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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G394890
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 100712578-100716250 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2262 bp · TkA08G394890|TK1151|cDNA

ATAAAACCTAAGGAGGGGACCTAGAAATATTCTTCCTTACTCTCTTTCTCTCTCATCACCTCAAGACACACCAAATGAGAGACGAGCTGTAATCACATGGAGCTGTTTGTCTAATGGGGCCTCTCTCTCTTTCTCTCTCCCTCTTCATACCAATTATGAGCTAAGAATTTAAAAAAAGGAAAATATTTATTTACCATATCGATCGTCTGAACAGAGAAATGGCTGATGATAAGGTATCAACATCTTTCTGTACAATCCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1116 bp · TkA08G394890|TK1151|CDS

ATGTCGGCACAAGTTGTTGCTGGAAATGGAGCTGAAACTGGTCACATCATCTCCACCACAATTGGAGGCAAGAATGGAGAACCAAAGCAGACTGTGAGTTACATGGCAGAGCGAGTGGTAGGTGCTGGATCATTTGGAATAGTTTTCCAGGCAAAATGTCTAGAAACAGGGGAAACAGTGGCGATAAAAAAGGTATTACAGGACAAAAGATACAAGAACCGTGAGTTACAGCTAATGAGAACAATGGACCATCCAAATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

371 aa · TkA08G394890|TK1151|PROTEIN

MSAQVVAGNGAETGHIISTTIGGKNGEPKQTVSYMAERVVGAGSFGIVFQAKCLETGETVAIKKVLQDKRYKNRELQLMRTMDHPNVVSLKHCFYSTTTKDELFLNLVMEYVPETIFRVLKHHSDARQRMPLIYVKLYTYQIFRGLAYMHMVAGACHRDLKPQNVLVDPLTHEVKICDFGSAKMLVRGEANISYICSRFYRAPELIFGATEYTTSIDIWSAGCILAELLLGQPLFPGENAVDQLVEIIKVLGTPTREELR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G394890
TK1151 IDTkA08G394890
OH-1004 IDLXL04_034427
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 98.933
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G394890
位置Chr08:100712578-100716250 (-)
描述Similar to ASK7: Shaggy-related protein kinase eta
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g18710 油菜素甾醇信号转导途径的负调节因子，对植物生长很重要。
Regulation of brassinosteroid signaling by a GSK3/SHAGGY-like kinase.2002 · DOI: 10.1126/science.1065769
The GSK3-like kinase BIN2 phosphorylates and destabilizes BZR1, a positive regulator of the brassinosteroid signaling pathway in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1073/pnas.152342599
Two putative BIN2 substrates are nuclear components of brassinosteroid signaling.2002 · DOI: 10.1104/pp.102.010918
Brassinosteroid regulates stomatal development by GSK3-mediated inhibition of a MAPK pathway.2012 · DOI: 10.1038/nature10794
SPEECHLESS integrates brassinosteroid and stomata signalling pathways.2012 · DOI: 10.1038/ncb2471
Brassinosteroid-regulated GSK3/Shaggy-like kinases phosphorylate mitogen-activated protein (MAP) kinase kinases, which control stomata development in Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m112.384453
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175
POLAR-guided signalling complex assembly and localization drive asymmetric cell division.2018 · DOI: 10.1038/s41586-018-0714-x
At2g30980 可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。 暂无已核实直接文献
At1g06390 体外磷酸化 BSK1、BSK3、BSK5、BSK6、BSK8 和 BSK11。
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0205700 可能的丝氨酸-苏氨酸激酶，可能在花发育过程中充当油菜素甾醇 信号传导的负调节因子。
T-DNA tagged knockout mutation of rice OsGSK1, an orthologue of Arabidopsis BIN2, with enhanced tolerance to various abiotic stresses.2007 · DOI: 10.1007/s11103-007-9213-4
Os05g0207500 丝氨酸-苏氨酸激酶，充当油菜素甾醇 信号传导的负调节因子。
DWARF AND LOW-TILLERING acts as a direct downstream target of a GSK3/SHAGGY-like kinase to mediate brassinosteroid responses in rice.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.097394
OVATE Family Protein 8 Positively Mediates Brassinosteroid Signaling through Interacting with the GSK3-like Kinase in Rice.2016 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1006118
OsBZR1 turnover mediated by OsSK22-regulated U-box E3 ligase OsPUB24 in rice BR response.2019 · DOI: 10.1111/tpj.14332
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034427 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007033 vacuole organization 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010082 regulation of root meristem growth 生物过程
GO:0010508 positive regulation of autophagy 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G06390
ath:AT2G30980
ath:AT4G18710
dosa:Os01g0205700
dosa:Os05g0207500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.607
排名 1 · TkA08G394890 · TK1151
细胞核0.540
排名 2 · TkA08G394890 · TK1151
细胞膜0.069
排名 3 · TkA08G394890 · TK1151
线粒体0.043
排名 4 · TkA08G394890 · TK1151
内质网0.031
排名 5 · TkA08G394890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03109ABC127-66 aa
PF00069Pkinase35-318 aa
PF14531Kinase-like35-79 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr37-238 aa
PF01636APH95-125 aa
PF14531Kinase-like102-221 aa
PF03109ABC1107-185 aa
PF01636APH154-182 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G394890PF03109ABC127662.9e-0627.4
TkA08G394890PF00069Pkinase353183.8e-61207.5
TkA08G394890PF14531Kinase-like35790.002218.0
TkA08G394890PF07714PK_Tyr_Ser-Thr372386.5e-2691.9
TkA08G394890PF01636APH951250.02914.8
TkA08G394890PF14531Kinase-like1022210.002218.0
TkA08G394890PF03109ABC11071852.9e-0627.4
TkA08G394890PF01636APH1541820.02914.8
TkA08G394890PF12330Haspin_kinase1572120.1312.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39011拟南芥sp|Q39011|KSG7_ARATH Shaggy-related protein kinase eta86.400%Swiss-Prot高置信
Q39010拟南芥sp|Q39010|KSG6_ARATH Shaggy-related protein kinase zeta86.000%Swiss-Prot高置信
Q39012拟南芥sp|Q39012|KSG9_ARATH Shaggy-related protein kinase iota84.800%Swiss-Prot高置信
Q9LWN0水稻sp|Q9LWN0|GSK1_ORYSJ Shaggy-related protein kinase GSK185.100%Swiss-Prot高置信
Q60EZ2水稻sp|Q60EZ2|GSK2_ORYSJ Shaggy-related protein kinase GSK285.700%Swiss-Prot高置信

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