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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G414080
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 105418453-105422403 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3098 bp · TkA08G414080|TK1151|cDNA

CTATCTTTTAAAGCCTATATAAATAATAAATGTATATAGCATTTTTTTGTTGGCAACTTGGAATTTGTAGATAGGTTTTGGCCGGGCAAGATTCTAAATTAGTGACTTAGTGGCATTTGGTGGGAAGTGGGCTGCTTCCATTTCGGGTCAATTCTTTGCATCTGACCACACCTTTCAAATTCCTAGAAATTAAGATTGGGGTGAAGTTTGATTTTGCTTTCCAACTTTCAAATATTCCATTTTGCCCTGTCCTGTTTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2427 bp · TkA08G414080|TK1151|CDS

ATGAGTTTTACCAGTAAAACCCAAAAAAGCATCCACCTTATTTTTTTCATCGTTCTTCTTCACTTTGTCCCTGTGTTTCCGCAAACAAACAACAGCAGAATCGATCAAGGTCAAGTGCTTAGAGATGGCGAAACCATTGTTTCCCCTACTCAGGTTTTCGAGCTCGGATTCTTCAGCCTTAGTAATCCAAGCTTTAAATACGTCGGAATCTGGTATTACGGATTTCAGAACCGAACAGTCGCGTGGATAGCGAATAGAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

808 aa · TkA08G414080|TK1151|PROTEIN

MSFTSKTQKSIHLIFFIVLLHFVPVFPQTNNSRIDQGQVLRDGETIVSPTQVFELGFFSLSNPSFKYVGIWYYGFQNRTVAWIANRNNPISGDSGVFSIGTDGSLIVSDRNDRVYWSSNSSSDSVGSNLTAMLMDNGNLMLSTVQNVGIDREAIWRSCDHPTDTYLPNQRIYLNITNGDSRNFVSWRSPNDPSEGNYSMGIDPRGSPQVVVHDDQSRRRLWRSGHWNNQIFIGIPQMRSLFLYGFNLVNVNDELMYFVFN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G414080
TK1151 IDTkA08G414080
OH-1004 IDLXL04_016429
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)45.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.792 / OH-1004 90.920
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G414080
位置Chr08:105418453-105422403 (+)
描述Similar to At4g27290: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g21390 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B120。 暂无已核实直接文献
At1g61610 推测G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g61610。 暂无已核实直接文献
At1g11350 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可抑制由细菌病原体如番茄叶绿假单胞菌（Pseudomonas syringae pv. tomato）触发的抗病信号通路。
An S-locus receptor-like kinase plays a role as a negative regulator in plant defense responses.2009 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2009.02.050
At1g11300 G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g11300。 暂无已核实直接文献
At1g11330 G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g11330。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016429 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G65790
ath:AT1G65800
ath:AT4G21380
ath:AT4G27290
ath:AT4G27300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.869
排名 1 · TkA08G414080 · TK1151
内质网0.080
排名 2 · TkA08G414080 · TK1151
细胞质0.070
排名 3 · TkA08G414080 · TK1151
细胞核0.040
排名 4 · TkA08G414080 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkA08G414080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09716ETRAMP12-33 aa
PF01453B_lectin79-187 aa
PF00954S_locus_glycop221-331 aa
PF01453B_lectin246-275 aa
PF08276PAN_2348-408 aa
PF09716ETRAMP382-461 aa
PF14914LRRC37AB_C434-457 aa
PF11346DUF3149446-463 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G414080PF09716ETRAMP12330.07513.7
TkA08G414080PF01453B_lectin791871.4e-2796.9
TkA08G414080PF00954S_locus_glycop2213311.2e-28100.6
TkA08G414080PF01453B_lectin2462751.4e-2796.9
TkA08G414080PF08276PAN_23484081.8e-1660.7
TkA08G414080PF09716ETRAMP3824610.07513.7
TkA08G414080PF14914LRRC37AB_C4344570.2611.9
TkA08G414080PF11346DUF31494464630.1112.7
TkA08G414080PF00069Pkinase5217885.8e-44151.2
TkA08G414080PF07714PK_Tyr_Ser-Thr5247894.9e-47161.1
TkA08G414080PF03109ABC15275500.0007519.4
TkA08G414080PF03109ABC15886710.0007519.4
TkA08G414080PF01636APH6366690.01316.0
TkA08G414080PF12330Haspin_kinase6376730.02414.4
TkA08G414080PF17667Pkinase_fungal6407090.1511.5
TkA08G414080PF17667Pkinase_fungal7677980.1511.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81906拟南芥sp|O81906|B120_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase B12053.000%Swiss-Prot高置信
Q9SY89拟南芥sp|Q9SY89|Y1661_ARATH Putative G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6161046.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LPZ9拟南芥sp|Q9LPZ9|SD113_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-1344.800%Swiss-Prot中等置信
Q9SXB4拟南芥sp|Q9SXB4|Y1130_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1130045.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SXB8拟南芥sp|Q9SXB8|Y1133_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1133043.900%Swiss-Prot中等置信

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