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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG073280
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 21148917-21150079 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1077 bp · TkAUNG073280|TK1151|cDNA

ATGTCCGGTGGCAGTGGCAGCGGCGGTGGCGGTGGCGTTAGTGGTGGTGGTCCATCACTCATGGACTCTCTCTTCCAACGCACCCTCGACGACCTAATCAAAGGCATCCGTCTCCATACTCCCGGCGCCGCCCAATCCACCTTCATCTCAAAATCGCTCGACGAGATCCGCCGCGAAATCAAATCCACGGACTTACAAACCAAATCTACTGCCCTCCAGAAACTCACTTACCTCCACTCCCTCCACGGCATCGACATGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1077 bp · TkAUNG073280|TK1151|CDS

ATGTCCGGTGGCAGTGGCAGCGGCGGTGGCGGTGGCGTTAGTGGTGGTGGTCCATCACTCATGGACTCTCTCTTCCAACGCACCCTCGACGACCTAATCAAAGGCATCCGTCTCCATACTCCCGGCGCCGCCCAATCCACCTTCATCTCAAAATCGCTCGACGAGATCCGCCGCGAAATCAAATCCACGGACTTACAAACCAAATCTACTGCCCTCCAGAAACTCACTTACCTCCACTCCCTCCACGGCATCGACATGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

358 aa · TkAUNG073280|TK1151|PROTEIN

MSGGSGSGGGGGVSGGGPSLMDSLFQRTLDDLIKGIRLHTPGAAQSTFISKSLDEIRREIKSTDLQTKSTALQKLTYLHSLHGIDMSWAAFHAVELTSSPSFAHKKTGYLAASLSFRPSTEVLLLLTNQLRKDLSSTNQHEVSLALECLAVICTPDFARDLTPDIFTLLASSKIENLESTDNAQTLAATVGVFCELASKEPRSYLPLAPEFYRILVDSRNNWVLIKVLKIFSKLAKLEPRLAKKVVEPICDHMKRSEAKS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG073280
TK1151 IDTkAUNG073280
OH-1004 IDLXL04_020198
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)92.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 43.386
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG073280
位置ChrUn:21148917-21150079 (-)
描述Similar to DELTA-ADR: AP-3 complex subunit delta
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g48760 AP-3 复合体的一部分，是一种与接头相关的复合体，似乎与网格蛋白相关。
The AP-3 adaptor complex is required for vacuolar function in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1038/cr.2011.99

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020198 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006605 protein targeting 生物过程
GO:0006623 protein targeting to vacuole 生物过程
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0006896 Golgi to vacuole transport 生物过程
GO:0006903 vesicle targeting 生物过程
GO:0007032 endosome organization 生物过程
GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0019882 antigen processing and presentation 生物过程
GO:0032438 melanosome organization 生物过程
GO:0035646 endosome to melanosome transport 生物过程
GO:0035654 clathrin-coated vesicle cargo loading, AP-3-mediated 生物过程
GO:0048007 antigen processing and presentation, exogenous lipid antigen via MHC class Ib 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48760
bta:281023
ddi:DDB_G0279537
hsa:8943
mmu:11776
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.511
排名 1 · TkAUNG073280 · TK1151
高尔基体0.347
排名 2 · TkAUNG073280 · TK1151
细胞核0.185
排名 3 · TkAUNG073280 · TK1151
溶酶体／液泡0.118
排名 4 · TkAUNG073280 · TK1151
内质网0.096
排名 5 · TkAUNG073280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01602Adaptin_N47-172 aa
PF12717Cnd148-79 aa
PF11698V-ATPase_H_C54-68 aa
PF29232HEAT_spiro59-73 aa
PF26017BACK_BTBD872-107 aa
PF01602Adaptin_N175-356 aa
PF12717Cnd1179-269 aa
PF03081Exo70_C194-286 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG073280PF01602Adaptin_N471722e-60205.6
TkAUNG073280PF12717Cnd148790.0005920.6
TkAUNG073280PF11698V-ATPase_H_C54680.2912.0
TkAUNG073280PF29232HEAT_spiro59730.02214.4
TkAUNG073280PF26017BACK_BTBD8721070.2112.7
TkAUNG073280PF01602Adaptin_N1753562e-60205.6
TkAUNG073280PF12717Cnd11792690.0005920.6
TkAUNG073280PF03081Exo70_C1942860.09112.5
TkAUNG073280PF29232HEAT_spiro2072670.02214.4
TkAUNG073280PF26017BACK_BTBD82222690.2112.7
TkAUNG073280PF29232HEAT_spiro2833460.02214.4
TkAUNG073280PF11698V-ATPase_H_C3143480.2912.0
TkAUNG073280PF03081Exo70_C3223570.09112.5
TkAUNG073280PF12717Cnd13233520.0005920.6
TkAUNG073280PF26017BACK_BTBD83263550.2112.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C744拟南芥sp|Q9C744|AP3D_ARATH AP-3 complex subunit delta62.100%Swiss-Prot高置信

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