RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G415580
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 105710359-105712468 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1746 bp · TkA08G415580|TK1151|cDNA

AATGGACTAGGTGGGTCCCGCGTCTACTTTTGCGACTGTACTATTCGAATTTTCAGCGATACTTGCAAGGTTTAAACATTGACCACCGGAAGTTGTTGACAAATGAGTTGCCTTATATACAACTGAACGCGGTAGTTGGCAGAAACAAACGTTCATGGCTTTTCCAAATTGGGTATTAGTTATAACAGAGTTTTATATTCTTACACATCTTGCTGGTCTCACCTTTACCCATGGAGACTATCAATGCGGAAACCAAGAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

822 bp · TkA08G415580|TK1151|CDS

ATGGTAGTGATGAGGAGTAGTTTCTATGGATACTCATGTTTGTTAAAATACGAAATATTAGTTTTCAGCACTGCGAATCCTCCAAACCCAACCCAACCATTTAATCCGCCTCAAGGGAAGAATAGATCCAAGGTGGTCGTTCCAGCAGTAACGGTGGCAGCAGTAATATTCGCGATCTTGATCCTCTTTTTTTGCTTAATGGTCCGCAGAATTTATACTCAAAAAGGGGAAGAGGAAGAACTTTTTGAAGCATCAGATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

273 aa · TkA08G415580|TK1151|PROTEIN

MVVMRSSFYGYSCLLKYEILVFSTANPPNPTQPFNPPQGKNRSKVVVPAVTVAAVIFAILILFFCLMVRRIYTQKGEEEELFEASDDDNGEMIYFRLKAVQAATRNFSGANKLGEGGFGPVYWGILRDGKKIAVKRLSQYSGQGMQEFKTEVKLIIKLQHKNLVKLLGCCMKGKERLLVYEYMSNSSLDYYLFEDPIKGKELDWAKRANIVNGIAKGLRYLHEDSRLKIIHRDLKASNILLDEEMNPKISDFGTARIFGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G415580
TK1151 IDTkA08G415580
OH-1004 IDLXL04_034635
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)88.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.436 / OH-1004 40.668
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G415580
位置Chr08:105710359-105712468 (-)
描述Similar to CRK14: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 14
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g11340 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RKS1。 暂无已核实直接文献
At4g27300 G型凝集素 S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 SD1-1。 暂无已核实直接文献
At4g11900 G 型凝集素 S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g11900。 暂无已核实直接文献
At1g11410 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g11410。 暂无已核实直接文献
At4g23270 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶19。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034635 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G05200
ath:AT4G21230
ath:AT4G23180
ath:AT4G23200
ath:AT4G23220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.822
排名 1 · TkA08G415580 · TK1151
内质网0.094
排名 2 · TkA08G415580 · TK1151
细胞质0.090
排名 3 · TkA08G415580 · TK1151
细胞核0.057
排名 4 · TkA08G415580 · TK1151
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · TkA08G415580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06365CD34_antigen43-81 aa
PF17591UL41A44-89 aa
PF21314TM_ErbB149-70 aa
PF00069Pkinase56-86 aa
PF00069Pkinase110-272 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr111-261 aa
PF03109ABC1117-137 aa
PF03109ABC1176-260 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G415580PF06365CD34_antigen43810.2911.8
TkA08G415580PF17591UL41A44890.07613.8
TkA08G415580PF21314TM_ErbB149700.4511.0
TkA08G415580PF00069Pkinase56867.6e-34118.0
TkA08G415580PF00069Pkinase1102727.6e-34118.0
TkA08G415580PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1112611.3e-34120.4
TkA08G415580PF03109ABC11171370.006516.4
TkA08G415580PF03109ABC11762600.006516.4
TkA08G415580PF06293Kdo1792450.1212.5
TkA08G415580PF12330Haspin_kinase2042620.01615.0
TkA08G415580PF01636APH2182560.1512.5
TkA08G415580PF19974TCAD92182540.2511.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZT07拟南芥sp|Q9ZT07|RKS1_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase RKS163.500%Swiss-Prot高置信
O81833拟南芥sp|O81833|SD11_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-153.000%Swiss-Prot高置信
Q9T058拟南芥sp|Q9T058|Y4119_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g1190052.600%Swiss-Prot高置信
Q9LPZ3拟南芥sp|Q9LPZ3|Y1141_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1141060.300%Swiss-Prot高置信
Q8GWJ7拟南芥sp|Q8GWJ7|CRK19_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1949.100%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看