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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G194780
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 50886873-50891667 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3084 bp · TkA08G194780|TK1151|cDNA

CAACAATCATCAGCTCAATTAGGCATTATTATTTGATTCGCAGATCTTGCAAAGCGATTATGTACAGCAGCAGAACTTCGAGTATACTTCACGAGTTTTATAAACAAAGTCGATGATTCCGCTAAAAGCATTTCGCAAGCTCATTTCCTGGACCCTAACAGAAACTGTAATCTGACATCATGGACCAGTGGATGCGAGCCAGGATGGGCTAGCGCCGTCAATCCTGGCCAGAAATATGAATTCAACGAAACAAATCCACG...

CDS

下载 CDS FASTA

3240 bp · TkA08G194780|TK1151|CDS

ATGCACGAGAAAATGAATGGAGAGAAAAAGACAATCACCTCTTCGGTTGGATGTTTGATCCTCATTCTGGTTTTTTCCGGTTATTTTCCACGATGCGTTTGGTGTCAAGACGACCCCGATGATCCTCCTGTGAACAATAAACGACCTAGGATTTCACCATTGTTTTCGAATTTCCTTTCTCAACAATTCAACAAGTCGATTAGGAAATACAAGGCTTCAATTAAAAGAACCCTACACTATTGCACTGAAGATGTGGACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1079 aa · TkA08G194780|TK1151|PROTEIN

MHEKMNGEKKTITSSVGCLILILVFSGYFPRCVWCQDDPDDPPVNNKRPRISPLFSNFLSQQFNKSIRKYKASIKRTLHYCTEDVDKDISGAFNFEGKDEFFTNCQVKFKDLAKRLCTAAELRVYFTSFINKVDDSAKSISQAHFLDPNRNCNLTSWTSGCEPGWASAVNPGQKYEFNETNPRKIPFRTDNSQPCCEGFFCPQGLTCMIPCPLGAYCPVAKLDKKSGICDPYHYQQPAGKPNYTCGSADMWGPVQMGSDM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G194780
TK1151 IDTkA08G194780
OH-1004 IDLXL04_032660
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 97.913
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G194780
位置Chr08:50886873-50891667 (-)
描述Similar to WBC30: Putative white-brown complex homolog protein 30
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g60740 ABC转运蛋白G家族成员28。 暂无已核实直接文献
At2g37010 推定白-棕复合体同源蛋白30。 暂无已核实直接文献
At1g53390 ABC 转运蛋白 G 家族成员 24。 暂无已核实直接文献
At1g31770 植物生长的正调节剂，充当外排泵，参与主要的根到芽长距离细胞分裂素通过木质部汁液的运输。
ABCG9, ABCG11 and ABCG14 ABC transporters are required for vascular development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12334
Arabidopsis ABCG14 protein controls the acropetal translocation of root-synthesized cytokinins.2014 · DOI: 10.1038/ncomms4274
Arabidopsis ABCG14 is essential for the root-to-shoot translocation of cytokinin.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1321519111
Cytokinin Response Factor 6 Represses Cytokinin-Associated Genes during Oxidative Stress.2016 · DOI: 10.1104/pp.16.00415
A Role of Cytokinin Transporter in Arabidopsis Immunity.2017 · DOI: 10.1094/mpmi-01-17-0011-r

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B9G5Y5 ABC 转运蛋白 G 家族成员 25。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032660 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000082 G1/S transition of mitotic cell cycle 生物过程
GO:0000266 mitochondrial fission 生物过程
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0001708 cell fate specification 生物过程
GO:0001894 tissue homeostasis 生物过程
GO:0006473 protein acetylation 生物过程
GO:0006568 L-tryptophan metabolic process 生物过程
GO:0006778 porphyrin-containing compound metabolic process 生物过程
GO:0006783 heme biosynthetic process 生物过程
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53390
ath:AT2G37010
ath:AT5G60740
dosa:Os10g0442900
rno:312382
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.794
排名 1 · TkA08G194780 · TK1151
细胞质0.136
排名 2 · TkA08G194780 · TK1151
内质网0.085
排名 3 · TkA08G194780 · TK1151
溶酶体／液泡0.052
排名 4 · TkA08G194780 · TK1151
高尔基体0.047
排名 5 · TkA08G194780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09534Trp_oprn_chp303-364 aa
PF16038TMIE305-381 aa
PF01956EMC3_TMCO1308-481 aa
PF11364DUF3165312-326 aa
PF28933CRE9315-471 aa
PF13304AAA_21360-409 aa
PF13476AAA_23363-472 aa
PF00005ABC_tran370-370 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G194780PF09534Trp_oprn_chp3033640.02815.0
TkA08G194780PF16038TMIE3053810.06113.8
TkA08G194780PF01956EMC3_TMCO13084810.8710.1
TkA08G194780PF11364DUF31653123268.27.7
TkA08G194780PF28933CRE93154710.0414.8
TkA08G194780PF13304AAA_213604090.0004121.1
TkA08G194780PF13476AAA_233634720.1113.9
TkA08G194780PF00005ABC_tran3703701.2e-2488.2
TkA08G194780PF19055ABC2_membrane_73823823.2e-177590.2
TkA08G194780PF00485PRK4284850.006317.1
TkA08G194780PF13604AAA_305075460.09413.2
TkA08G194780PF02463SMC_N5116820.05313.7
TkA08G194780PF00005ABC_tran5156661.2e-2488.2
TkA08G194780PF03193RsgA_GTPase5165480.009416.5
TkA08G194780PF13481AAA_255165490.03714.4
TkA08G194780PF13401AAA_225255480.6111.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FF46拟南芥sp|Q9FF46|AB28G_ARATH ABC transporter G family member 2855.000%Swiss-Prot高置信
Q9SJK6拟南芥sp|Q9SJK6|WBC30_ARATH Putative white-brown complex homolog protein 3054.600%Swiss-Prot高置信
Q9MAG3拟南芥sp|Q9MAG3|AB24G_ARATH ABC transporter G family member 2451.500%Swiss-Prot高置信
Q9C6W5拟南芥sp|Q9C6W5|AB14G_ARATH ABC transporter G family member 1445.900%Swiss-Prot低置信
B9G5Y5水稻sp|B9G5Y5|AB25G_ORYSJ ABC transporter G family member 2546.600%Swiss-Prot中等置信

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