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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G170190
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 44518680-44524446 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2199 bp · TkA08G170190|TK1151|cDNA

CTAGAGTCTTCTCTTCCCTCTCATTTTCACCCAAATTGAGGAGAATAGTGATTTGTTGGTCAAACTAGGGTTAAAGGTTGGATTAAGGTGCAATGTAAGAAGAAAGGTTAATCTAGCGTCCTAAAGGCATCGTAAGGCAGCCATGGCAGATCCTCCCAGTACTCATCCTCCGACTCATTTCTTCAAGTTCGTCCGTCCAGGCTACTTATTTAAGCTTTCGATTCCAAGATCTTTTATGACGATCATGAACGGAAAGAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1632 bp · TkA08G170190|TK1151|CDS

ATGGCAGATCCTCCCAGTACTCATCCTCCGACTCATTTCTTCAAGTTCGTCCGTCCAGGCTACTTATTTAAGCTTTCGATTCCAAGATCTTTTATGACGATCATGAACGGAAAGAGATGCTCGAAAGCAATACTGAGACGTGGGCGTCGCGAATGGTCGGTAAACATTGACGACAAGGGTTTTGGTGACGGTTGGAAGAGGTTTGTGACAGAGAATGGAGTGCAAGAGCGTGACTTTATTTTCTTCAAAAATCAAGGAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

543 aa · TkA08G170190|TK1151|PROTEIN

MADPPSTHPPTHFFKFVRPGYLFKLSIPRSFMTIMNGKRCSKAILRRGRREWSVNIDDKGFGDGWKRFVTENGVQERDFIFFKNQGSMVFDVFVCDQFTSCEKDYPNLFDEMEGEEHLTESDTIRTQEPKKLKKRKRNEEKIQVSDDSGCFISIMTPYVMNKSRLYVPKKFAKSNGLITERIYKQVYLEDDTQRSWPATLHKSKSKLFLTGWHKFRINNHLEVGDMCRFKLVQNGEVPVFKCSKIEKNFTKNHTEVKETS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G170190
TK1151 IDTkA08G170190
OH-1004 IDLXL04_032377
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.263 / OH-1004 90.741
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G170190
位置Chr08:44518680-44524446 (+)
描述Similar to REM17: B3 domain-containing protein REM17
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g24645 含 B3 域的蛋白 REM14。 暂无已核实直接文献
At1g26680 含 B3 结构域的蛋白质 REM17。 暂无已核实直接文献
At2g24690 含B3结构域的REM样1蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g24700 含 B3 结构域的蛋白 REM10。 暂无已核实直接文献
At4g00260 推定的含B3结构域蛋白 REM15。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032377 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26680
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.972
排名 1 · TkA08G170190 · TK1151
细胞质0.063
排名 2 · TkA08G170190 · TK1151
细胞膜0.020
排名 3 · TkA08G170190 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA08G170190 · TK1151
线粒体0.007
排名 5 · TkA08G170190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02362B322-92 aa
PF23935DUF727161-82 aa
PF03754At2g31720-like61-80 aa
PF05044HPD137-208 aa
PF02362B3152-242 aa
PF04014MazE_antitoxin161-177 aa
PF03754At2g31720-like186-228 aa
PF02362B3269-360 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G170190PF02362B322926.8e-63209.6
TkA08G170190PF23935DUF727161820.001419.5
TkA08G170190PF03754At2g31720-like61800.2911.6
TkA08G170190PF05044HPD1372080.02715.1
TkA08G170190PF02362B31522426.8e-63209.6
TkA08G170190PF04014MazE_antitoxin1611770.003318.1
TkA08G170190PF03754At2g31720-like1862280.2911.6
TkA08G170190PF02362B32693606.8e-63209.6
TkA08G170190PF04014MazE_antitoxin2853010.003318.1
TkA08G170190PF03754At2g31720-like2933430.2911.6
TkA08G170190PF23935DUF72713063490.001419.5
TkA08G170190PF04014MazE_antitoxin3293490.003318.1
TkA08G170190PF02362B33964856.8e-63209.6
TkA08G170190PF07933DUF16814214620.1412.5
TkA08G170190PF03754At2g31720-like4264700.2911.6
TkA08G170190PF23935DUF72714364910.001419.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GYM4拟南芥sp|Q8GYM4|REM14_ARATH B3 domain-containing protein REM1425.800%Swiss-Prot低置信
Q84WP3拟南芥sp|Q84WP3|REM17_ARATH B3 domain-containing protein REM1735.900%Swiss-Prot中等置信
Q8S8E8拟南芥sp|Q8S8E8|REML1_ARATH B3 domain-containing protein REM-like 126.500%Swiss-Prot低置信
P0DH85拟南芥sp|P0DH85|REM10_ARATH B3 domain-containing protein REM1038.700%Swiss-Prot低置信
O23076拟南芥sp|O23076|REM15_ARATH Putative B3 domain-containing protein REM1526.400%Swiss-Prot低置信

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