TkA08G434400 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G434400

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 110403166-110405637 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1066 bp · TkA08G434400|TK1151|cDNA

TTAAAAGAACGGTACGAATGAAATTTCCCAAAAGAAGAAAAAATATCATCGATATCAGATCAGATGAACCAGATGTTGCAAGAGCCCCATGGAAAGAGACCCAACAAGAAAAAAAAATGAAGCCTTCTTCCACATTACTATTCGCATTAAAACCCATTGCACTCCTCGCAATCACGTTCTCCATCACCATATTCACGATACTCCTGTCTTCTCCTTTTGAATCAATCAAGCCAATGGCGTCTCGAAGCTTCATCTTATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

861 bp · TkA08G434400|TK1151|CDS

ATGAAATTTCCCAAAAGAAGAAAAAATATCATCGATATCAGATCAGATGAACCAGATGTTGCAAGAGCCCCATGGAAAGAGACCCAACAAGAAAAAAAAATGAAGCCTTCTTCCACATTACTATTCGCATTAAAACCCATTGCACTCCTCGCAATCACGTTCTCCATCACCATATTCACGATACTCCTGTCTTCTCCTTTTGAATCAATCAAGCCAATGGCGTCTCGAAGCTTCATCTTATGGCTACACGGTCTTGGTGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

286 aa · TkA08G434400|TK1151|PROTEIN

MKFPKRRKNIIDIRSDEPDVARAPWKETQQEKKMKPSSTLLFALKPIALLAITFSITIFTILLSSPFESIKPMASRSFILWLHGLGDSGPANEPIKSLFTSPQFANTRWSFPSAPSQPVTCNYGAVMPSWFDIHEIPITSSSPLDESSLLKAVRNVHSVIDKELAAGIDPKNVFICGFSQGGALTLSSVLLYPKTLGGGAVFSGWVPFNSTTIIDQITPEAKRTPILWSHGIADGTVMFEAGQAGPPFLQRLGINCEFKA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G434400`
TK1151 ID	TkA08G434400
OH-1004 ID	LXL04_015570
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	23.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 75.874 / OH-1004 88.148 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G434400

位置 Chr08:110403166-110405637 (+)

描述 Similar to DDB_G0282005: Acyl-protein thioesterase 1 homolog 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g22300`	羧酸酯酶。	暂无已核实直接文献
`At4g22305`	具有体外羧酸酯酶活性，优先选择短酰基链底物。	SOBER1 phospholipase activity suppresses phosphatidic acid accumulation and plant immunity in response to bacterial effector AvrBsT.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0903859106

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0669500`	在体外具有羧酸酯酶活性。	暂无已核实直接文献
`Os04g0669700`	可能为非活性羧酸酯酶Os04g0669700。	暂无已核实直接文献
`Os04g0669600`	在体外具有羧酸酯酶活性。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015570 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002084 protein depalmitoylation 生物过程

GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0046464 acylglycerol catabolic process 生物过程

GO:1905344 prostaglandin catabolic process 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005795 Golgi stack 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0070062 extracellular exosome 细胞组分

GO:0004622 phosphatidylcholine lysophospholipase A1 activity 分子功能

GO:0008474 palmitoyl-(protein) hydrolase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

cnb:CNBF2260

ddi:DDB_G0282005

hsa:11313

mmu:26394

rno:83510

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.552

排名 1 · TkA08G434400 · TK1151

细胞质0.177

排名 2 · TkA08G434400 · TK1151

过氧化物酶体0.102

排名 3 · TkA08G434400 · TK1151

细胞核0.088

排名 4 · TkA08G434400 · TK1151

线粒体0.086

排名 5 · TkA08G434400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02230Abhydrolase_276-281 aa

PF12697Abhydrolase_680-204 aa

PF12146Hydrolase_4151-204 aa

PF07859Abhydrolase_3155-192 aa

PF01738DLH167-272 aa

PF05448AXE1167-194 aa

PF00326Peptidase_S9168-190 aa

PF12146Hydrolase_4220-272 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G434400	`PF02230`	Abhydrolase_2	76	281	1.1e-46	160.1
TkA08G434400	`PF12697`	Abhydrolase_6	80	204	0.029	15.7
TkA08G434400	`PF12146`	Hydrolase_4	151	204	3.9e-07	30.4
TkA08G434400	`PF07859`	Abhydrolase_3	155	192	0.014	15.9
TkA08G434400	`PF01738`	DLH	167	272	4.5e-07	30.4
TkA08G434400	`PF05448`	AXE1	167	194	0.06	12.8
TkA08G434400	`PF00326`	Peptidase_S9	168	190	1.4e-05	25.4
TkA08G434400	`PF12146`	Hydrolase_4	220	272	3.9e-07	30.4
TkA08G434400	`PF00326`	Peptidase_S9	222	284	1.4e-05	25.4
TkA08G434400	`PF07859`	Abhydrolase_3	249	267	0.014	15.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GYK2`	拟南芥	sp\|Q8GYK2\|SOBRL_ARATH Probable carboxylesterase SOBER1-like	74.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q84WK4`	拟南芥	sp\|Q84WK4\|SOBR1_ARATH Carboxylesterase SOBER1	68.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q0J969`	水稻	sp\|Q0J969\|CAEH1_ORYSJ Probable carboxylesterase Os04g0669500	70.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q7XR62`	水稻	sp\|Q7XR62\|CAEH3_ORYSJ Probable inactive carboxylesterase Os04g0669700	52.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q0J968`	水稻	sp\|Q0J968\|CAEH2_ORYSJ Probable carboxylesterase Os04g0669600	52.200%	Swiss-Prot	高置信

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