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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG016030
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 4295061-4296967 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1668 bp · TkAUNG016030|TK1151|cDNA

ATGGCGTATTCTACCACAGAGCCGCCGCCGGCGTATGCTCTGTCACTCACGGACGACAAGCAGCGGCGACGCCTCGAGGAAGACGAGAATCCTTTCGAAGGGAAGTACTCTTGGTTAACGGTAGCTCTTTGCCCATGTCTCGTATGTTTTATACTTGTGATGATAATAGTCTCGATCGTACTCACCGTCAAGTTCCATATATTTTGCCACACTTCACTTGGATCTCTCCTGGTAAACCACGTGCATTCCTTCTTATTCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1668 bp · TkAUNG016030|TK1151|CDS

ATGGCGTATTCTACCACAGAGCCGCCGCCGGCGTATGCTCTGTCACTCACGGACGACAAGCAGCGGCGACGCCTCGAGGAAGACGAGAATCCTTTCGAAGGGAAGTACTCTTGGTTAACGGTAGCTCTTTGCCCATGTCTCGTATGTTTTATACTTGTGATGATAATAGTCTCGATCGTACTCACCGTCAAGTTCCATATATTTTGCCACACTTCACTTGGATCTCTCCTGGTAAACCACGTGCATTCCTTCTTATTCCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

555 aa · TkAUNG016030|TK1151|PROTEIN

MAYSTTEPPPAYALSLTDDKQRRRLEEDENPFEGKYSWLTVALCPCLVCFILVMIIVSIVLTVKFHIFCHTSLGSLLVNHVHSFLFPPSSLFTYIDLSEKKLHHQIRGFCGVVNSDEESETEDAEGVKSVADEEEVKRICNVIEELFALDRNMEAVLDDCKINLTHDLVIDVLERFKHARKPAFRFFSWAGQQPGFHHDSRTYNTIMSILGKTKQFETMISLLDEMGDKRSKLGKEAQLLFHNLKGKFTPNIQTYTVLLN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG016030
TK1151 IDTkAUNG016030
OH-1004 IDLXL04_005553
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)28.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 35.315 / OH-1004 42.157
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG016030
位置ChrUn:4295061-4296967 (-)
描述Similar to At1g73400: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g73400, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g14820 含五肽重复序列的蛋白At5g14820，线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g62540 含五聚体重复蛋白 At3g62540，线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g62470 含五肽重复的蛋白 At3g62470，线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g22670 含五节重复序列蛋白At3g22670，线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g15200 预测含五螺旋重复的蛋白质 At3g15200。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005553 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G73400
ath:AT1G77360
ath:AT3G62470
ath:AT3G62540
ath:AT5G14820
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.711
排名 1 · TkAUNG016030 · TK1151
质体0.203
排名 2 · TkAUNG016030 · TK1151
细胞核0.074
排名 3 · TkAUNG016030 · TK1151
细胞质0.036
排名 4 · TkAUNG016030 · TK1151
细胞膜0.015
排名 5 · TkAUNG016030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13762MNE1134-208 aa
PF23276TPR_24183-231 aa
PF29070MSC6_N194-224 aa
PF12854PPR_1197-226 aa
PF13812PPR_3198-226 aa
PF13041PPR_2199-229 aa
PF01535PPR202-229 aa
PF06239ECSIT_N213-258 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG016030PF13762MNE11342080.1213.1
TkAUNG016030PF23276TPR_241832313.1e-0937.5
TkAUNG016030PF29070MSC6_N1942241.2e-2281.3
TkAUNG016030PF12854PPR_11972262.2e-31108.0
TkAUNG016030PF13812PPR_31982263.7e-2691.7
TkAUNG016030PF13041PPR_21992294.7e-56187.4
TkAUNG016030PF01535PPR2022291.6e-40135.2
TkAUNG016030PF06239ECSIT_N2132585.9e-0523.1
TkAUNG016030PF29978ATP18_TPR2142360.001419.2
TkAUNG016030PF17177PPR_long2422861.1e-1455.0
TkAUNG016030PF13812PPR_32482943.7e-2691.7
TkAUNG016030PF12854PPR_12492782.2e-31108.0
TkAUNG016030PF13041PPR_22502994.7e-56187.4
TkAUNG016030PF29070MSC6_N2523461.2e-2281.3
TkAUNG016030PF01535PPR2542831.6e-40135.2
TkAUNG016030PF29978ATP18_TPR2693040.001419.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LEQ7拟南芥sp|Q9LEQ7|PP382_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g14820, mitochondrial52.700%Swiss-Prot低置信
Q3EAF8拟南芥sp|Q3EAF8|PP294_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g62540, mitochondrial52.200%Swiss-Prot低置信
Q9LZP3拟南芥sp|Q9LZP3|PP293_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g62470, mitochondrial52.200%Swiss-Prot低置信
Q9LUJ4拟南芥sp|Q9LUJ4|PP248_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g22670, mitochondrial25.600%Swiss-Prot低置信
Q9LIL5拟南芥sp|Q9LIL5|PP233_ARATH Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At3g1520024.600%Swiss-Prot低置信

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