TkAUNG067050 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG067050

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 19459415-19460526 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

585 bp · TkAUNG067050|TK1151|cDNA

ATGGAGAAATTCCGACAACCCTTGATGGGCCGTTTGATCCTGTTACTGTTTCATTGGATGAGAGCTTTAGAGGGCATGCAAATAGATTTGCCTGACGATGATCCTAGAGTGCAAAGAAACGTCACTGGTTTTGAGCCTGACCAATTTTCAGTTTCCCTTTCTTCTACTTATGATTCTGTATGGATTTCTTGGATTACAGGGGATTTTCAAATTGGTAATAATATAAAGCCACTGAATCCGAAAACTGTTGCAAGTGTGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

585 bp · TkAUNG067050|TK1151|CDS

ATGGAGAAATTCCGACAACCCTTGATGGGCCGTTTGATCCTGTTACTGTTTCATTGGATGAGAGCTTTAGAGGGCATGCAAATAGATTTGCCTGACGATGATCCTAGAGTGCAAAGAAACGTCACTGGTTTTGAGCCTGACCAATTTTCAGTTTCCCTTTCTTCTACTTATGATTCTGTATGGATTTCTTGGATTACAGGGGATTTTCAAATTGGTAATAATATAAAGCCACTGAATCCGAAAACTGTTGCAAGTGTGGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

194 aa · TkAUNG067050|TK1151|PROTEIN

MEKFRQPLMGRLILLLFHWMRALEGMQIDLPDDDPRVQRNVTGFEPDQFSVSLSSTYDSVWISWITGDFQIGNNIKPLNPKTVASVVYYGKFRFPMFYKATGQSLIYTQLYPFEGLQNYTSGIIHHVRLTGLEPHTVYYYRCGDPSIKAMSDIYYFKTMPVSTSKSYPKNSCYRRPRPHVQLHFNNQAFDNQQT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG067050`
TK1151 ID	TkAUNG067050
OH-1004 ID	LXL04_004042
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	68.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 76.289 / OH-1004 26.930 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG067050

位置 ChrUn:19459415-19460526 (+)

描述 Similar to PAP15: Purple acid phosphatase 15

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g07130`	对磷酸对硝基苯酯（pNPP）、D-肌醇1-磷酸（Ins(1)P1）、植酸和肌醇六磷酸具有酸性磷酸酶活性。	An Arabidopsis purple acid phosphatase with phytase activity increases foliar ascorbate.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.109934
`At2g32770`	紫酸性磷酸酶 13。	暂无已核实直接文献
`At4g13700`	具有ATP、ADP、dATP、焦磷酸盐、多磷酸盐、磷酸丝氨酸和磷酸苏氨酸的酸性磷酸酶活性。	Expression patterns of purple acid phosphatase genes in Arabidopsis organs and functional analysis of AtPAP23 predominantly transcribed in flower.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-0183-0

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004042 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009845 seed germination 生物过程

GO:0009846 pollen germination 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0003993 acid phosphatase activity 分子功能

GO:0008707 inositol hexakisphosphate 4-phosphatase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G32770

ath:AT3G07130

ath:AT3G52810

ath:AT3G52820

ath:AT4G13700

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.358

排名 1 · TkAUNG067050 · TK1151

细胞外0.239

排名 2 · TkAUNG067050 · TK1151

细胞质0.183

排名 3 · TkAUNG067050 · TK1151

细胞膜0.151

排名 4 · TkAUNG067050 · TK1151

内质网0.140

排名 5 · TkAUNG067050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16655PhoD_N25-48 aa

PF16656Pur_ac_phosph_N46-158 aa

PF16655PhoD_N121-160 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG067050	`PF16655`	PhoD_N	25	48	0.0029	18.5
TkAUNG067050	`PF16656`	Pur_ac_phosph_N	46	158	2.9e-16	60.5
TkAUNG067050	`PF16655`	PhoD_N	121	160	0.0029	18.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SFU3`	拟南芥	sp\|Q9SFU3\|PPA15_ARATH Purple acid phosphatase 15	63.900%	Swiss-Prot	高置信
`O48840`	拟南芥	sp\|O48840\|PPA13_ARATH Purple acid phosphatase 13	53.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q6TPH1`	拟南芥	sp\|Q6TPH1\|PPA23_ARATH Purple acid phosphatase 23	51.100%	Swiss-Prot	高置信

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