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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G278990
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 72517140-72522477 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4131 bp · TkA08G278990|TK1151|cDNA

AATTTTACCTAGTTTGACATTATCATTAATAGTTCTTGTTTTTTCAGCAGGTGAATTCAAAGATAGTGTAAATCTTATAAGTTCTCAAATGGCTGACCTGCTAGTAGGTTTTGCTAGTAATGTGTTAGCTAAACTTGGAGAAAAGCTTTTTGTTGCAACTGGTCGTCACCTAAGATATGTACTTTACTATAACAACTACATTCAAATTCTAGAAAAAGAAGTGGACAAATTAATGGTAAAATCACAAGATATCAAACGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

3960 bp · TkA08G278990|TK1151|CDS

ATGGCTGACCTGCTAGTAGGTTTTGCTAGTAATGTGTTAGCTAAACTTGGAGAAAAGCTTTTTGTTGCAACTGGTCGTCACCTAAGATATGTACTTTACTATAACAACTACATTCAAATTCTAGAAAAAGAAGTGGACAAATTAATGGTAAAATCACAAGATATCAAACGAGAAGTTGATATAGCACTAAGAAACGGAGAAATCATTTCATCCGAGGTTGAACAATGGTTTTCAAATTTGGATGCTATCTATGAAGATTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1319 aa · TkA08G278990|TK1151|PROTEIN

MADLLVGFASNVLAKLGEKLFVATGRHLRYVLYYNNYIQILEKEVDKLMVKSQDIKREVDIALRNGEIISSEVEQWFSNLDAIYEDSTTFLNTEVPKNKGILNGRFPNIRKRYILSKKAKKKTKKAATLEAETIHKISYPAPPLTVGDRSIGDFKNFESRTPTINRLMDLLKDETRQIISICGMGGSGKTTMVKEVARRVKGDKLFDEIVLALVSKEHDLWKVQEDLGNELGLRFKTTTFKGRANELWKRLLQSKKGNLV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G278990
TK1151 IDTkA08G278990
OH-1004 IDLXL04_035536
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)29.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 86.657 / OH-1004 84.942
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G278990
位置Chr08:72517140-72522477 (+)
描述Similar to At4g27220: Probable disease resistance protein At4g27220
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27190 抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g27220 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g10780 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g61300 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g61180 通过水杨酸（SA）信号通路参与病害抵抗。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035536 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0000166 nucleotide binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12220
ath:AT4G26090
ath:AT4G27190
ath:AT4G27220
ath:AT5G05400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.616
排名 1 · TkA08G278990 · TK1151
细胞质0.243
排名 2 · TkA08G278990 · TK1151
细胞核0.182
排名 3 · TkA08G278990 · TK1151
内质网0.099
排名 4 · TkA08G278990 · TK1151
细胞外0.037
排名 5 · TkA08G278990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598LRR_1427-49 aa
PF01637ATPase_229-74 aa
PF25199nSTAND_NTPase548-91 aa
PF13245AAA_19116-144 aa
PF13604AAA_30116-139 aa
PF00730HhH-GPD154-255 aa
PF01637ATPase_2159-352 aa
PF13191AAA_16160-208 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G278990PF23598LRR_1427496.6e-0625.8
TkA08G278990PF01637ATPase_229743.7e-0730.9
TkA08G278990PF25199nSTAND_NTPase548910.03414.7
TkA08G278990PF13245AAA_191161440.1512.9
TkA08G278990PF13604AAA_301161390.1912.1
TkA08G278990PF00730HhH-GPD1542550.2912.2
TkA08G278990PF01637ATPase_21593523.7e-0730.9
TkA08G278990PF13191AAA_161602080.000621.1
TkA08G278990PF20720nSTAND31612710.01316.0
TkA08G278990PF25201nSTAND61622010.2412.1
TkA08G278990PF00931NB-ARC1633263.4e-29102.3
TkA08G278990PF25199nSTAND_NTPase51682010.03414.7
TkA08G278990PF03215Rad171691990.07413.7
TkA08G278990PF13401AAA_221742650.000222.4
TkA08G278990PF13604AAA_301742160.1912.1
TkA08G278990PF13173AAA_141762670.06913.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9T048拟南芥sp|Q9T048|DRL27_ARATH Disease resistance protein At4g2719028.000%Swiss-Prot低置信
O81825拟南芥sp|O81825|DRL28_ARATH Probable disease resistance protein At4g2722024.900%Swiss-Prot低置信
O82484拟南芥sp|O82484|DRL23_ARATH Putative disease resistance protein At4g1078025.800%Swiss-Prot低置信
O64790拟南芥sp|O64790|DRL17_ARATH Probable disease resistance protein At1g6130027.400%Swiss-Prot低置信
Q940K0拟南芥sp|Q940K0|UNI_ARATH Disease resistance protein UNI26.100%Swiss-Prot低置信

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