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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG044110
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 12256788-12262709 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4149 bp · TkAUNG044110|TK1151|cDNA

CGGAACGAGATAATTTCTCCCCATTTCTAACAACAACCCTTTCTTCCCTCCCACAACAAAATTAATCTTAGAAACCGAGTTTATAGAATATGATCACAAAGAGGAGAGAGAGTGTGTGTGTGAATAAAGAAATCGCCAAATTCAATTTCTCTGTTTTCATTACAGCCAGCTCTCCCTCATTCTTCATAATATTGTCGCTCTTTCATCCATGAACATGCTGCATTCCTTTCCCCATAGATGATAGCGTACAAAAAGACCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

3633 bp · TkAUNG044110|TK1151|CDS

ATGGCGGAGACCAAACCGGCGGATACCAAAACGGCGGAGACCAAATCGGCGGATACCAAAACGGCGGAGACGTTAGACACATTTTCGCTTTCTGTGGGGTCGATGGTTGAAGAAGTTCTTCAGGAGCAAGGCCCGAAATTGTGCGAGGCCAATGTGCCAGTCAAGCCTGATTCAAAAATCGCAAGAAAAAGAAATGATGCAACAAGATTTCTAAGAAAGTCGGTAGGTGTGGTGGCTGCAAAAGATTTACCAGCCGAGCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1210 aa · TkAUNG044110|TK1151|PROTEIN

MAETKPADTKTAETKSADTKTAETLDTFSLSVGSMVEEVLQEQGPKLCEANVPVKPDSKIARKRNDATRFLRKSVGVVAAKDLPAEPSENDFRLGLRSGIVFCKYMNKIEPGAISKIVEAPFDSVIIPDGEPLSSSQYFENITNFLSAINERGLPSFEASDLEQGGRIVKVVNCVLALKAYGEWKKAGANGTFKWGMKKPSSERKEKVHKALDMNKCVELWKDEVKEKSLQERVRDLLSNHKPRDVPIIVEIVLSKLTED...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG044110
TK1151 IDTkAUNG044110
OH-1004 IDLXL04_001277
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG044110
位置ChrUn:12256788-12262709 (+)
描述Similar to KIN14F: Kinesin-like protein KIN-14F
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g27000 微管结合运动蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g47500 类驱动蛋白KIN-14I。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0301800 类动力蛋白KIN-14F。 暂无已核实直接文献
Os11g0672400 类动力蛋白 KIN-14P。 暂无已核实直接文献
Os12g0547500 沿着微管运输肌动蛋白丝的负端定向运动蛋白。
Dynamic bridges--a calponin-domain kinesin from rice links actin filaments and microtubules in both cycling and non-cycling cells.2009 · DOI: 10.1093/pcp/pcp094
A kinesin with calponin-homology domain is involved in premitotic nuclear migration.2010 · DOI: 10.1093/jxb/erq164
The non-processive rice kinesin-14 OsKCH1 transports actin filaments along microtubules with two distinct velocities.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.111
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001277 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0007097 nuclear migration 生物过程
GO:0031534 minus-end directed microtubule sliding 生物过程
GO:0051647 nucleus localization 生物过程
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0015629 actin cytoskeleton 细胞组分
GO:0015630 microtubule cytoskeleton 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0003779 actin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
dosa:Os03g0301800
dosa:Os12g0547500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.706
排名 1 · TkAUNG044110 · TK1151
细胞膜0.224
排名 2 · TkAUNG044110 · TK1151
细胞核0.180
排名 3 · TkAUNG044110 · TK1151
高尔基体0.048
排名 4 · TkAUNG044110 · TK1151
内质网0.041
排名 5 · TkAUNG044110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00307CH88-182 aa
PF00225Kinesin295-341 aa
PF16796Microtub_bd305-340 aa
PF00225Kinesin499-537 aa
PF16796Microtub_bd533-577 aa
PF00225Kinesin654-654 aa
PF16796Microtub_bd678-678 aa
PF00307CH731-749 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG044110PF00307CH881823.6e-1143.9
TkAUNG044110PF00225Kinesin2953411.5e-105353.5
TkAUNG044110PF16796Microtub_bd3053402.3e-40138.8
TkAUNG044110PF00225Kinesin4995371.5e-105353.5
TkAUNG044110PF16796Microtub_bd5335772.3e-40138.8
TkAUNG044110PF00225Kinesin6546541.5e-105353.5
TkAUNG044110PF16796Microtub_bd6786782.3e-40138.8
TkAUNG044110PF00307CH7317493.6e-1143.9
TkAUNG044110PF16796Microtub_bd7839402.3e-40138.8
TkAUNG044110PF00225Kinesin82311191.5e-105353.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81635拟南芥sp|O81635|KN14G_ARATH Kinesin-like protein KIN-14G35.300%Swiss-Prot中等置信
F4IL57拟南芥sp|F4IL57|KN14I_ARATH Kinesin-like protein KIN-14I35.100%Swiss-Prot中等置信
Q10MN5水稻sp|Q10MN5|KN14F_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14F34.900%Swiss-Prot中等置信
B9G8P1水稻sp|B9G8P1|KN14P_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14P35.000%Swiss-Prot中等置信
Q0IMS9水稻sp|Q0IMS9|KN14Q_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14Q35.100%Swiss-Prot中等置信

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