TkAUNG063060 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG063060

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 18223482-18226171 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1854 bp · TkAUNG063060|TK1151|cDNA

TAGAGGTATACGTATTGCTCAATAATTGGCTGTTTTAACATCCCGCAAGAACCTTAGCACATATCTTACACATAAAGTCATAAACACCACAACGAACACGCAGACGCATTACACAATTCATCCCAAATTCCAGATTCACATATACATGCATCTGGCGTATACATATATATATTCCACAAATACGAACTGTAAATCTGAAATGAGACGATGAAGGTATTGAAGACGGTCTCGGTTATGGATTTGGTAGCATGGAGACGGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1470 bp · TkAUNG063060|TK1151|CDS

ATGAAGGTATTGAAGACGGTCTCGGTTATGGATTTGGTAGCATGGAGACGGTTAGTGTCTGTATTCATCCTCCAGGTCGTCTTCTCTCTTCAGCCACTCGTTTACGCCCTAGATGGGAACACAGGGGATGCTGTTGAATTGTTTGAGAGAGCTTCGCGTAATATGGAAGTGAAACGTTATAATGATGCAATTGATGATCTTAACGCTGCAATAGAAGCTGATCCGTTACTATCTGAAGCATACTGGAGTCGAGCTTTAGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

489 aa · TkAUNG063060|TK1151|PROTEIN

MKVLKTVSVMDLVAWRRLVSVFILQVVFSLQPLVYALDGNTGDAVELFERASRNMEVKRYNDAIDDLNAAIEADPLLSEAYWSRALVLRHLCRYKESEESYKKFLQMKPQNSAVEKELSQLHQAQSALDTATNLFEHNDYTKALDFIDKVVLVFSPACSQAKILKAKLLLAAKDYSGVISESGYMLKEDEDNLEALLLRGRAYYYLADHDVATRHYQKGLRLDPEHTELKKSYFGLKNLLKKTKSAEDNEKKGKLRVAVE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG063060`
TK1151 ID	TkAUNG063060
OH-1004 ID	LXL04_032682
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	89.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.182 / OH-1004 91.353 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG063060

位置 ChrUn:18223482-18226171 (-)

描述 Similar to P58IPK: DnaJ protein P58IPK homolog

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g03160`	在病毒症状发展中起重要的积极作用，并且是病毒增殖和发病所必需的。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0977200`	可能在内质网中参与蛋白质折叠。	Analysis of rice ER-resident J-proteins reveals diversity and functional differentiation of the ER-resident Hsp70 system in plants.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert312
`Os02g0195300`	可能在内质网中参与蛋白质折叠。	Analysis of rice ER-resident J-proteins reveals diversity and functional differentiation of the ER-resident Hsp70 system in plants.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert312

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032682 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006986 response to unfolded protein 生物过程

GO:0034975 protein folding in endoplasmic reticulum 生物过程

GO:0036494 positive regulation of translation initiation in response to endoplasmic reticulum stress 生物过程

GO:0044794 host-mediated activation of viral process 生物过程

GO:0070417 cellular response to cold 生物过程

GO:1903912 negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced eIF2 alpha phosphorylation 生物过程

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005788 endoplasmic reticulum lumen 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0004860 protein kinase inhibitor activity 分子功能

GO:0019901 protein kinase binding 分子功能

GO:0051087 protein-folding chaperone binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G03160

bta:286770

dosa:Os01g0977200

dosa:Os02g0195300

gga:418787

osa:4327812

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.410

排名 1 · TkAUNG063060 · TK1151

细胞质0.228

排名 2 · TkAUNG063060 · TK1151

线粒体0.137

排名 3 · TkAUNG063060 · TK1151

细胞核0.116

排名 4 · TkAUNG063060 · TK1151

过氧化物酶体0.110

排名 5 · TkAUNG063060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07719TPR_234-51 aa

PF00515TPR_134-51 aa

PF13424TPR_1234-55 aa

PF13176TPR_734-51 aa

PF13181TPR_835-51 aa

PF13428TPR_1435-52 aa

PF13174TPR_635-51 aa

PF14559TPR_1938-51 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG063060	`PF07719`	TPR_2	34	51	6.7e-26	88.9
TkAUNG063060	`PF00515`	TPR_1	34	51	2.9e-21	75.0
TkAUNG063060	`PF13424`	TPR_12	34	55	1.4e-06	29.1
TkAUNG063060	`PF13176`	TPR_7	34	51	0.0015	19.2
TkAUNG063060	`PF13181`	TPR_8	35	51	1.1e-14	53.9
TkAUNG063060	`PF13428`	TPR_14	35	52	6.5e-12	45.6
TkAUNG063060	`PF13174`	TPR_6	35	51	0.0052	18.1
TkAUNG063060	`PF14559`	TPR_19	38	51	7.9e-15	55.7
TkAUNG063060	`PF13432`	TPR_16	39	53	5.9e-15	56.1
TkAUNG063060	`PF14863`	Alkyl_sulf_dimr	42	106	4.9e-05	24.5
TkAUNG063060	`PF13371`	TPR_9	43	75	8.1e-11	42.5
TkAUNG063060	`PF07719`	TPR_2	46	75	6.7e-26	88.9
TkAUNG063060	`PF13428`	TPR_14	47	81	6.5e-12	45.6
TkAUNG063060	`PF24575`	TPR_Slam	48	77	0.00032	21.8
TkAUNG063060	`PF03704`	BTAD	49	106	9.3e-05	23.5
TkAUNG063060	`PF31234`	TPR_Psidin_N	54	137	0.0012	19.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LYW9`	拟南芥	sp\|Q9LYW9\|DNJ36_ARATH DnaJ protein P58IPK homolog	67.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q5JNB5`	水稻	sp\|Q5JNB5\|DJC15_ORYSJ DnaJ protein P58IPK homolog B	67.100%	Swiss-Prot	高置信
`A0A0P0VG31`	水稻	sp\|A0A0P0VG31\|DJC16_ORYSJ DnaJ protein P58IPK homolog A	66.100%	Swiss-Prot	高置信

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