RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG062560
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 18087613-18090312 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1725 bp · TkAUNG062560|TK1151|cDNA

TAGAGGTATACGTATTGCTCAATAATTGGCTGTTTTAACATCCCGCAAGAACCTTAGCACATATCTTACACATAAACACCACAACGAACACGCAGACGCATTACACAATTCATCCCAAATTCCAGATTCACATATACATGCATCTGGCGTATACATATATATTCCACAAATACGCACTGTAAATCTGAAATGAGACGATGAAGGTATTGAAGACGGTGTCGGTTATGGATTTGGTAGCATGGAGATGGTTTGTGTCTGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1467 bp · TkAUNG062560|TK1151|CDS

ATGAAGGTATTGAAGACGGTGTCGGTTATGGATTTGGTAGCATGGAGATGGTTTGTGTCTGTTTTCATCCTCCAGTTCGTCTTCGCTCTTCAACCACTCGTTTACTCCCTAGATGGGAACACAGGGGATGCTGTTGAATTGTTTGAGAGAGCTTCGCGTAATATGGAAATGAAACGTTATGATGATGCAATTGATGATCTTAACGCTGCAATAGAAGCTGATCCGTTACTATCTGAAGCATACTGGAGTCGAGCTTTAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

488 aa · TkAUNG062560|TK1151|PROTEIN

MKVLKTVSVMDLVAWRWFVSVFILQFVFALQPLVYSLDGNTGDAVELFERASRNMEMKRYDDAIDDLNAAIEADPLLSEAYWSRALVLRHLCRYKESEESYKKFLQMKPQNSAVEKELSQLHQAQSALDTATNLFEHSDYTKALDFIDKVVLVFSPACSQAKILKAKLLLAAKDYSGVISESGYMLKEDEDNLEALLLRGRAYYYLADHDVATRHYQKGLRLDPEHTELKKSYFGLKNLLKKTKSAEDNEKKGKLRVAVE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG062560
TK1151 IDTkAUNG062560
OH-1004 IDLXL04_032682
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.361 / OH-1004 90.226
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG062560
位置ChrUn:18087613-18090312 (+)
描述Similar to P58IPK: DnaJ protein P58IPK homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g03160 在病毒症状发展中起重要的积极作用，并且是病毒增殖和发病所必需的。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0977200 可能在内质网中参与蛋白质折叠。
Analysis of rice ER-resident J-proteins reveals diversity and functional differentiation of the ER-resident Hsp70 system in plants.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert312
Os02g0195300 可能在内质网中参与蛋白质折叠。
Analysis of rice ER-resident J-proteins reveals diversity and functional differentiation of the ER-resident Hsp70 system in plants.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert312
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032682 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006986 response to unfolded protein 生物过程
GO:0034975 protein folding in endoplasmic reticulum 生物过程
GO:0036494 positive regulation of translation initiation in response to endoplasmic reticulum stress 生物过程
GO:0044794 host-mediated activation of viral process 生物过程
GO:0070417 cellular response to cold 生物过程
GO:1903912 negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced eIF2 alpha phosphorylation 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005788 endoplasmic reticulum lumen 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0004860 protein kinase inhibitor activity 分子功能
GO:0019901 protein kinase binding 分子功能
GO:0051087 protein-folding chaperone binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G03160
bta:286770
dosa:Os01g0977200
dosa:Os02g0195300
gga:418787
osa:4327812
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.374
排名 1 · TkAUNG062560 · TK1151
细胞质0.243
排名 2 · TkAUNG062560 · TK1151
线粒体0.150
排名 3 · TkAUNG062560 · TK1151
细胞核0.132
排名 4 · TkAUNG062560 · TK1151
过氧化物酶体0.131
排名 5 · TkAUNG062560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07719TPR_234-51 aa
PF00515TPR_134-51 aa
PF13181TPR_834-51 aa
PF13424TPR_1234-56 aa
PF13176TPR_734-51 aa
PF13174TPR_635-51 aa
PF14559TPR_1938-51 aa
PF13428TPR_1438-51 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG062560PF07719TPR_234511.2e-2691.3
TkAUNG062560PF00515TPR_134511.4e-2382.4
TkAUNG062560PF13181TPR_834512.4e-1659.1
TkAUNG062560PF13424TPR_1234568.4e-0833.0
TkAUNG062560PF13176TPR_734510.0004420.8
TkAUNG062560PF13174TPR_635510.0005521.1
TkAUNG062560PF14559TPR_1938514.5e-1556.4
TkAUNG062560PF13428TPR_1438512.2e-1247.1
TkAUNG062560PF13432TPR_1639535.8e-1659.3
TkAUNG062560PF14863Alkyl_sulf_dimr421069.8e-0523.5
TkAUNG062560PF13371TPR_943752.3e-1144.3
TkAUNG062560PF07719TPR_246751.2e-2691.3
TkAUNG062560PF13428TPR_1447812.2e-1247.1
TkAUNG062560PF24575TPR_Slam48770.0002122.3
TkAUNG062560PF03704BTAD491060.0001423.0
TkAUNG062560PF13432TPR_16511115.8e-1659.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LYW9拟南芥sp|Q9LYW9|DNJ36_ARATH DnaJ protein P58IPK homolog68.500%Swiss-Prot高置信
Q5JNB5水稻sp|Q5JNB5|DJC15_ORYSJ DnaJ protein P58IPK homolog B65.300%Swiss-Prot高置信
A0A0P0VG31水稻sp|A0A0P0VG31|DJC16_ORYSJ DnaJ protein P58IPK homolog A65.800%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看