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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G205430
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 53667959-53671031 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2514 bp · TkA08G205430|TK1151|cDNA

GCTAAAAGTTATAGTTAAGTACCAAATCCGTAATTCATATAACCACAAGGACCAAGTCTGTCGTTTACCTTAAAAAGAATTCACCTCGTTGAGTTGACACAGTTAACTCGTCCACTATCATTTCCCCCCATTTTCTCCATCACCATTTTCCAATTCTCTTTGATTTACATTTTCCCTAATTTCCACTCCTTTTACCGGCACTAATCATCTGCCAATTTCCATTTTCCTTCAGGGAATTAGGGTTTCTGATTGATACTAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1758 bp · TkA08G205430|TK1151|CDS

ATGGGAAATAATTGCGTGCAGGGGCCCCAGCGTACTGGCTTTTTTTCATCTGTTACAGCAGCAGTCTGGAAAAACCGGCCACCGGCGAACTCTCTTCCCCCTCCCAATTCCAACGATCCGTCCACCCAAAACAAGAACAACAACAATGCCAACGACAAGAAACCAGATGATCCGAGTCACAAGGAATCTGAAAAACCACGAGATGTGCAAAGTACCCCGCCAGGTGCTGTTAAAATGTCAGAACAGGAGGCGGCTAAATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

585 aa · TkA08G205430|TK1151|PROTEIN

MGNNCVQGPQRTGFFSSVTAAVWKNRPPANSLPPPNSNDPSTQNKNNNNANDKKPDDPSHKESEKPRDVQSTPPGAVKMSEQEAAKSGDKAKVTDDKARAQDKPKAATNFKRVQSMGLKDSVLQRRTGNMKEVYSMGKKLGQGQFGTTFLCTEKESGKEFACKSIAKRKLTTKEDVEDVRREIQIMHHLAGHPNVINIVGAYEDAVAVHVVMELCAGGELFDRIIQRGHYTEKKAAELARIIVGVVESCHSLGVMHRDLK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G205430
TK1151 IDTkA08G205430
OH-1004 IDLXL04_032800
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G205430
位置Chr08:53667959-53671031 (+)
描述Similar to CPK20: Calcium-dependent protein kinase 20
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g38910 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g04870 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
A calcium-dependent protein kinase can inhibit a calmodulin-stimulated Ca2+ pump (ACA2) located in the endoplasmic reticulum of Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.11.6224

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0789000 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os07g0161600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os03g0788500 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032800 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0043067 regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:1900055 regulation of leaf senescence 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005778 peroxisomal membrane 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G38910
ath:AT3G10660
ath:AT5G04870
dosa:Os03g0788500
dosa:Os03g0789000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.625
排名 1 · TkA08G205430 · TK1151
细胞质0.343
排名 2 · TkA08G205430 · TK1151
细胞核0.177
排名 3 · TkA08G205430 · TK1151
高尔基体0.083
排名 4 · TkA08G205430 · TK1151
内质网0.067
排名 5 · TkA08G205430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15912VIR_N13-93 aa
PF30130VID28_C41-128 aa
PF14531Kinase-like129-191 aa
PF00069Pkinase134-392 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr136-387 aa
PF01636APH147-221 aa
PF04558tRNA_synt_1c_R1152-177 aa
PF06293Kdo176-280 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G205430PF15912VIR_N13930.4610.6
TkA08G205430PF30130VID28_C411280.559.7
TkA08G205430PF14531Kinase-like1291914.9e-0626.7
TkA08G205430PF00069Pkinase1343925.3e-78262.8
TkA08G205430PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1363871.1e-2694.4
TkA08G205430PF01636APH1472210.004117.6
TkA08G205430PF04558tRNA_synt_1c_R11521770.05814.1
TkA08G205430PF06293Kdo1762800.0007619.7
TkA08G205430PF14531Kinase-like2213804.9e-0626.7
TkA08G205430PF29176Allatotropin-like_C2372430.04114.2
TkA08G205430PF01636APH2522820.004117.6
TkA08G205430PF20742DUF5580_M4204990.007317.1
TkA08G205430PF13833EF-hand_84224613.4e-1865.8
TkA08G205430PF12763EH4325091.7e-0731.8
TkA08G205430PF25825SAPC2_N4325000.02415.2
TkA08G205430PF21008AIF-14345023e-0834.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZV15拟南芥sp|Q9ZV15|CDPKK_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2070.800%Swiss-Prot高置信
Q06850拟南芥sp|Q06850|CDPK1_ARATH Calcium-dependent protein kinase 160.400%Swiss-Prot高置信
Q852N6水稻sp|Q852N6|CDPKB_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1178.000%Swiss-Prot高置信
Q7XIM0水稻sp|Q7XIM0|CDPKH_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1766.300%Swiss-Prot高置信
Q6F3A6水稻sp|Q6F3A6|CDPKA_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1061.200%Swiss-Prot高置信

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