155 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_033784
Chr07:57455926-57459052 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.800 查询 100.000 / 对象 56.345 |
TkA03G555100 | |
|
TkA03G555140
Chr03:140557682-140559184 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010956
Chr02:155672895-155678504 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 96.330 / 对象 43.478 |
TkA03G555140 | |
|
TkA03G555280
Chr03:140584674-140585832 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010915
Chr02:155125922-155127285 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.600 查询 97.059 / 对象 93.939 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G555280 |
|
TkA03G555300
Chr03:140589442-140589864 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010917
Chr02:155131494-155131916 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G555300 |
|
TkA03G555340
Chr03:140601439-140602822 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010920
Chr02:155182041-155187147 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.500 查询 94.366 / 对象 16.708 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G555340 |
|
TkA03G555360
Chr03:140605214-140607291 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010920
Chr02:155182041-155187147 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 100.000 / 对象 33.292 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G555360 |
|
TkA03G555630
Chr03:140659210-140659632 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010922
Chr02:155216857-155217279 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G555630 |
|
TkA03G555680
Chr03:140664679-140665056 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_010923
Chr02:155225016-155225264 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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87.400 查询 89.643 / 对象 53.479 |
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48.600 查询 88.976 / 对象 90.781 |
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100.000 查询 87.500 / 对象 61.947 |
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96.000 查询 93.985 / 对象 28.539 |
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64.100 查询 100.000 / 对象 99.733 |
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100.000 查询 96.667 / 对象 13.567 |
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JCVI_TKOH_00147 | TkA03G569960 |