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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG005080
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 1521220-1524168 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2880 bp · TkAUNG005080|TK1151|cDNA

ATGTCCACAATACCTGGATTTAATCAGATACAATTTGAAGGATTTTGTAGGTTCATTGATCAGGGTTTGACAGAAGAACTTTCTAAGTTTCCAAAAATTGAAGATACAAATCAAGAAATTGACTTTGAATTATTTTTGGAAAGATATCAATTGGTAGAACCCCCAATAAAGGAAAGAGATGCTGTGTATGAATCACTCACATATTCTTCTGAATTATATGTATCCGCGAGACTTATTTGGAAAAACGATAGGCGTAGGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

2880 bp · TkAUNG005080|TK1151|CDS

ATGTCCACAATACCTGGATTTAATCAGATACAATTTGAAGGATTTTGTAGGTTCATTGATCAGGGTTTGACAGAAGAACTTTCTAAGTTTCCAAAAATTGAAGATACAAATCAAGAAATTGACTTTGAATTATTTTTGGAAAGATATCAATTGGTAGAACCCCCAATAAAGGAAAGAGATGCTGTGTATGAATCACTCACATATTCTTCTGAATTATATGTATCCGCGAGACTTATTTGGAAAAACGATAGGCGTAGGTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

959 aa · TkAUNG005080|TK1151|PROTEIN

MSTIPGFNQIQFEGFCRFIDQGLTEELSKFPKIEDTNQEIDFELFLERYQLVEPPIKERDAVYESLTYSSELYVSARLIWKNDRRRYIQEQTILIGKIPLMTSLGAFIVNGIYRIVINQILQSPGIYYQSELNDNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKTRIWVRVSRQQKLSILVLLSAMGLNIREILENVCYPELFLSFLNDKKQIGSKENAILEFYQQFACVEGDPVFSESLSKDLQKKFFQQRCELGGIGRRNMNR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG005080
TK1151 IDTkAUNG005080
OH-1004 IDLXL04_022234
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 14.494 / OH-1004 14.479
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG005080
位置ChrUn:1521220-1524168 (-)
描述Similar to FER: Receptor-like protein kinase FERONIA
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022234 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0030308 negative regulation of cell growth 生物过程
GO:0032922 circadian regulation of gene expression 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G51550
ath:AT5G38990
ath:AT5G39000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.285
排名 1 · TkAUNG005080 · TK1151
线粒体0.262
排名 2 · TkAUNG005080 · TK1151
质体0.255
排名 3 · TkAUNG005080 · TK1151
细胞质0.054
排名 4 · TkAUNG005080 · TK1151
细胞膜0.015
排名 5 · TkAUNG005080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04563RNA_pol_Rpb2_19-354 aa
PF04561RNA_pol_Rpb2_2122-307 aa
PF04565RNA_pol_Rpb2_3368-436 aa
PF10385RNA_pol_Rpb2_45456-507 aa
PF00562RNA_pol_Rpb2_6520-551 aa
PF00562RNA_pol_Rpb2_6573-942 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG005080PF04563RNA_pol_Rpb2_193544.9e-1143.3
TkAUNG005080PF04561RNA_pol_Rpb2_21223079.2e-54182.7
TkAUNG005080PF04565RNA_pol_Rpb2_33684361.2e-2486.9
TkAUNG005080PF10385RNA_pol_Rpb2_454565070.004517.7
TkAUNG005080PF00562RNA_pol_Rpb2_65205511.2e-94318.3
TkAUNG005080PF00562RNA_pol_Rpb2_65739421.2e-94318.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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