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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G174580
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 45658033-45660507 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1113 bp · TkA08G174580|TK1151|cDNA

ATGAAATTTGATGGGCCAATCATTGTGGGCGCTGGCCCTTCTGGCATAGCAGTTGCAGCTTGCCTTAAGCATAAAACTTATGATCGTTTGAAGCTTCATCTTCCTAAACAATTCTGCGAGCTTCCATTGTTTGGGTACCCAAAGAATTTCCCAAAGTACCCGACGAAAAAACAGTTTGTTTCTTATATGGAGGCATACGCAAAGCACTTTGAAATCAAACCGAAGTTCAACCAATCGGTGTCTAGAGCAGAGTTTGACGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1113 bp · TkA08G174580|TK1151|CDS

ATGAAATTTGATGGGCCAATCATTGTGGGCGCTGGCCCTTCTGGCATAGCAGTTGCAGCTTGCCTTAAGCATAAAACTTATGATCGTTTGAAGCTTCATCTTCCTAAACAATTCTGCGAGCTTCCATTGTTTGGGTACCCAAAGAATTTCCCAAAGTACCCGACGAAAAAACAGTTTGTTTCTTATATGGAGGCATACGCAAAGCACTTTGAAATCAAACCGAAGTTCAACCAATCGGTGTCTAGAGCAGAGTTTGACGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

370 aa · TkA08G174580|TK1151|PROTEIN

MKFDGPIIVGAGPSGIAVAACLKHKTYDRLKLHLPKQFCELPLFGYPKNFPKYPTKKQFVSYMEAYAKHFEIKPKFNQSVSRAEFDVQVGVWRVNTQDSVYESRWLVVATGENAEAVVPEIQGIDKFEGVVRHTSEYKSGCEFRKQRVLVVGCGNSGMEVSLDLCRYNASPFMVVRNSVHVLPREMFGFPTFGIAMGLLKWLPLRVVDKFILFMANLTLGSTDKLGLRRPKTGPLELKNATGKTPVLDTGALSLIKSGNI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G174580
TK1151 IDTkA08G174580
OH-1004 IDLXL04_025866
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)58.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.946 / OH-1004 88.993
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G174580
位置Chr08:45658033-45660507 (+)
描述Similar to YUC6: Indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g11320 参与生长素生物合成。
Auxin biosynthesis by the YUCCA flavin monooxygenases controls the formation of floral organs and vascular tissues in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1101/gad.1415106
Auxin synthesized by the YUCCA flavin monooxygenases is essential for embryogenesis and leaf formation in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053009
At4g32540 参与生长素生物合成，但不参与色胺或 CYP79B2/B3 分支。
A role for flavin monooxygenase-like enzymes in auxin biosynthesis.2001 · DOI: 10.1126/science.291.5502.306
Auxin biosynthesis by the YUCCA flavin monooxygenases controls the formation of floral organs and vascular tissues in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1101/gad.1415106
Auxin synthesized by the YUCCA flavin monooxygenases is essential for embryogenesis and leaf formation in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053009
Reassessing the role of N-hydroxytryptamine in auxin biosynthesis.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.165803
Allelic analyses of the Arabidopsis YUC1 locus reveal residues and domains essential for the functions of YUC family of flavin monooxygenases.2011 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2010.01007.x
Conversion of tryptophan to indole-3-acetic acid by TRYPTOPHAN AMINOTRANSFERASES OF ARABIDOPSIS and YUCCAs in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1073/pnas.1108436108
The main auxin biosynthesis pathway in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1073/pnas.1108434108
The Arabidopsis YUCCA1 flavin monooxygenase functions in the indole-3-pyruvic acid branch of auxin biosynthesis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.088047
At4g13260 参与生长素生物合成。
Auxin biosynthesis by the YUCCA flavin monooxygenases controls the formation of floral organs and vascular tissues in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1101/gad.1415106
At1g04180 参与生长素生物合成。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0645400 参与生长素生物合成。
Auxin biosynthesis by the YUCCA genes in rice.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.091561
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025866 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009635 response to herbicide 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009819 drought recovery 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04180
ath:AT1G04610
ath:AT4G13260
ath:AT5G11320
ath:AT5G25620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.292
排名 1 · TkA08G174580 · TK1151
线粒体0.226
排名 2 · TkA08G174580 · TK1151
内质网0.139
排名 3 · TkA08G174580 · TK1151
细胞核0.120
排名 4 · TkA08G174580 · TK1151
过氧化物酶体0.112
排名 5 · TkA08G174580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13738Pyr_redox_37-28 aa
PF07992Pyr_redox_27-182 aa
PF13434Lys_Orn_oxgnase7-26 aa
PF13454NAD_binding_97-33 aa
PF00070Pyr_redox7-24 aa
PF03486HI0933_like7-25 aa
PF01134GIDA7-24 aa
PF01266DAO7-23 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G174580PF13738Pyr_redox_37282.6e-2796.6
TkA08G174580PF07992Pyr_redox_271821.2e-1455.1
TkA08G174580PF13434Lys_Orn_oxgnase7261.7e-1351.1
TkA08G174580PF13454NAD_binding_97332.1e-0525.2
TkA08G174580PF00070Pyr_redox7240.000521.2
TkA08G174580PF03486HI0933_like7250.0005420.3
TkA08G174580PF01134GIDA7240.005316.6
TkA08G174580PF01266DAO7230.0215.2
TkA08G174580PF01946Thi47250.2311.4
TkA08G174580PF01494FAD_binding_37230.2411.3
TkA08G174580PF13450NAD_binding_88270.212.7
TkA08G174580PF00743FMO-like413011.8e-2280.2
TkA08G174580PF03486HI0933_like501140.0005420.3
TkA08G174580PF13738Pyr_redox_3521782.6e-2796.6
TkA08G174580PF13434Lys_Orn_oxgnase521671.7e-1351.1
TkA08G174580PF13454NAD_binding_9531112.1e-0525.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LFM5拟南芥sp|Q9LFM5|YUC4_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA470.400%Swiss-Prot高置信
Q9SZY8拟南芥sp|Q9SZY8|YUC1_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA163.900%Swiss-Prot高置信
Q9SVQ1拟南芥sp|Q9SVQ1|YUC2_ARATH Indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA258.100%Swiss-Prot高置信
O64489拟南芥sp|O64489|YUC9_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA955.000%Swiss-Prot高置信
A0A0P0V5U9水稻sp|A0A0P0V5U9|YUC1_ORYSJ Indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA160.500%Swiss-Prot高置信

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