TkAUNG063890 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG063890

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 18444837-18453115 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2757 bp · TkAUNG063890|TK1151|cDNA

ATGGAAATGGATTGGCATCAAGCACTTCGAGTTCGAAGTGCGCATACATTGCTGGATGTGTGGTGGTACTATACGATGTTCTTTCAGGCACTCAATCGCACCTCATTTCGCCAAATCCAGTTCCTAACCTTTGAGCTGTGTCGTTTTATCCTACGACGCAAGTATTGTTGCAGCAGGGGAGTCAGGGCATCAACCTGCAGTACTAGTATGGGATTGCGCCACTTAGACTTTATATGTGAGCTCAAATGCCACTCATATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

2757 bp · TkAUNG063890|TK1151|CDS

ATGGAAATGGATTGGCATCAAGCACTTCGAGTTCGAAGTGCGCATACATTGCTGGATGTGTGGTGGTACTATACGATGTTCTTTCAGGCACTCAATCGCACCTCATTTCGCCAAATCCAGTTCCTAACCTTTGAGCTGTGTCGTTTTATCCTACGACGCAAGTATTGTTGCAGCAGGGGAGTCAGGGCATCAACCTGCAGTACTAGTATGGGATTGCGCCACTTAGACTTTATATGTGAGCTCAAATGCCACTCATATGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

918 aa · TkAUNG063890|TK1151|PROTEIN

MEMDWHQALRVRSAHTLLDVWWYYTMFFQALNRTSFRQIQFLTFELCRFILRRKYCCSRGVRASTCSTSMGLRHLDFICELKCHSYGVACMALSADVSFPVASFEFSLDNKFIITAEKNQLKFWKVRWPPGRRANTRSVSLTMLRKVDIGPKESSIVAVTSARWISGTLCVVYPGSSVIKTVELEVEKCFAISTSTSLIACACNNGLVKLFGTNSLEYAGGLCYVETNRCKETNVVHYQGEPDQVEHQSSLPDAIALTES...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG063890`
TK1151 ID	TkAUNG063890
OH-1004 ID	LXL04_019125
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	33.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 69.063 / OH-1004 77.789 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkAUNG063890`
位置	ChrUn:18444837-18453115 (+)
描述	Similar to Mapkbp1: Mitogen-activated protein kinase-binding protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_019125` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程 GO:0007099 centriole replication 生物过程 GO:0032717 negative regulation of interleukin-8 production 生物过程 GO:0043124 negative regulation of canonical NF-kappaB signal transduction 生物过程 GO:0046330 positive regulation of JNK cascade 生物过程 GO:0046605 regulation of centrosome cycle 生物过程 GO:0097150 neuronal stem cell population maintenance 生物过程 GO:1900425 negative regulation of defense response to bacterium 生物过程 GO:0000922 spindle pole 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分 GO:0005730 nucleolus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	hsa:23005 hsa:284403 mmu:26390 ssc:100144885 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.528

排名 1 · TkAUNG063890 · TK1151

细胞质0.346

排名 2 · TkAUNG063890 · TK1151

细胞膜0.114

排名 3 · TkAUNG063890 · TK1151

内质网0.073

排名 4 · TkAUNG063890 · TK1151

高尔基体0.067

排名 5 · TkAUNG063890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24780WD40_MABP1-WDR62_1st77-99 aa

PF00400WD4079-124 aa

PF25047Beta-prop_TEP1_2nd80-97 aa

PF25175Beta-prop_WDR588-126 aa

PF25173Beta-prop_WDR3_1st90-126 aa

PF24780WD40_MABP1-WDR62_1st95-284 aa

PF24796WDR5597-127 aa

PF25172Beta-prop_WDR3_2nd99-125 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG063890	`PF24780`	WD40_MABP1-WDR62_1st	77	99	7e-15	55.9
TkAUNG063890	`PF00400`	WD40	79	124	8.4e-13	48.9
TkAUNG063890	`PF25047`	Beta-prop_TEP1_2nd	80	97	8.4e-05	22.6
TkAUNG063890	`PF25175`	Beta-prop_WDR5	88	126	1.6e-12	48.0
TkAUNG063890	`PF25173`	Beta-prop_WDR3_1st	90	126	3.3e-15	57.0
TkAUNG063890	`PF24780`	WD40_MABP1-WDR62_1st	95	284	7e-15	55.9
TkAUNG063890	`PF24796`	WDR55	97	127	6.8e-05	22.8
TkAUNG063890	`PF25172`	Beta-prop_WDR3_2nd	99	125	1.1e-07	32.2
TkAUNG063890	`PF23381`	Beta-prop_IFT122_1st	101	126	3.3e-12	47.1
TkAUNG063890	`PF23393`	Beta-prop_WDR90_POC16_2nd	101	161	2.3e-07	31.0
TkAUNG063890	`PF23342`	WDR90_beta-prop_4th	102	120	0.0039	17.1
TkAUNG063890	`PF25174`	Beta-prop_THOC3	103	216	1.6e-13	51.0
TkAUNG063890	`PF23409`	Beta-prop_EML	104	127	9.1e-05	22.8
TkAUNG063890	`PF24805`	EIF3I	108	174	0.036	13.9
TkAUNG063890	`PF25168`	Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd	110	161	1.2e-08	35.3
TkAUNG063890	`PF23414`	Beta-prop_EML_2	117	215	2.7e-10	40.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

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