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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 31 / 92 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA03G130830
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CM104800.1
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需复核
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需复核
100.000
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需复核
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CM104799.1
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需复核
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TkA03G134210
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需复核
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TkA03G135760
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需复核
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TkA03G136810
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需复核
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TkA03G136900
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需复核
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TkA03G136950
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需复核
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TkA03G138180
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需复核
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TkA03G139530
TkA03G139910
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需复核
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TkA03G139910
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CM104800.1
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需复核
92.800
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需复核
80.600
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需复核
100.000
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需复核
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CM104800.1
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需复核
77.600
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需复核
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需复核
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
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需复核
77.400
查询 100.000 / 对象 100.000
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需复核
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TkA03G147270
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需复核
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需复核
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TkA03G149010
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需复核
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TkA03G149640
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需复核
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CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
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JCVI_TKOH_00131 TkA03G149930
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
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JCVI_TKOH_00132 TkA03G151630
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CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
85.100
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JCVI_TKOH_00132 TkA03G155910
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
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TkA03G158850
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注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
96.200
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TkA03G159050
TkA03G159210
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CM104805.1
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需复核
64.200
查询 47.682 / 对象 63.333
TkA03G159210
TkA03G161310
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
79.200
查询 73.267 / 对象 65.254
TkA03G161310
TkA03G162310
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
93.200
查询 81.667 / 对象 48.675
JCVI_TKOH_00132 TkA03G162310
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注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
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查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00132 TkA03G162630
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
100.000
查询 100.000 / 对象 20.259
JCVI_TKOH_00132 TkA03G163120
TkA03G163140
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LXL04_007384
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
96.600
查询 100.000 / 对象 57.112
JCVI_TKOH_00132 TkA03G163140
TkA03G163880
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CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
70.500
查询 54.545 / 对象 46.707
TkA03G163880
TkA03G164130
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CM104800.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
96.100
查询 89.912 / 对象 35.875
TkA03G164130
TkA03G165680
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Chr04:56349400-56350348 (-)
CM104802.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
64.000
查询 98.477 / 对象 72.157
TkA03G165680
TkA03G165800
Chr03:42015316-42015915 (+)
GWHBCHF00000004
LXL04_007408
Chr02:46897710-46903580 (+)
CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
100.000
查询 97.531 / 对象 69.298
JCVI_TKOH_00132 TkA03G165800
TkA03G166130
Chr03:42104088-42106351 (-)
GWHBCHF00000004
LXL04_000051
Chr01:1222338-1223395 (+)
CM104799.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
TkA03G166130
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CM104802.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
70.600
查询 47.222 / 对象 46.364
TkA03G166660
TkA03G167950
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Chr02:47268013-47268255 (+)
CM104800.1
注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
需复核
95.000
查询 62.992 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00132 TkA03G167950
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CM104804.1
注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
需复核
95.700
查询 20.231 / 对象 86.420
TkA03G168640
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
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注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
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注释冲突 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值
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注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
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注释冲突 序列支持,但注释或基因模型存在冲突
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