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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G206150
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 53853249-53856138 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2503 bp · TkA08G206150|TK1151|cDNA

CAAAACTATACGTTTACGGACACAAAATACATATATTTGAGCACGCAAATATTTTCATAAAAACGGTATGAAAGTTGCAACAGAAAAACCCGTCACGTCCCCCTTTCCTCCTACGTCCACCGCCCTCCGCCCTTCTATCATCTCAATCCATTTCCGCCATAGCAACACATATGAATTTTCAGAAATGAAGCATAAAAGATCCACGTTCAAATCCCTAAATTTGATATCAACGAATACCGCATACATTCCATTTGCTAAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1752 bp · TkA08G206150|TK1151|CDS

ATGGGAAATTGCATAAAGGGTTTATGCTGGCGTCGATCACAGCCTCCAAATCGAAATGAGCCAGATTCGGCGAACAAACAAATCAAAGATCCTCCACCTCCGCAACATACACCGCCACAACAGGAGACAATAACTCAACATCCACCGCCACAATCAGAACCACCACTAGAAAAACCGACTGAACAACAACAAGATATAATCAAGATAGACAAAAAGCCATCCAGAAAGGTCTCAATAGCAAACCCACAACCCAAACACAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

583 aa · TkA08G206150|TK1151|PROTEIN

MGNCIKGLCWRRSQPPNRNEPDSANKQIKDPPPPQHTPPQQETITQHPPPQSEPPLEKPTEQQQDIIKIDKKPSRKVSIANPQPKHTQSVKKPQEVKRMLSAGLQNRVLKTKTGNLKDLYLLGKKLGNGQFGTTYLCKEKSTNKEFACKAIAKRKLVTDEDVEDVRREIEIMHHISGHPNVVSIKGAYEDAVSVYLVMELCGGGELFDRIIEKGHYSERKAADLAKVIVSVIEACHSNGVMHRDLKPENFLFVDNSEDSL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G206150
TK1151 IDTkA08G206150
OH-1004 IDLXL04_032806
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.942 / OH-1004 90.205
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G206150
位置Chr08:53853249-53856138 (-)
描述Similar to CPK10: Calcium-dependent protein kinase 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g04870 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
A calcium-dependent protein kinase can inhibit a calmodulin-stimulated Ca2+ pump (ACA2) located in the endoplasmic reticulum of Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.11.6224
At3g10660 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0788500 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os12g0486600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os03g0789000 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032806 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0043067 regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:1900055 regulation of leaf senescence 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005778 peroxisomal membrane 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G10660
ath:AT5G04870
dosa:Os03g0788500
dosa:Os03g0789000
dosa:Os12g0486600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.455
排名 1 · TkA08G206150 · TK1151
细胞膜0.428
排名 2 · TkA08G206150 · TK1151
细胞核0.194
排名 3 · TkA08G206150 · TK1151
高尔基体0.112
排名 4 · TkA08G206150 · TK1151
内质网0.074
排名 5 · TkA08G206150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase122-378 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr122-372 aa
PF04558tRNA_synt_1c_R1138-163 aa
PF01636APH150-208 aa
PF03109ABC1194-273 aa
PF06293Kdo214-266 aa
PF14531Kinase-like224-366 aa
PF23564EF-hand_FSTL1235-266 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G206150PF00069Pkinase1223781.2e-79268.2
TkA08G206150PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1223725.3e-2795.5
TkA08G206150PF04558tRNA_synt_1c_R11381630.2112.2
TkA08G206150PF01636APH1502080.006816.9
TkA08G206150PF03109ABC11942730.001118.9
TkA08G206150PF06293Kdo2142660.009616.1
TkA08G206150PF14531Kinase-like2243660.009116.0
TkA08G206150PF23564EF-hand_FSTL12352660.00219.2
TkA08G206150PF01636APH2382690.006816.9
TkA08G206150PF13405EF-hand_63593738.1e-2688.0
TkA08G206150PF13833EF-hand_84064483.8e-2072.1
TkA08G206150PF20742DUF5580_M4074840.0001522.5
TkA08G206150PF12763EH4164464.9e-0936.7
TkA08G206150PF12763EH4184854.9e-0936.7
TkA08G206150PF25825SAPC2_N4184857.1e-0523.3
TkA08G206150PF00069Pkinase4194621.2e-79268.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q06850拟南芥sp|Q06850|CDPK1_ARATH Calcium-dependent protein kinase 174.500%Swiss-Prot高置信
Q38870拟南芥sp|Q38870|CDPK2_ARATH Calcium-dependent protein kinase 272.000%Swiss-Prot高置信
Q6F3A6水稻sp|Q6F3A6|CDPKA_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1073.200%Swiss-Prot高置信
Q2QQR2水稻sp|Q2QQR2|CDPKR_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2772.100%Swiss-Prot高置信
Q852N6水稻sp|Q852N6|CDPKB_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1163.600%Swiss-Prot高置信

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