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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG035520
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 9743996-9747735 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2017 bp · TkAUNG035520|TK1151|cDNA

ATCAAATCGGAGCCGCAAACCAACTCCTCCGTGGCGCCATTTGGTCCTCTCCTAAAGTAACTTTCTTCATTTTCTCTTCTTCTTCAGAAAAAGAAAACGAATACTTCCATAACACTGTGCTACTTCAATAATCTCTTCAAATTTCCTAGTTCACGTCTAAAAAATGGCGAAACTGTATACATTTAGAACAGACACCAGTTTATCTTGTCTTTCACAGCACAAATTTCGCCATCCCTCGAATAAACGGTTCTTAAAACCAT...

1575 bp · TkAUNG035520|TK1151|CDS

ATGGCGAAACTGTATACATTTAGAACAGACACCAGTTTATCTTGTCTTTCACAGCACAAATTTCGCCATCCCTCGAATAAACGGTTCTTAAAACCATCATCATCACCATGTTTACTAAACTCAGGGTCTTTAAAAGTTTCTTGTAGCATCAGGGAGAAAGAAAACATCGCAGAAAATGAGAGAATTACTCCGATAGTTACTGGGCTAAGAGTTGATGATGAAATCGGGGAGAAAGCTGGAGATGGGATCGAGAAATTAGG...

524 aa · TkAUNG035520|TK1151|PROTEIN

MAKLYTFRTDTSLSCLSQHKFRHPSNKRFLKPSSSPCLLNSGSLKVSCSIREKENIAENERITPIVTGLRVDDEIGEKAGDGIEKLGLENLNWPPWKNVPQRYKLIGTTSLAFVICNMDKVNLSIAIIPMSHQFGWSSSVAGLVQSSFFWGYALSQLPGGWLSKIFGGRIVLQFGVLAWSLATALVPVVAGFMPGLVFTRILVGIGEGVSPSAATDLIARLIPLEERSRAVSFVFGGLSVGSVLGLLLAPPLIESFGWES...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG035520
TK1151 IDTkAUNG035520
OH-1004 IDLXL04_002749
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG035520
位置ChrUn:9743996-9747735 (-)
描述Similar to ANTR6: Probable anion transporter 6, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g20380 无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g00370 无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0556400 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os09g0570400 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os01g0279700 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_002749 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0010028 xanthophyll cycle 生物过程
GO:0015882 L-ascorbic acid transmembrane transport 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015229 L-ascorbic acid transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G00370
ath:AT5G20380
dosa:Os01g0279700
dosa:Os09g0556400
dosa:Os09g0570400
osa:4326905
osa:4347913
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

质体0.960
排名 1 · TkAUNG035520 · TK1151
过氧化物酶体0.030
排名 2 · TkAUNG035520 · TK1151
线粒体0.029
排名 3 · TkAUNG035520 · TK1151
高尔基体0.026
排名 4 · TkAUNG035520 · TK1151
内质网0.025
排名 5 · TkAUNG035520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690MFS_1110-476 aa
PF00083Sugar_tr137-524 aa
PF03092BT1198-487 aa
PF24664Monjiviricetes_fusion457-509 aa
PF07690MFS_1474-517 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG035520PF07690MFS_11104761.2e-51176.4
TkAUNG035520PF00083Sugar_tr1375243.2e-0523.7
TkAUNG035520PF03092BT11984870.0004619.7
TkAUNG035520PF24664Monjiviricetes_fusion4575090.419.2
TkAUNG035520PF07690MFS_14745171.2e-51176.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q3E9A0拟南芥sp|Q3E9A0|ANTR6_ARATH Probable anion transporter 6, chloroplastic74.700%Swiss-Prot高置信
Q8GX78拟南芥sp|Q8GX78|ANTR2_ARATH Ascorbate transporter, chloroplastic40.600%Swiss-Prot中等置信
Q0IZQ3水稻sp|Q0IZQ3|PHT45_ORYSJ Probable anion transporter 5, chloroplastic74.100%Swiss-Prot中等置信
Q652N5水稻sp|Q652N5|PHT44_ORYSJ Probable anion transporter 4, chloroplastic41.800%Swiss-Prot中等置信
Q9SDI4水稻sp|Q9SDI4|PHT41_ORYSJ Probable anion transporter 1, chloroplastic42.100%Swiss-Prot中等置信

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