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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G213620
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 55887427-55890353 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1254 bp · TkA08G213620|TK1151|cDNA

AGCATAAGTCTTGTTACACAAGTATCTTGCCATCTACGCGTTTATTCTATATAACATATCCTTTCATTCCCTTCATTTTCCCTCTTTCTAAACCCAAACTCGTCACTTTTTTTCTTCATTTCTGCATAAATCACCTTCGTCGGAGATAAAGATTCAACATAGCTTACACTTCCGATCGACCTATCAACTAGTTGATTTCCAGAAGTGACATAAACTAATTGATTTCTGATAGTTTTTTTTTGTAAACATGTACATGGAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

744 bp · TkA08G213620|TK1151|CDS

ATGTACATGGAAAGATCAGACATGGTGGAAAACGTAAACGACGAAGGAGACGATGCAGTGATCGGACTTCCTCCTGGATTCCGATTTCATCCAACTGATGAAGAAATCGTCACTCATTATCTAACACCTAAAGTTCTCAACCGGAGGTTCACCGCTAGTGCAATCGGAGAAGCTGATCTTAACAAGTCCGAGCCATGGGATCTACCAAAGAAAGCTAAGATGGGAGAGAAGGAATGGTTCTTCTTTTGTCAGAGAGATCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

247 aa · TkA08G213620|TK1151|PROTEIN

MYMERSDMVENVNDEGDDAVIGLPPGFRFHPTDEEIVTHYLTPKVLNRRFTASAIGEADLNKSEPWDLPKKAKMGEKEWFFFCQRDRKYPTGTRTNRATESGYWKATGKDREIFRPAGNLVGMKKTLVFYIGRAPKGEKTNWVIHEFRLEGKFSYYNMATPSHSQDEWVVSRVFHKNTGAQKNPITDTRLTNYSFVEDILDGPSILPPLLDHSALHVDRSFDREPFYFSHGHEGTSSFSDLDPLLDY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G213620
TK1151 IDTkA08G213620
OH-1004 IDLXL04_004734
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 87.449 / OH-1004 53.598
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G213620
位置Chr08:55887427-55890353 (+)
描述Similar to NAC087: NAC domain-containing protein 87
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g04060 转录激活因子，作为叶片衰老的正向调控因子。 暂无已核实直接文献
At5g18270 结合于参与叶绿素分解过程基因的启动子区域，如NYC1、SGR1、SGR2和PAO。 暂无已核实直接文献
At5g07680 含NAC结构域的蛋白79。 暂无已核实直接文献
At5g61430 结合于参与叶绿素分解过程基因的启动子区域，如NYC1、SGR1、SGR2和PAO。 暂无已核实直接文献
At5g39610 转录激活因子，可结合靶基因启动子上的特定双部分基序 5'-[ACG][CA]GT[AG](5-6n)[CT]AC[AG]-3'。
The delayed leaf senescence mutants of Arabidopsis, ore1, ore3, and ore9 are tolerant to oxidative stress.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch110
Trifurcate feed-forward regulation of age-dependent cell death involving miR164 in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1126/science.1166386
Forward and reverse genetics to identify genes involved in the age-related resistance response in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1364-3703.2009.00557.x
A gene regulatory network controlled by the NAC transcription factor ANAC092/AtNAC2/ORE1 during salt-promoted senescence.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04151.x
ORS1, an H₂O₂-responsive NAC transcription factor, controls senescence in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1093/mp/ssq080
NAC transcription factor ORE1 and senescence-induced BIFUNCTIONAL NUCLEASE1 (BFN1) constitute a regulatory cascade in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1093/mp/sst012
ORE1 balances leaf senescence against maintenance by antagonizing G2-like-mediated transcription.2013 · DOI: 10.1038/embor.2013.24

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004734 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G04060
ath:AT5G07680
ath:AT5G18270
ath:AT5G39610
ath:AT5G61430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.915
排名 1 · TkA08G213620 · TK1151
细胞质0.139
排名 2 · TkA08G213620 · TK1151
细胞膜0.054
排名 3 · TkA08G213620 · TK1151
内质网0.050
排名 4 · TkA08G213620 · TK1151
质体0.018
排名 5 · TkA08G213620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26493DUF816114-47 aa
PF02365NAM24-149 aa
PF26493DUF8161140-152 aa
PF26493DUF8161159-183 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G213620PF26493DUF816114470.03814.4
TkA08G213620PF02365NAM241492.8e-49167.4
TkA08G213620PF26493DUF81611401520.03814.4
TkA08G213620PF26493DUF81611591830.03814.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SQQ6拟南芥sp|Q9SQQ6|NAC46_ARATH NAC domain-containing protein 4669.600%Swiss-Prot高置信
Q9FK44拟南芥sp|Q9FK44|NAC87_ARATH NAC domain-containing protein 8768.300%Swiss-Prot高置信
Q9FLR3拟南芥sp|Q9FLR3|NAC79_ARATH NAC domain-containing protein 7964.600%Swiss-Prot高置信
Q9FLJ2拟南芥sp|Q9FLJ2|NC100_ARATH NAC domain-containing protein 10066.500%Swiss-Prot高置信
Q9FKA0拟南芥sp|Q9FKA0|NAC92_ARATH NAC domain-containing protein 9255.400%Swiss-Prot高置信

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