TkA08G162270 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G162270

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 42358406-42359369 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

884 bp · TkA08G162270|TK1151|cDNA

AAACACAAAAAGAAAGGCCGCATATGGTAAACATGCTTTCCCTCTTTCATCAAATTATTATAATGATTTAAACCAAAACCTCACTATCCAAAGTCTCTTTAAATATCCTCCATCGTCTCTTTCCTCTGAGCTAAACTAAAAAGAAACAGCATGATCTCCATGGCCATGGGTTCATTGTTCAAAGTAAACGAGTCCACCAAGACACCATCCATGGAGTACTCAAAAGCTGTTGGATTGAAGATTCTCACCACTAAAACCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

474 bp · TkA08G162270|TK1151|CDS

ATGATCTCCATGGCCATGGGTTCATTGTTCAAAGTAAACGAGTCCACCAAGACACCATCCATGGAGTACTCAAAAGCTGTTGGATTGAAGATTCTCACCACTAAAACCCCCCACCTTCATCATTCCAGACCCATTTTTCAAAGGAATCAAATTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCGGTTCCATATGTTTCATCAAATCTTGCCTTCTATGCCACAAACATATTTCTCTTAACAAAGAGGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

157 aa · TkA08G162270|TK1151|PROTEIN

MISMAMGSLFKVNESTKTPSMEYSKAVGLKILTTKTPHLHHSRPIFQRNQIPSSSSSSSSSSSSSGSICFIKSCLLCHKHISLNKEVYMYRGDQSFCSEECRSRQIYIDDVKQLEITTKKMIQQYRQSSKKTRTHFRKNRNPWRRRYFACRAWFLIF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G162270`
TK1151 ID	TkA08G162270
OH-1004 ID	LXL04_032267
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	97.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 87.898 / OH-1004 91.837 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G162270

位置 Chr08:42358406-42359369 (+)

描述 Similar to FLZ18: FCS-Like Zinc finger 18

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g44670`	可能作为适配器，促进SnRK1复合物与效应蛋白的相互作用，从而在不同组织和刺激类型中赋予SnRK1调控通路的特异性差异。	暂无已核实直接文献
`At4g17670`	可能作为适配器，促进SnRK1复合物与效应蛋白的相互作用，从而在不同组织和刺激类型中赋予SnRK1调控通路的特异性差异。	暂无已核实直接文献
`At5g47060`	可能作为适配器，促进SnRK1复合物与效应蛋白的相互作用，从而在不同组织和刺激类型中赋予SnRK1调控通路的特异性差异。	暂无已核实直接文献
`At5g65040`	可能作为适配器，促进SnRK1复合物与效应蛋白的相互作用，从而在不同组织和刺激类型中赋予SnRK1调控通路的特异性差异。	暂无已核实直接文献
`At5g49120`	可能作为适配器，促进SnRK1复合物与效应蛋白的相互作用，从而在不同组织和刺激类型中赋予SnRK1调控通路的特异性差异。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032267 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009646 response to absence of light 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009744 response to sucrose 生物过程

GO:0009749 response to glucose 生物过程

GO:0034097 response to cytokine 生物过程

GO:0042594 response to starvation 生物过程

GO:0071368 cellular response to cytokinin stimulus 生物过程

GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程

GO:1902074 response to salt 生物过程

GO:1905582 response to mannose 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G53885

ath:AT1G53903

ath:AT2G44670

ath:AT4G17670

ath:AT5G47060

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.729

排名 1 · TkA08G162270 · TK1151

细胞质0.314

排名 2 · TkA08G162270 · TK1151

细胞膜0.053

排名 3 · TkA08G162270 · TK1151

内质网0.031

排名 4 · TkA08G162270 · TK1151

线粒体0.017

排名 5 · TkA08G162270 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23740Ig_ZP2_3rd7-60 aa

PF11928DUF344645-120 aa

PF10500SR-2546-69 aa

PF30675FAM13348-66 aa

PF24232DUF744549-102 aa

PF04570zf-FLZ62-110 aa

PF11008DUF284686-124 aa

PF23740Ig_ZP2_3rd96-112 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G162270	`PF23740`	Ig_ZP2_3rd	7	60	0.15	12.9
TkA08G162270	`PF11928`	DUF3446	45	120	0.0026	18.6
TkA08G162270	`PF10500`	SR-25	46	69	2.2	8.5
TkA08G162270	`PF30675`	FAM133	48	66	7.4	7.6
TkA08G162270	`PF24232`	DUF7445	49	102	0.2	12.6
TkA08G162270	`PF04570`	zf-FLZ	62	110	7.3e-19	67.7
TkA08G162270	`PF11008`	DUF2846	86	124	0.025	15.5
TkA08G162270	`PF23740`	Ig_ZP2_3rd	96	112	0.15	12.9
TkA08G162270	`PF30675`	FAM133	119	138	7.4	7.6
TkA08G162270	`PF10500`	SR-25	127	127	2.2	8.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O80506`	拟南芥	sp\|O80506\|FLZ3_ARATH FCS-Like Zinc finger 3	46.900%	Swiss-Prot	低置信
`Q8VZM9`	拟南芥	sp\|Q8VZM9\|FLZ2_ARATH FCS-Like Zinc finger 2	36.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FGQ9`	拟南芥	sp\|Q9FGQ9\|FLZ1_ARATH FCS-Like Zinc finger 1	54.500%	Swiss-Prot	低置信
`Q9LV75`	拟南芥	sp\|Q9LV75\|IRM1_ARATH Protein INCREASED RESISTANCE TO MYZUS PERSICAE 1	43.600%	Swiss-Prot	低置信
`Q9FH22`	拟南芥	sp\|Q9FH22\|FLZ15_ARATH FCS-Like Zinc finger 15	44.400%	Swiss-Prot	低置信

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