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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG090170
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 25598509-25603117 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

3401 bp · TkAUNG090170|TK1151|cDNA

GATATTTGATTTTATTGTCGGCCATTACATGACTACAAACCTCCAATATTATCCATGGAAATGAAACTACCTTTGCAAATTCTGATCATTCATCTTATCATCTACATCTTCTTTATCGATAATTATGTCAGCTGCTATGGGCGATGGCAACGAATCTCGACCCTTCACCTCCTCCTCCATAGAATGCCATGCCTATGAATATCCTGAGATTCTCATAGCAACCAATAACTTTGACCAATCATTAGTAATTGGGGAAGGAG...

3162 bp · TkAUNG090170|TK1151|CDS

ATGTCAGCTGCTATGGGCGATGGCAACGAATCTCGACCCTTCACCTCCTCCTCCATAGAATGCCATGCCTATGAATATCCTGAGATTCTCATAGCAACCAATAACTTTGACCAATCATTAGTAATTGGGGAAGGAGGGTTTGGAATAGTTTACAAAGGTGAGTTTGTCAACGAATCAGGTGTTTTGGTTGCTGCCATTAAACGGTTGATCAATTCTGAGGTCACGCAAGCAGATTCTCAGTTCTGGGCGGAAGTTGAGAC...

1053 aa · TkAUNG090170|TK1151|PROTEIN

MSAAMGDGNESRPFTSSSIECHAYEYPEILIATNNFDQSLVIGEGGFGIVYKGEFVNESGVLVAAIKRLINSEVTQADSQFWAEVETLSKLRHCNLVPLIGYCSYGREMILVYQYMPNGTLEDNLHKLGTYISWRDRLQICLDAARGLDYLHTGTGIDVGIMHRDVKSSNILLDESWGAKISDFGLSILGPTDQPLNFVNAPVPITRGYVDLDYYYSGMLTSKCDVYNFGVVLLEVVCRKCALDSSLGEEQCVLVTWAQD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG090170
TK1151 IDTkAUNG090170
OH-1004 IDLXL04_026027
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG090170
位置ChrUn:25598509-25603117 (+)
描述Similar to At5g61350: Probable receptor-like protein kinase At5g61350
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g61350 可能的受体样蛋白激酶 At5g61350。 暂无已核实直接文献
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位,参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
At5g54380 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶,主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
At5g02290 可能在植物生长和发育的调节中发挥作用(可能)。 暂无已核实直接文献
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_026027 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0051924 regulation of calcium ion transport 生物过程
GO:0080147 root hair cell development 生物过程
GO:0097275 intracellular ammonium homeostasis 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G02290
ath:AT5G61350
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.517
排名 1 · TkAUNG090170 · TK1151
细胞质0.386
排名 2 · TkAUNG090170 · TK1151
细胞核0.225
排名 3 · TkAUNG090170 · TK1151
内质网0.045
排名 4 · TkAUNG090170 · TK1151
高尔基体0.043
排名 5 · TkAUNG090170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase40-309 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr41-310 aa
PF01636APH86-177 aa
PF17667Pkinase_fungal143-176 aa
PF03109ABC1155-187 aa
PF14531Kinase-like158-186 aa
PF03109ABC1270-301 aa
PF14531Kinase-like298-328 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG090170PF00069Pkinase403092.5e-119398.2
TkAUNG090170PF07714PK_Tyr_Ser-Thr413108.3e-127422.5
TkAUNG090170PF01636APH861770.0003621.1
TkAUNG090170PF17667Pkinase_fungal1431760.1611.3
TkAUNG090170PF03109ABC11551872.5e-0524.3
TkAUNG090170PF14531Kinase-like1581860.00218.2
TkAUNG090170PF03109ABC12703012.5e-0524.3
TkAUNG090170PF14531Kinase-like2983280.00218.2
TkAUNG090170PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3685178.3e-127422.5
TkAUNG090170PF00069Pkinase3685282.5e-119398.2
TkAUNG090170PF03109ABC13693912.5e-0524.3
TkAUNG090170PF03109ABC14855272.5e-0524.3
TkAUNG090170PF01636APH4855000.0003621.1
TkAUNG090170PF17667Pkinase_fungal4855020.1611.3
TkAUNG090170PF00069Pkinase5286692.5e-119398.2
TkAUNG090170PF07714PK_Tyr_Ser-Thr5306718.3e-127422.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLJ8拟南芥sp|Q9FLJ8|Y5613_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g6135043.600%Swiss-Prot低置信
Q9SCZ4拟南芥sp|Q9SCZ4|FERON_ARATH Receptor-like protein kinase FERONIA42.800%Swiss-Prot低置信
Q9LK35拟南芥sp|Q9LK35|THE1_ARATH Receptor-like protein kinase THESEUS 144.700%Swiss-Prot低置信
P43293拟南芥sp|P43293|PBL11_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL1142.800%Swiss-Prot低置信
Q9FID8拟南芥sp|Q9FID8|Y5900_ARATH Putative receptor-like protein kinase At5g3900045.800%Swiss-Prot低置信

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