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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G155910
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 39528928-39538583 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1339 bp · TkA03G155910|TK1151|cDNA

TCGTCTTTCTTATATTTTTGGTTGAAAATTCTTGGATTATTATTTTTTGTAAGTAATATGTATACAAGAAAAACCTATATATTTAGATTTTGGGTTCCATTATGTTAAAGTAAAAATAGTTAATTACGTATTTGCATCTACAAATAGCCTATTAATTGTGAACACCATGCAACTTCATTAAAAGAAAAAGGGGCGCCATGGTTGCACTACTTAGCTCACTGCTCATATTCTCATTCTGCTTCTATCTTGGAACTCCATTA...

CDS

下载 CDS FASTA

945 bp · TkA03G155910|TK1151|CDS

ATGGTTGCACTACTTAGCTCACTGCTCATATTCTCATTCTGCTTCTATCTTGGAACTCCATTAAGCTCCAACTACTATCAGAAAACATGCCCAAATGCAGAATCACTCATCAAGAAAACTGTAACCGATGCCACCAGAAATGACAAAACAGCCCCTGCCGGACTCCTTCGAATGCACTTCCATGACTGTTTCATAAGGGGTTGTGATGGCTCCATACTTTTGCATTCGAAGGGTAAGAACACTGCGGAAAAAGACGGACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

314 aa · TkA03G155910|TK1151|PROTEIN

MVALLSSLLIFSFCFYLGTPLSSNYYQKTCPNAESLIKKTVTDATRNDKTAPAGLLRMHFHDCFIRGCDGSILLHSKGKNTAEKDGPPNVSLHAFYVIDEAKKAVESVCPGVVSCADILALAARDAVVLAGGPFWDVPKGRKDGRISKASDTTQLPPPTFNIAQLQQSFSQRGLSLEDLVALSGGHTLGFSHCSSFSNKIHNFNSTIDIDPSLQSSFASNLRRVCPLKNNAKNAGVTMNPSSTSFDNTYYKLIFKHKVLF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G155910
TK1151 IDTkA03G155910
OH-1004 IDLXL04_007319
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)85.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 96.037
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G155910
位置Chr03:39528928-39538583 (-)
描述Similar to PER64: Peroxidase 64
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g42180 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At5g51890 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At1g05260 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At3g21770 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
At4g33420 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0499300 去除 H(2)O(2)，氧化有毒还原剂，木质素的生物合成与降解，角质化，生长素分解，对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007319 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009269 response to desiccation 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程
GO:0042744 hydrogen peroxide catabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05260
ath:AT3G21770
ath:AT5G42180
ath:AT5G51890
dosa:Os05g0499300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.451
排名 1 · TkA03G155910 · TK1151
溶酶体／液泡0.187
排名 2 · TkA03G155910 · TK1151
细胞质0.116
排名 3 · TkA03G155910 · TK1151
细胞膜0.115
排名 4 · TkA03G155910 · TK1151
内质网0.083
排名 5 · TkA03G155910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00141peroxidase38-281 aa
PF03823Neurokinin_B143-192 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G155910PF00141peroxidase382814.7e-81272.8
TkA03G155910PF03823Neurokinin_B1431920.2212.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q43872拟南芥sp|Q43872|PER64_ARATH Peroxidase 6465.600%Swiss-Prot高置信
Q9LT91拟南芥sp|Q9LT91|PER66_ARATH Peroxidase 6654.200%Swiss-Prot高置信
O23044拟南芥sp|O23044|PER3_ARATH Peroxidase 347.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LSY7拟南芥sp|Q9LSY7|PER30_ARATH Peroxidase 3048.100%Swiss-Prot中等置信
Q9SZB9拟南芥sp|Q9SZB9|PER47_ARATH Peroxidase 4754.200%Swiss-Prot高置信
P37834水稻sp|P37834|PER1_ORYSJ Peroxidase 147.200%Swiss-Prot中等置信

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