TkAUNG041210 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG041210

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 11466811-11468121 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1311 bp · TkAUNG041210|TK1151|cDNA

ATGCAGGAGAAACAGCTCTACCACAAAGTTCTATCCTATCTCAATTCGTTACCATCAACTGCGGATTCCGATTTCGTCAATCTTCAACACATTCATAAAGTCGCGGAGGAGATCGAGCTAAAGAGTAACGAAGTCAGGCTATACATCAACGCGGAAACCGAACCAGAGAAGAATGGGAGATGGAAATCGATTCCGTTCACACATCCGACGACGATCGACACCGCAATGATCGATTCCGAGTTTAAAACCAAGGTGAAGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1311 bp · TkAUNG041210|TK1151|CDS

ATGCAGGAGAAACAGCTCTACCACAAAGTTCTATCCTATCTCAATTCGTTACCATCAACTGCGGATTCCGATTTCGTCAATCTTCAACACATTCATAAAGTCGCGGAGGAGATCGAGCTAAAGAGTAACGAAGTCAGGCTATACATCAACGCGGAAACCGAACCAGAGAAGAATGGGAGATGGAAATCGATTCCGTTCACACATCCGACGACGATCGACACCGCAATGATCGATTCCGAGTTTAAAACCAAGGTGAAGTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

436 aa · TkAUNG041210|TK1151|PROTEIN

MQEKQLYHKVLSYLNSLPSTADSDFVNLQHIHKVAEEIELKSNEVRLYINAETEPEKNGRWKSIPFTHPTTIDTAMIDSEFKTKVKSDLEQFLKSKQYYHRLGRVWKRSYLLYGQSGTGKSSFIAGMAKFLCYDLYDVDMSKVTRDSDLKLLLLQTTSKSMIVVEDLDKYLFEKEKSTAVSLSGILNFMDGIISCCGEERIMVFTVSNKDQIDPTVLRPGGIDVHIHFPLCDFSSFKNLANSHLGIKEHKLFPQVEEIFQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG041210`
TK1151 ID	TkAUNG041210
OH-1004 ID	LXL04_003148
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	96.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.706 / OH-1004 81.765 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG041210

位置 ChrUn:11466811-11468121 (+)

描述 Similar to At2g46620: AAA-ATPase At2g46620

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g46620`	AAA-ATP酶 At2g46620。	暂无已核实直接文献
`At5g17760`	AAA-ATP酶 At5g17760。	暂无已核实直接文献
`At4g25835`	AAA-ATP酶 At4g25835。	暂无已核实直接文献
`At5g17730`	AAA-ATP酶 At5g17730。	暂无已核实直接文献
`At3g28580`	AAA-ATP酶 At3g28580。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003148 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000304 response to singlet oxygen 生物过程

GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程

GO:0006950 response to stress 生物过程

GO:0009411 response to UV 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009863 salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0012501 programmed cell death 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G46620

ath:AT3G28580

ath:AT3G50930

ath:AT4G25835

ath:AT5G17760

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.401

排名 1 · TkAUNG041210 · TK1151

细胞核0.299

排名 2 · TkAUNG041210 · TK1151

线粒体0.123

排名 3 · TkAUNG041210 · TK1151

细胞膜0.093

排名 4 · TkAUNG041210 · TK1151

质体0.092

排名 5 · TkAUNG041210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05673DUF81556-209 aa

PF27113GbsR_C74-105 aa

PF13191AAA_1699-132 aa

PF12775AAA_7107-159 aa

PF03193RsgA_GTPase107-127 aa

PF13479AAA_24108-135 aa

PF13555AAA_29108-132 aa

PF13401AAA_22108-145 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG041210	`PF05673`	DUF815	56	209	5.7e-05	23.1
TkAUNG041210	`PF27113`	GbsR_C	74	105	0.068	14.4
TkAUNG041210	`PF13191`	AAA_16	99	132	0.022	16.0
TkAUNG041210	`PF12775`	AAA_7	107	159	0.072	13.3
TkAUNG041210	`PF03193`	RsgA_GTPase	107	127	0.15	12.6
TkAUNG041210	`PF13479`	AAA_24	108	135	0.003	18.0
TkAUNG041210	`PF13555`	AAA_29	108	132	0.012	16.1
TkAUNG041210	`PF13401`	AAA_22	108	145	0.18	12.8
TkAUNG041210	`PF00004`	AAA	110	230	2.4e-10	41.7
TkAUNG041210	`PF07728`	AAA_5	111	150	0.015	16.1
TkAUNG041210	`PF27394`	Aq_aa27	111	178	0.076	13.6
TkAUNG041210	`PF00910`	RNA_helicase	111	168	0.11	13.7
TkAUNG041210	`PF25568`	AAA_lid_At3g28540	231	296	1.8e-11	44.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4IJ77`	拟南芥	sp\|F4IJ77\|AATP4_ARATH AAA-ATPase At2g46620	54.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FN75`	拟南芥	sp\|Q9FN75\|AATPI_ARATH AAA-ATPase At5g17760	40.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8RY66`	拟南芥	sp\|Q8RY66\|AATPD_ARATH AAA-ATPase At4g25835	38.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FN78`	拟南芥	sp\|Q9FN78\|AATPF_ARATH AAA-ATPase At5g17730	39.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LJJ7`	拟南芥	sp\|Q9LJJ7\|AATP9_ARATH AAA-ATPase At3g28580	36.700%	Swiss-Prot	中等置信

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