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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG010790
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 2617131-2620969 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1767 bp · TkAUNG010790|TK1151|cDNA

ATGAGAAGTTCTTGGTACAATAAACTATTATTGATCATCGGCCCTAGACCGCCGCTTAACTGGTTGCTTTTGTGTCTAGTTAGTGCTTTAGTTTTGATTGCTTTGTTGGGATCTTCTTCTAATGAACTTGATTCTGTGACTGATACTGTGAGACCTGACATTTATTCACGCTATAGAAGGTTGAAAGAGCAAGCAATTAATGATTATTTAGAGTTGAAAAAATTAGGGACCAATTCTTTAAAGGATTTTGATGTTTGTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1767 bp · TkAUNG010790|TK1151|CDS

ATGAGAAGTTCTTGGTACAATAAACTATTATTGATCATCGGCCCTAGACCGCCGCTTAACTGGTTGCTTTTGTGTCTAGTTAGTGCTTTAGTTTTGATTGCTTTGTTGGGATCTTCTTCTAATGAACTTGATTCTGTGACTGATACTGTGAGACCTGACATTTATTCACGCTATAGAAGGTTGAAAGAGCAAGCAATTAATGATTATTTAGAGTTGAAAAAATTAGGGACCAATTCTTTAAAGGATTTTGATGTTTGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

588 aa · TkAUNG010790|TK1151|PROTEIN

MRSSWYNKLLLIIGPRPPLNWLLLCLVSALVLIALLGSSSNELDSVTDTVRPDIYSRYRRLKEQAINDYLELKKLGTNSLKDFDVCGKERENYVPCYNVSANLLAGFKDGEEFDRHCEISRDKQYCLVRPPKDYKIPLTWPTGRDVIWSGNVKLSKDQFLSSGSMTKRLMLLEENQISFHSDDEMIVDGVKDYSHQIAEMIGLGSDSEFREAGVRNVLDIGCGFGSFGAHLLSLQLMAVCMAAYESSGSQVQVALERGLP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG010790
TK1151 IDTkAUNG010790
OH-1004 IDLXL04_030121
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)55.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.327 / OH-1004 74.763
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG010790
位置ChrUn:2617131-2620969 (+)
描述Similar to QUA2: Probable pectin methyltransferase QUA2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g03480 可能的甲基转移酶 PMT5。 暂无已核实直接文献
At1g13860 可能的甲基转移酶 PMT4。 暂无已核实直接文献
At1g78240 可能参与高半乳糖醛酸的合成。
Homogalacturonan synthesis in Arabidopsis thaliana requires a Golgi-localized protein with a putative methyltransferase domain.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03086.x
The TUMOROUS SHOOT DEVELOPMENT2 gene of Arabidopsis encoding a putative methyltransferase is required for cell adhesion and co-ordinated plant development.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03123.x
The OSU1/QUA2/TSD2-encoded putative methyltransferase is a critical modulator of carbon and nitrogen nutrient balance response in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1371/journal.pone.0001387
At5g14430 可能的甲基转移酶 PMT9。 暂无已核实直接文献
At1g04430 可能的甲基转移酶 PMT8。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030121 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007155 cell adhesion 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0010289 homogalacturonan biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048367 shoot system development 生物过程
GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04430
ath:AT1G13860
ath:AT1G78240
ath:AT2G03480
ath:AT3G23300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.763
排名 1 · TkAUNG010790 · TK1151
内质网0.080
排名 2 · TkAUNG010790 · TK1151
细胞外0.063
排名 3 · TkAUNG010790 · TK1151
细胞膜0.061
排名 4 · TkAUNG010790 · TK1151
细胞质0.044
排名 5 · TkAUNG010790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03141Methyltransf_2992-566 aa
PF05175MTS213-235 aa
PF13489Methyltransf_23214-320 aa
PF13847Methyltransf_31216-321 aa
PF07021MetW216-285 aa
PF13649Methyltransf_25217-309 aa
PF08241Methyltransf_11218-313 aa
PF08242Methyltransf_12218-311 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG010790PF03141Methyltransf_29925667.8e-127424.6
TkAUNG010790PF05175MTS2132350.06713.5
TkAUNG010790PF13489Methyltransf_232143203.3e-0730.9
TkAUNG010790PF13847Methyltransf_312163213.9e-0937.1
TkAUNG010790PF07021MetW2162850.1312.6
TkAUNG010790PF13649Methyltransf_252173097.5e-1143.3
TkAUNG010790PF08241Methyltransf_112183131.6e-1145.4
TkAUNG010790PF08242Methyltransf_122183112.1e-0732.3
TkAUNG010790PF20922Anamorsin_N2933290.2511.7
TkAUNG010790PF25880WHD_CHMP7_1st4174460.1512.5
TkAUNG010790PF05175MTS4644870.06713.5
TkAUNG010790PF13489Methyltransf_234655663.3e-0730.9
TkAUNG010790PF13649Methyltransf_255185627.5e-1143.3
TkAUNG010790PF13847Methyltransf_315225663.9e-0937.1
TkAUNG010790PF08241Methyltransf_115255661.6e-1145.4
TkAUNG010790PF08242Methyltransf_125255642.1e-0732.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q3EC77拟南芥sp|Q3EC77|PMT5_ARATH Probable methyltransferase PMT564.200%Swiss-Prot高置信
Q8GYW9拟南芥sp|Q8GYW9|PMT4_ARATH Probable methyltransferase PMT464.400%Swiss-Prot高置信
Q9C9Q8拟南芥sp|Q9C9Q8|PMTT_ARATH Probable pectin methyltransferase QUA257.100%Swiss-Prot高置信
Q8VZV7拟南芥sp|Q8VZV7|PMT9_ARATH Probable methyltransferase PMT935.500%Swiss-Prot中等置信
Q940J9拟南芥sp|Q940J9|PMT8_ARATH Probable methyltransferase PMT836.500%Swiss-Prot中等置信

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