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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG010780
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 2610154-2611038 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

885 bp · TkAUNG010780|TK1151|cDNA

ATGGCGTTGGTGGTTATCTGTGGTCAACCTTGTAGTGGGAAATCCACAGCTGCAGCCTGCCTGGCTGAAGCCCTTCAAGAAACAGAATCTAAGCCATCTGTTCGGATCATTAATGAATCTTCCTTTCACCTGAATCGTAACCAAAGCTATGCTGACATGCCATCTGAAAAGAATCTAAGGGGGGTCCTGAGATCTGAAGTTGATAGATCATTGTCCAGAGATAATATCATCATAGTGGATTCTTTAAACAGCATAAAGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

885 bp · TkAUNG010780|TK1151|CDS

ATGGCGTTGGTGGTTATCTGTGGTCAACCTTGTAGTGGGAAATCCACAGCTGCAGCCTGCCTGGCTGAAGCCCTTCAAGAAACAGAATCTAAGCCATCTGTTCGGATCATTAATGAATCTTCCTTTCACCTGAATCGTAACCAAAGCTATGCTGACATGCCATCTGAAAAGAATCTAAGGGGGGTCCTGAGATCTGAAGTTGATAGATCATTGTCCAGAGATAATATCATCATAGTGGATTCTTTAAACAGCATAAAGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

294 aa · TkAUNG010780|TK1151|PROTEIN

MALVVICGQPCSGKSTAAACLAEALQETESKPSVRIINESSFHLNRNQSYADMPSEKNLRGVLRSEVDRSLSRDNIIIVDSLNSIKGYRYELWCLARAAGTRYCVLHCDLEETYCRKWNEERREKLEASYDDNIFEDLVRRFERPDSKNRWDSPLFELWPSKDGIVKSSAAIVDAVTYLTKRVDSKTKDVKVLQPTIATQNARLTEANSLYELDRATLEVTNMIVEAQSRALGGPLNGVSLGPGLPSIEISRPVGLPELR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG010780
TK1151 IDTkAUNG010780
OH-1004 IDLXL04_036121
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)71.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.497 / OH-1004 54.990
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG010780
位置ChrUn:2610154-2611038 (+)
描述Similar to KTI12: Protein KTI12 homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g13870 与延长子复合体相关的因子，不是结构亚基，而是暂时接触复合体。
DRL1, a homolog of the yeast TOT4/KTI12 protein, has a function in meristem activity and organ growth in plants.2003 · DOI: 10.1105/tpc.007062
Transfer RNA modifications and genes for modifying enzymes in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1186/1471-2229-10-201
Comparative analysis of the conserved functions of Arabidopsis DRL1 and yeast KTI12.2015 · DOI: 10.14348/molcells.2015.2297

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BK80 延长酶复合物相关因子，不是结构亚基，而是暂时与复合物接触（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
Os11g0312782 与延长子复合体相关的因子，不是结构亚基，而是暂时接触复合体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036121 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002098 tRNA wobble uridine modification 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006400 tRNA modification 生物过程
GO:0009933 meristem structural organization 生物过程
GO:0010449 root meristem growth 生物过程
GO:0048366 leaf development 生物过程
GO:0080178 5-carbamoylmethyl uridine residue modification 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0033588 elongator holoenzyme complex 细胞组分
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G13870
dosa:Os11g0312782
dre:751662
xla:735147
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.522
排名 1 · TkAUNG010780 · TK1151
细胞质0.505
排名 2 · TkAUNG010780 · TK1151
线粒体0.090
排名 3 · TkAUNG010780 · TK1151
过氧化物酶体0.049
排名 4 · TkAUNG010780 · TK1151
质体0.031
排名 5 · TkAUNG010780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08433KTI121-271 aa
PF13671AAA_333-145 aa
PF01583APS_kinase3-115 aa
PF13401AAA_223-64 aa
PF20720nSTAND33-32 aa
PF24883NPHP3_N3-33 aa
PF06414Zeta_toxin3-36 aa
PF13191AAA_163-70 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG010780PF08433KTI1212716.9e-77259.3
TkAUNG010780PF13671AAA_3331456.9e-1349.8
TkAUNG010780PF01583APS_kinase31150.002618.5
TkAUNG010780PF13401AAA_223640.004518.0
TkAUNG010780PF20720nSTAND33320.01116.2
TkAUNG010780PF24883NPHP3_N3330.02615.4
TkAUNG010780PF06414Zeta_toxin3360.02614.7
TkAUNG010780PF13191AAA_163700.113.8
TkAUNG010780PF13238AAA_1841166.7e-0524.1
TkAUNG010780PF13521AAA_2841410.000321.8
TkAUNG010780PF01926MMR_HSR14550.1612.8
TkAUNG010780PF00910RNA_helicase4380.2112.8
TkAUNG010780PF00004AAA5880.07814.2
TkAUNG010780PF19975DO-GTPase15390.1911.7
TkAUNG010780PF22124Glyco_hydro_95_cat25710.1112.1
TkAUNG010780PF22124Glyco_hydro_95_cat1402190.1112.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LMH0拟南芥sp|Q9LMH0|KTI12_ARATH Protein KTI12 homolog71.200%Swiss-Prot高置信
B8BK80水稻sp|B8BK80|KTI12_ORYSI Protein KTI12 homolog73.400%Swiss-Prot高置信
B9GAG9水稻sp|B9GAG9|KTI12_ORYSJ Protein KTI12 homolog73.400%Swiss-Prot高置信

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