TkA08G115550 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G115550

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 30107105-30109235 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

687 bp · TkA08G115550|TK1151|cDNA

ATGCCATTCACGAGCATTCGCCCATTTCCACCCACCATCATTGCACCACGAGTTTACCACCACCTTGTCTCCGCTGTGGCAGCATCTTCGGGAACCGCCATTACATCCCTAAATCACTCACCACTTCTCACTTCTACTACAAGGACACATCGACTTGATGGAACGATGGTGGCTAAAAAGAGTGGAATTGGATTCAAAAATTACATTTACATGGAATTGGAGAACAATATTGCGGCCACGACTGTTGATATTATTATTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

687 bp · TkA08G115550|TK1151|CDS

ATGCCATTCACGAGCATTCGCCCATTTCCACCCACCATCATTGCACCACGAGTTTACCACCACCTTGTCTCCGCTGTGGCAGCATCTTCGGGAACCGCCATTACATCCCTAAATCACTCACCACTTCTCACTTCTACTACAAGGACACATCGACTTGATGGAACGATGGTGGCTAAAAAGAGTGGAATTGGATTCAAAAATTACATTTACATGGAATTGGAGAACAATATTGCGGCCACGACTGTTGATATTATTATTTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

228 aa · TkA08G115550|TK1151|PROTEIN

MPFTSIRPFPPTIIAPRVYHHLVSAVAASSGTAITSLNHSPLLTSTTRTHRLDGTMVAKKSGIGFKNYIYMELENNIAATTVDIIIFLIPIGLEECIRFVANFKLSKEDIAFLRECLSPKCEDAFFDYLESIDSQDVEVYAIAEGSVVFPKVPPMRIEGPVAVVQLLETPYVNLINFASLVTTNAARHRFVAGKDKLLLEFGLQRPRGPDGGVGASRYCYMGGFDVTR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G115550`
TK1151 ID	TkA08G115550
OH-1004 ID	LXL04_029988
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	92.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G115550

位置 Chr08:30107105-30109235 (+)

描述 Similar to NAPRT2: Nicotinate phosphoribosyltransferase 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g36940`	催化从烟酸合成NAD的第一步，即从烟酸和5-磷酸-D-核糖-1-磷酸通过ATP依赖的反应合成β-烟酰胺D-核糖核苷酸。	暂无已核实直接文献
`At2g23420`	催化从烟酸合成NAD的第一步，即从烟酸和5-磷酸-D-核糖-1-磷酸通过ATP依赖的反应合成β-烟酰胺D-核糖核苷酸。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029988 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0034355 NAD+ biosynthetic process via the salvage pathway 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0004516 nicotinate phosphoribosyltransferase activity 分子功能

GO:0016740 transferase activity 分子功能

GO:0016757 glycosyltransferase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G23420

ath:AT4G36940

bta:399559

cel:CELE_Y54G2A.17

ddi:DDB_G0268472

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.967

排名 1 · TkA08G115550 · TK1151

线粒体0.041

排名 2 · TkA08G115550 · TK1151

细胞质0.038

排名 3 · TkA08G115550 · TK1151

过氧化物酶体0.029

排名 4 · TkA08G115550 · TK1151

细胞核0.018

排名 5 · TkA08G115550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17767NAPRTase_N92-176 aa

PF26372DUF8096101-116 aa

PF21623HK_sensor_dom_bact106-163 aa

PF02749QRPTase_N134-179 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G115550	`PF17767`	NAPRTase_N	92	176	2.4e-18	67.4
TkA08G115550	`PF26372`	DUF8096	101	116	0.23	11.8
TkA08G115550	`PF21623`	HK_sensor_dom_bact	106	163	0.42	10.5
TkA08G115550	`PF02749`	QRPTase_N	134	179	0.00011	23.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8RWM2`	拟南芥	sp\|Q8RWM2\|NPRT1_ARATH Nicotinate phosphoribosyltransferase 1	72.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q84WV8`	拟南芥	sp\|Q84WV8\|NPRT2_ARATH Nicotinate phosphoribosyltransferase 2	71.300%	Swiss-Prot	中等置信

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