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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G130900
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 33973980-33976333 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1388 bp · TkA08G130900|TK1151|cDNA

ATGGGGGGATGGCGATTTGAAGAAGATCGTGAGATAACTTTTCCTCACACTCTTGTTTTGATTGGAAAGACTGGAAACGGGAAAAACGCTACAGGGAATACCATTCTAGGAAAGCAATTGTTTCGATCTTTGCGTAGTTTATCTGCTATAACAATTACCTCAGAGTTGAAGACAACTACACTGGAAAAGGGCCAGCCTCTTAACGTTATCGATACTCCTGGTTTATTTGATTCATCTACAGCTGTCGAGTTTATTAAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1188 bp · TkA08G130900|TK1151|CDS

ATGGGGGGATGGCGATTTGAAGAAGATCGTGAGATAACTTTTCCTCACACTCTTGTTTTGATTGGAAAGACTGGAAACGGGAAAAACGCTACAGGGAATACCATTCTAGGAAAGCAATTGTTTCGATCTTTGCGTAGTTTATCTGCTATAACAATTACCTCAGAGTTGAAGACAACTACACTGGAAAAGGGCCAGCCTCTTAACGTTATCGATACTCCTGGTTTATTTGATTCATCTACAGCTGTCGAGTTTATTAAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

395 aa · TkA08G130900|TK1151|PROTEIN

MGGWRFEEDREITFPHTLVLIGKTGNGKNATGNTILGKQLFRSLRSLSAITITSELKTTTLEKGQPLNVIDTPGLFDSSTAVEFIKKEIVNCINMAKDGFNAFLVVISVRMRFAEDDKAAINSMVDLFGRKFYNYTIIVFTGGDELEYFEESFRDFLKNSPESLKDALHQCRNRCVLFDNKTDDLTKRANQLKKLFSLVNAVSRANGGKPYTYELFTGLKFESRLKETTLKLEQLLEKECTARLMTNKEIINVEMTLNET...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G130900
TK1151 IDTkA08G130900
OH-1004 IDLXL04_031809
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)95.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G130900
位置Chr08:33973980-33976333 (-)
描述Similar to IAN9: Immune-associated nucleotide-binding protein 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g33970 免疫相关核苷酸结合蛋白 9。 暂无已核实直接文献
At1g33900 免疫相关核苷酸结合蛋白 4。 暂无已核实直接文献
At1g33950 免疫相关的核苷酸结合蛋白7。 暂无已核实直接文献
At2g26820 免疫相关核苷酸结合蛋白 10。 暂无已核实直接文献
At1g33960 免疫相关的核苷酸结合蛋白 8。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031809 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0030968 endoplasmic reticulum unfolded protein response 生物过程
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:1900425 negative regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003924 GTPase activity 分子功能
GO:0005525 GTP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G33900
ath:AT1G33950
ath:AT1G33970
ath:AT2G26820
ath:AT4G09940
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.606
排名 1 · TkA08G130900 · TK1151
细胞膜0.226
排名 2 · TkA08G130900 · TK1151
细胞核0.188
排名 3 · TkA08G130900 · TK1151
线粒体0.111
排名 4 · TkA08G130900 · TK1151
内质网0.098
排名 5 · TkA08G130900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04548AIG117-223 aa
PF01926MMR_HSR118-119 aa
PF00009GTP_EFTU50-77 aa
PF28589GH172_dom100-131 aa
PF09346SMI1_KNR4131-158 aa
PF00009GTP_EFTU173-197 aa
PF28164AmcA_3a223-245 aa
PF22905Hydro_N_hd231-289 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G130900PF04548AIG1172231.6e-64217.8
TkA08G130900PF01926MMR_HSR1181190.0001222.8
TkA08G130900PF00009GTP_EFTU50777.86.8
TkA08G130900PF28589GH172_dom1001312.28.6
TkA08G130900PF09346SMI1_KNR41311582.99.3
TkA08G130900PF00009GTP_EFTU1731977.86.8
TkA08G130900PF28164AmcA_3a2232454.38.7
TkA08G130900PF22905Hydro_N_hd2312897.27.2
TkA08G130900PF28217FAM81B2522963.77.4
TkA08G130900PF04548AIG12532941.6e-64217.8
TkA08G130900PF28164AmcA_3a2562824.38.7
TkA08G130900PF28589GH172_dom2693152.28.6
TkA08G130900PF09346SMI1_KNR42893172.99.3
TkA08G130900PF28217FAM81B3033793.77.4
TkA08G130900PF28164AmcA_3a3063364.38.7
TkA08G130900PF28589GH172_dom3353602.28.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HT21拟南芥sp|F4HT21|IAN9_ARATH Immune-associated nucleotide-binding protein 939.200%Swiss-Prot中等置信
Q9C8U7拟南芥sp|Q9C8U7|IAN4_ARATH Immune-associated nucleotide-binding protein 440.400%Swiss-Prot中等置信
Q9C8V2拟南芥sp|Q9C8V2|IAN7_ARATH Immune-associated nucleotide-binding protein 739.400%Swiss-Prot中等置信
O81025拟南芥sp|O81025|IAN10_ARATH Immune-associated nucleotide-binding protein 1040.600%Swiss-Prot中等置信
P54120拟南芥sp|P54120|IAN8_ARATH Immune-associated nucleotide-binding protein 841.400%Swiss-Prot中等置信

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