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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG080900
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 23056258-23060141 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1006 bp · TkAUNG080900|TK1151|cDNA

ATATTCGACATTTTATTGACACCGGATCTATGGAAAAAGTCTGCAAATGTCCCGGCTCTTGTCCGTTTGCTTCAGTCGTTTCTCCAACAGGCGCCCAATGAGCTTAACAGAGAAGGGAGGTTAAGACTTGTGCTTGGGATATTCAACAAGCTTGTGTCGTCACCCAGTACAGAAGAACAGGGGTTTCATATTCTGAACCCAATCATTGAGAACCTTGGGTATGACGTGATGGCGGAATACATGAACCACATCTGGGCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2913 bp · TkAUNG080900|TK1151|CDS

ATGGAGTGGAATCAACAAACCCTACAGTTTCTTTCGCAATCTTTCCTCGATACACTTTCCCCTCATCCAGAACCCCGTCGCCGTGCTGAAAAGAATTTATCCGACGCCGCAGATACTCCTAACTACGGCCTTGCCGTTCTCCGTCTCGTTGCTGAACCTTCCGTGGATGAGCAGATCCGCCAATGCGCCGCTGTTAACTTCAAGAATCATCTTAAAACCCGGTGGGTGCCCTCATCTGCTAACCCTATTCCCGATGGTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

970 aa · TkAUNG080900|TK1151|PROTEIN

MEWNQQTLQFLSQSFLDTLSPHPEPRRRAEKNLSDAADTPNYGLAVLRLVAEPSVDEQIRQCAAVNFKNHLKTRWVPSSANPIPDGEKEQIKTLIVPLMLSATSRIQAQLSEALAVIGNHDFPKLWPALLPELRSSLETAINANDFASLNGILATVNSLFKKFRYQFKSDPILLDLKYCLDNFAAPLLSTVESISGKINEAAGSAATLRQLIEAQRLCFRIFYSLNFLDLPEFFEDTADKWMNEFKNYLTVRYPALEDAG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG080900
TK1151 IDTkAUNG080900
OH-1004 IDLXL04_026637
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.175 / OH-1004 89.405
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG080900
位置ChrUn:23056258-23060141 (-)
描述Similar to CAS: Exportin-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g46520 importin α 的输出受体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026637 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006606 protein import into nucleus 生物过程
GO:0006611 protein export from nucleus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0070062 extracellular exosome 细胞组分
GO:0005049 nuclear export signal receptor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G46520
bta:518622
hsa:1434
mmu:110750
xla:444464
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.736
排名 1 · TkAUNG080900 · TK1151
细胞质0.596
排名 2 · TkAUNG080900 · TK1151
内质网0.024
排名 3 · TkAUNG080900 · TK1151
线粒体0.024
排名 4 · TkAUNG080900 · TK1151
细胞膜0.023
排名 5 · TkAUNG080900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03378CAS_CSE16-49 aa
PF03810IBN_N29-101 aa
PF08389Xpo1106-142 aa
PF12460MMS19_C125-190 aa
PF08506Cse1159-525 aa
PF03810IBN_N245-280 aa
PF30709DUF1839_C268-292 aa
PF12460MMS19_C281-325 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG080900PF03378CAS_CSE16498.1e-151503.1
TkAUNG080900PF03810IBN_N291018.2e-1555.3
TkAUNG080900PF08389Xpo11061420.0614.1
TkAUNG080900PF12460MMS19_C1251900.009415.7
TkAUNG080900PF08506Cse11595251.2e-125420.0
TkAUNG080900PF03810IBN_N2452808.2e-1555.3
TkAUNG080900PF30709DUF1839_C2682920.05314.3
TkAUNG080900PF12460MMS19_C2813250.009415.7
TkAUNG080900PF03378CAS_CSE12913488.1e-151503.1
TkAUNG080900PF30709DUF1839_C5025190.05314.3
TkAUNG080900PF03378CAS_CSE15269608.1e-151503.1
TkAUNG080900PF08389Xpo15556040.0614.1
TkAUNG080900PF12460MMS19_C5886550.009415.7
TkAUNG080900PF30709DUF1839_C6196710.05314.3
TkAUNG080900PF08389Xpo17007390.0614.1
TkAUNG080900PF12460MMS19_C7047440.009415.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZPY7拟南芥sp|Q9ZPY7|XPO2_ARATH Exportin-265.700%Swiss-Prot高置信

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