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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG053450
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 15283811-15286549 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2274 bp · TkAUNG053450|TK1151|cDNA

CCTCCCTCTGCTCGCACCTACCAAAACGTACCCAACGTCTTATATCTAAGTCAACTTTGAAAAACAATAAAGTCAAATCAAGCAATTACAAAGCAACTTGTCTGGAATCAATGCTTCTAGTTTCACCTTTACATCTTCTTGATCACAAATCATTAAGTTATTGCTATGGAAGATACCCATGTCGACAAAACTTTGCAAACACAACCATGTCTCCAATTTTCCCTTTCGGAGCTTCAGATTGCCACCCATCGATTTGATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1941 bp · TkAUNG053450|TK1151|CDS

ATGGAAGATACCCATGTCGACAAAACTTTGCAAACACAACCATGTCTCCAATTTTCCCTTTCGGAGCTTCAGATTGCCACCCATCGATTTGATGAGGGTTCCGTCATAGGTCAAGGTGGTTATGGAAAGGTTTATAAAGGTTCAGTCAAGATTGGAGAAACTTATGTTCTTGTTGCCATCAAACGATTGCACTCAAATTCTAGTCAAGGTGCCTCGGAATTTTGGGCTGAAGTTGAGATGCTCTCAAAACTGAGGCACTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

646 aa · TkAUNG053450|TK1151|PROTEIN

MEDTHVDKTLQTQPCLQFSLSELQIATHRFDEGSVIGQGGYGKVYKGSVKIGETYVLVAIKRLHSNSSQGASEFWAEVEMLSKLRHCNLASLIGYCDHGKEMMLVYEYMPNGTLEACFFKGVTPLSWLLRLNICIGAARGLDYLHTGTGTKQAVIHRDVKTSNILLDANYAAKISDFGLAKVGPTNTPVTTGVKGTFGYLDPTYFLTKKLTTKSDVYAFGVVLLEVLCGRPAVDTTLKEEQRGLAKWGQDRIKEGKVFKI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG053450
TK1151 IDTkAUNG053450
OH-1004 IDLXL04_017085
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)42.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.678 / OH-1004 91.189
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG053450
位置ChrUn:15283811-15286549 (+)
描述Similar to BAK1: BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献
At3g04690 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At5g38990 可能的受体样蛋白激酶At5g38990。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017085 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0010008 endosome membrane 细胞组分
GO:0032991 protein-containing complex 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G33430
dosa:Os08g0174700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.656
排名 1 · TkAUNG053450 · TK1151
细胞质0.261
排名 2 · TkAUNG053450 · TK1151
细胞核0.193
排名 3 · TkAUNG053450 · TK1151
内质网0.042
排名 4 · TkAUNG053450 · TK1151
高尔基体0.030
排名 5 · TkAUNG053450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase31-300 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr34-302 aa
PF07387Seadorna_VP7137-176 aa
PF01636APH151-184 aa
PF12330Haspin_kinase155-183 aa
PF04286DUF445209-312 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr409-640 aa
PF00069Pkinase410-639 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG053450PF00069Pkinase313004.4e-65220.4
TkAUNG053450PF07714PK_Tyr_Ser-Thr343021.7e-68231.5
TkAUNG053450PF07387Seadorna_VP71371760.03413.9
TkAUNG053450PF01636APH1511840.2511.8
TkAUNG053450PF12330Haspin_kinase1551830.1511.8
TkAUNG053450PF04286DUF4452093120.212.3
TkAUNG053450PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4096401.7e-68231.5
TkAUNG053450PF00069Pkinase4106394.4e-65220.4
TkAUNG053450PF12330Haspin_kinase4765260.1511.8
TkAUNG053450PF07387Seadorna_VP74805150.03413.9
TkAUNG053450PF01636APH4975190.2511.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q3E8W4拟南芥sp|Q3E8W4|ANX2_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR255.400%Swiss-Prot低置信
Q9SCZ4拟南芥sp|Q9SCZ4|FERON_ARATH Receptor-like protein kinase FERONIA53.800%Swiss-Prot低置信
Q9FID8拟南芥sp|Q9FID8|Y5900_ARATH Putative receptor-like protein kinase At5g3900053.400%Swiss-Prot低置信
Q9SR05拟南芥sp|Q9SR05|ANX1_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR152.500%Swiss-Prot低置信
Q9FID9拟南芥sp|Q9FID9|Y5389_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g3899052.700%Swiss-Prot低置信

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