RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G167600
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 43808434-43809668 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

564 bp · TkA08G167600|TK1151|cDNA

ATGGTGGTTCACCGAGATCTTAAGCATGCAAGTTTACTTCTTAACTCAAAGGGAAATGGCAAAATTACTTACTTTGGACTAGCCAATCTCATGCGAGATGGCCATGTTCTGGAAACAAGTTGTGGAAGCCCTAATTATGCTTTTATAGAGGTTATACCTGAATGTCAGTTTGAAGCCTCTAAGTTGATGTCTGGACTTGTGGAGAACATCTTCCACAATACAATGCAGGCCACTCAATTGATATTTAATGGAGTCCAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

564 bp · TkA08G167600|TK1151|CDS

ATGGTGGTTCACCGAGATCTTAAGCATGCAAGTTTACTTCTTAACTCAAAGGGAAATGGCAAAATTACTTACTTTGGACTAGCCAATCTCATGCGAGATGGCCATGTTCTGGAAACAAGTTGTGGAAGCCCTAATTATGCTTTTATAGAGGTTATACCTGAATGTCAGTTTGAAGCCTCTAAGTTGATGTCTGGACTTGTGGAGAACATCTTCCACAATACAATGCAGGCCACTCAATTGATATTTAATGGAGTCCAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

187 aa · TkA08G167600|TK1151|PROTEIN

MVVHRDLKHASLLLNSKGNGKITYFGLANLMRDGHVLETSCGSPNYAFIEVIPECQFEASKLMSGLVENIFHNTMQATQLIFNGVQERYKQVDVRGLEEMAILGFDVEEVIGSLNNFLKNMVPKLSKATVTYSILLHMVLSNHNYNKNNLCHHNAQIAEKFIIGLERNHVDMGGMAGLELVESSTVV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G167600
TK1151 IDTkA08G167600
OH-1004 IDLXL04_036177
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)41.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 80.214 / OH-1004 42.480
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G167600
位置Chr08:43808434-43809668 (+)
描述Similar to KIN10: SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g01090 可能的三聚体 SNF1 相关蛋白激酶 复合物的催化亚基，是细胞能量稳态的中央调节器，它响应看似无关的黑暗、糖和压力条件，激活能量产生途径并抑制能量消耗过程。
Regulatory interaction of PRL1 WD protein with Arabidopsis SNF1-like protein kinases.1999 · DOI: 10.1073/pnas.96.9.5322
A central integrator of transcription networks in plant stress and energy signalling.2007 · DOI: 10.1038/nature06069
Cross-phosphorylation between Arabidopsis thaliana sucrose nonfermenting 1-related protein kinase 1 (AtSnRK1) and its activating kinase (AtSnAK) determines their catalytic activities.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m109.079194
AKIN10 and FUSCA3 interact to control lateral organ development and phase transitions in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04832.x
Overlapping and distinct roles of AKIN10 and FUSCA3 in ABA and sugar signaling during seed germination.2012 · DOI: 10.4161/psb.21549
Inverse modulation of the energy sensor Snf1-related protein kinase 1 on hypoxia adaptation and salt stress tolerance in Arabidopsis thaliana.2014 · DOI: 10.1111/pce.12375
AKIN10 delays flowering by inactivating IDD8 transcription factor through protein phosphorylation in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1186/s12870-015-0503-8
Quantitative phosphoproteomics of protein kinase SnRK1 regulated protein phosphorylation in Arabidopsis under submergence.2016 · DOI: 10.1093/jxb/erw107
AKIN10, a representative Arabidopsis SNF1-related protein kinase 1 (SnRK1), phosphorylates and downregulates plant HMG-CoA reductase.2017 · DOI: 10.1002/1873-3468.12618
Phosphorylation of WRINKLED1 by KIN10 Results in Its Proteasomal Degradation, Providing a Link between Energy Homeostasis and Lipid Biosynthesis.2017 · DOI: 10.1105/tpc.17.00019
The AMP-Activated Protein Kinase KIN10 Is Involved in the Regulation of Autophagy in Arabidopsis .2017 · DOI: 10.3389/fpls.2017.01201
SnRK1 activates autophagy via the TOR signaling pathway in Arabidopsis thaliana.2017 · DOI: 10.1371/journal.pone.0182591
SnRK1 phosphorylation of FUSCA3 positively regulates embryogenesis, seed yield, and plant growth at high temperature in Arabidopsis.2017 · DOI: 10.1093/jxb/erx233
The Energy-Signaling Hub SnRK1 Is Important for Sucrose-Induced Hypocotyl Elongation.2018 · DOI: 10.1104/pp.17.01395
The Role of Arabidopsis Inositol Polyphosphate Kinase AtIPK2β in Glucose Suppression of Seed Germination and Seedling Development.2018 · DOI: 10.1093/pcp/pcx186
Involvement of the SnRK1 subunit KIN10 in sucrose-induced hypocotyl elongation.2018 · DOI: 10.1080/15592324.2018.1457913
At3g29160 可能的三聚体 SNF1 相关蛋白激酶 复合物的催化亚基，是细胞能量稳态的中央调节器，它响应看似无关的黑暗、糖和压力条件，激活能量产生途径并抑制能量消耗过程。
Regulatory interaction of PRL1 WD protein with Arabidopsis SNF1-like protein kinases.1999 · DOI: 10.1073/pnas.96.9.5322
A central integrator of transcription networks in plant stress and energy signalling.2007 · DOI: 10.1038/nature06069
At5g57630 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0530500 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与发芽和幼苗生长过程中的糖信号传导。
The SnRK1A protein kinase plays a key role in sugar signaling during germination and seedling growth of rice.2007 · DOI: 10.1105/tpc.105.037887
Os06g0606000 可能参与细胞内 Na⁺、K⁺ 稳态及耐盐性的调控。
Conservation of the salt overly sensitive pathway in rice.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.092635
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036177 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0003006 developmental process involved in reproduction 生物过程
GO:0005982 starch metabolic process 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009594 detection of nutrient 生物过程
GO:0009635 response to herbicide 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009743 response to carbohydrate 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G01090
ath:AT3G29160
dosa:Os05g0530500
dosa:Os08g0484600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.426
排名 1 · TkA08G167600 · TK1151
细胞核0.297
排名 2 · TkA08G167600 · TK1151
线粒体0.134
排名 3 · TkA08G167600 · TK1151
细胞膜0.120
排名 4 · TkA08G167600 · TK1151
内质网0.098
排名 5 · TkA08G167600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase2-57 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2-35 aa
PF15005IZUMO54-160 aa
PF22442Gp49_Pectate_lyase_like63-177 aa
PF03806ABG_transport76-144 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr112-158 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G167600PF00069Pkinase2571.6e-0938.3
TkA08G167600PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2350.003717.3
TkA08G167600PF15005IZUMO541600.2312.8
TkA08G167600PF22442Gp49_Pectate_lyase_like631770.06913.2
TkA08G167600PF03806ABG_transport761440.008815.1
TkA08G167600PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1121580.003717.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38997拟南芥sp|Q38997|KIN10_ARATH SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN1073.100%Swiss-Prot低置信
P92958拟南芥sp|P92958|KIN11_ARATH SNF1-related protein kinase catalytic subunit alpha KIN1171.200%Swiss-Prot低置信
Q94CG0拟南芥sp|Q94CG0|CIPKL_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 2152.900%Swiss-Prot低置信
Q852Q2水稻sp|Q852Q2|OSK1_ORYSJ Serine/threonine protein kinase OSK173.100%Swiss-Prot低置信
Q69Q47水稻sp|Q69Q47|CIPKO_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 2446.700%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看