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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G326950
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 84198576-84199435 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

540 bp · TkA08G326950|TK1151|cDNA

TTCGGTACCGCCACCAAGAACTTCCGTCCAGATAGTATCGTCGGAGAAGAAGGCTTTGGTCGTGTTTTCAAAGCAAACCCCGGCACCGGTCAACTTATTGCGGTCAAAGTTCTTAAATCCGAATGCCATCAAGGTCATAGAGAGTGGCTGACAGAGGTCGATTACTTGGGAAAGCTTCGTCATAAAAATCTGGTTAAACTCATTGGGTATTGCGAGGAATGTGAAAACAGACTTTTGGTTTACGAGTTCATGCCAAAAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

540 bp · TkA08G326950|TK1151|CDS

TTCGGTACCGCCACCAAGAACTTCCGTCCAGATAGTATCGTCGGAGAAGAAGGCTTTGGTCGTGTTTTCAAAGCAAACCCCGGCACCGGTCAACTTATTGCGGTCAAAGTTCTTAAATCCGAATGCCATCAAGGTCATAGAGAGTGGCTGACAGAGGTCGATTACTTGGGAAAGCTTCGTCATAAAAATCTGGTTAAACTCATTGGGTATTGCGAGGAATGTGAAAACAGACTTTTGGTTTACGAGTTCATGCCAAAAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

179 aa · TkA08G326950|TK1151|PROTEIN

FGTATKNFRPDSIVGEEGFGRVFKANPGTGQLIAVKVLKSECHQGHREWLTEVDYLGKLRHKNLVKLIGYCEECENRLLVYEFMPKGCLENHLFRKGVEPISWAIRMRIAIDVAEGLSFLHSNEPDHIIYRDLKAANILLDSEFTARLSDFGLARIGPVGDNTHVSTRVVIQVRFYSLH

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G326950
TK1151 IDTkA08G326950
OH-1004 IDLXL04_004250
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)91.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.855 / OH-1004 43.415
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G326950
位置Chr08:84198576-84199435 (+)
描述Similar to PBL3: Probable serine/threonine-protein kinase PBL3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g02800 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At1g14370 参与抗病信号传导。
Receptor-like cytoplasmic kinases integrate signaling from multiple plant immune receptors and are targeted by a Pseudomonas syringae effector.2010 · DOI: 10.1016/j.chom.2010.03.007
xopAC-triggered immunity against Xanthomonas depends on Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinase genes PBL2 and RIPK.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0073469
The Decoy Substrate of a Pathogen Effector and a Pseudokinase Specify Pathogen-Induced Modified-Self Recognition and Immunity in Plants.2015 · DOI: 10.1016/j.chom.2015.08.004
Ligand-triggered allosteric ADP release primes a plant NLR complex.2019 · DOI: 10.1126/science.aav5868
At1g69790 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At1g26970 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At5g02290 可能在植物生长和发育的调节中发挥作用（可能）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004250 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0062207 regulation of pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14370
ath:AT1G26970
ath:AT1G69790
ath:AT2G02800
dosa:Os05g0110900
osa:4337593
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.468
排名 1 · TkA08G326950 · TK1151
细胞膜0.423
排名 2 · TkA08G326950 · TK1151
细胞核0.239
排名 3 · TkA08G326950 · TK1151
高尔基体0.055
排名 4 · TkA08G326950 · TK1151
内质网0.049
排名 5 · TkA08G326950 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase11-160 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr13-177 aa
PF03109ABC119-61 aa
PF03418Peptidase_A2538-84 aa
PF12260PIP49_C64-150 aa
PF03418Peptidase_A25120-160 aa
PF03109ABC1125-155 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G326950PF00069Pkinase111601.2e-29104.2
TkA08G326950PF07714PK_Tyr_Ser-Thr131774.9e-31108.7
TkA08G326950PF03109ABC119610.01615.1
TkA08G326950PF03418Peptidase_A2538840.3410.5
TkA08G326950PF12260PIP49_C641500.1512.4
TkA08G326950PF03418Peptidase_A251201600.3410.5
TkA08G326950PF03109ABC11251550.01615.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O49840拟南芥sp|O49840|PBL3_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL364.400%Swiss-Prot高置信
O49839拟南芥sp|O49839|PBL2_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL263.300%Swiss-Prot高置信
Q5XF79拟南芥sp|Q5XF79|PBL18_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL1861.800%Swiss-Prot高置信
Q5PP29拟南芥sp|Q5PP29|PBL4_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL461.500%Swiss-Prot高置信
P43293拟南芥sp|P43293|PBL11_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL1162.800%Swiss-Prot高置信

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