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基因概览

TkAUNG064000

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 18502715-18505207 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1659 bp · TkAUNG064000|TK1151|cDNA

ATGGTGGCGAAAGATTATCAAAAAGTAAAAGCATCAAGTAAAGCTGAGGTGGGAGAAATTGATACCAGTGCACCCTTCCAATCTGTCAAAGATGCTGTTAGCTTATTTGGTGAAGGTTCATTTCAGGGGAAAAGCCAGCCATTAGAAAGCCTAAAGCACATTCTACAGAAGGCACTGGCAAAAGAGACACAGCTTCACTTAACCCAGAAAGAGTTGAATAAGTTGAAGGAACAATTGAAAAATGCTGAGACCACTAAAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1659 bp · TkAUNG064000|TK1151|CDS

ATGGTGGCGAAAGATTATCAAAAAGTAAAAGCATCAAGTAAAGCTGAGGTGGGAGAAATTGATACCAGTGCACCCTTCCAATCTGTCAAAGATGCTGTTAGCTTATTTGGTGAAGGTTCATTTCAGGGGAAAAGCCAGCCATTAGAAAGCCTAAAGCACATTCTACAGAAGGCACTGGCAAAAGAGACACAGCTTCACTTAACCCAGAAAGAGTTGAATAAGTTGAAGGAACAATTGAAAAATGCTGAGACCACTAAAGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

552 aa · TkAUNG064000|TK1151|PROTEIN

MVAKDYQKVKASSKAEVGEIDTSAPFQSVKDAVSLFGEGSFQGKSQPLESLKHILQKALAKETQLHLTQKELNKLKEQLKNAETTKAQALSELEKAKQTVEDLSQKLNIINESKDSAIRATEVAKHQANQFAEASDNDSDAMNESLNMDLESTRAQCLDAAIELDAAKQELRQIRQEYDSSMEAKDSIQQVKLANVQSKEEETKIYEEKGNEKQLYKLKLEEAAKKLLALRKDMNPELTKNLEAQLSETLSEVEALRKES...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG064000`
TK1151 ID	TkAUNG064000
OH-1004 ID	LXL04_016143
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	35.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.819 / OH-1004 94.659 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG064000

位置 ChrUn:18502715-18505207 (-)

描述 Similar to At5g55860: WEB family protein At5g55860

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g55860`	WEB 家族蛋白 At5g55860。	暂无已核实直接文献
`At1g12150`	WEB家族蛋白At1g12150。	暂无已核实直接文献
`At4g17210`	推测的 WEB 家族蛋白 At4g17210。	暂无已核实直接文献
`At3g13190`	WEB 家族蛋白 At3g13190。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016143 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009903 chloroplast avoidance movement 生物过程

GO:0009904 chloroplast accumulation movement 生物过程

GO:0071260 cellular response to mechanical stimulus 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G12150

ath:AT2G26570

ath:AT4G17210

ath:AT4G33390

ath:AT5G55860

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.530

排名 1 · TkAUNG064000 · TK1151

细胞膜0.332

排名 2 · TkAUNG064000 · TK1151

细胞核0.264

排名 3 · TkAUNG064000 · TK1151

内质网0.051

排名 4 · TkAUNG064000 · TK1151

质体0.050

排名 5 · TkAUNG064000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05701WEMBL19-205 aa

PF24161CCDC3951-312 aa

PF26095CC_Bre151-110 aa

PF24423OVT162-133 aa

PF15294Leu_zip65-173 aa

PF24423OVT1112-196 aa

PF26095CC_Bre1129-182 aa

PF24423OVT1140-190 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG064000	`PF05701`	WEMBL	19	205	1.5e-33	117.1
TkAUNG064000	`PF24161`	CCDC39	51	312	0.89	8.0
TkAUNG064000	`PF26095`	CC_Bre1	51	110	7.6	7.6
TkAUNG064000	`PF24423`	OVT1	62	133	0.026	15.6
TkAUNG064000	`PF15294`	Leu_zip	65	173	0.0045	17.3
TkAUNG064000	`PF24423`	OVT1	112	196	0.026	15.6
TkAUNG064000	`PF26095`	CC_Bre1	129	182	7.6	7.6
TkAUNG064000	`PF24423`	OVT1	140	190	0.026	15.6
TkAUNG064000	`PF15294`	Leu_zip	197	281	0.0045	17.3
TkAUNG064000	`PF05701`	WEMBL	216	438	1.5e-33	117.1
TkAUNG064000	`PF26095`	CC_Bre1	226	307	7.6	7.6
TkAUNG064000	`PF24423`	OVT1	240	307	0.026	15.6
TkAUNG064000	`PF15294`	Leu_zip	272	384	0.0045	17.3
TkAUNG064000	`PF15294`	Leu_zip	299	447	0.0045	17.3
TkAUNG064000	`PF26095`	CC_Bre1	320	394	7.6	7.6
TkAUNG064000	`PF24423`	OVT1	333	388	0.026	15.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LVQ4`	拟南芥	sp\|Q9LVQ4\|Y5586_ARATH WEB family protein At5g55860	39.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FWW5`	拟南芥	sp\|Q9FWW5\|Y1215_ARATH WEB family protein At1g12150	40.100%	Swiss-Prot	中等置信
`O23564`	拟南芥	sp\|O23564\|Y4721_ARATH Putative WEB family protein At4g17210	30.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LK53`	拟南芥	sp\|Q9LK53\|Y3319_ARATH WEB family protein At3g13190	28.200%	Swiss-Prot	低置信

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