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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G105040
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 27272873-27275099 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1578 bp · TkA08G105040|TK1151|cDNA

CGATTTTTGAGTAAGAAGGTTTTCCTGTTGACAAAGTCCCGATCCATGGTTTTGGAGCAGTTTAGCTTCCATTGTGGTGTTTCTGGGAATTCTTCAAAGATGTCATCCTCCGTCTTCTTAATACTGTCACTTTCCATCGTCTCGCTTCTAGTCCCGTCGATCTCTTCGCACGAGTTTAAGGTCAATGGGAAGGTGTTGGTGCTTGATGAATCGAACTTCGAAGCCGCAATTTCTTCCTTCGACTTCATCTTCGTTAGTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1344 bp · TkA08G105040|TK1151|CDS

ATGGTTTTGGAGCAGTTTAGCTTCCATTGTGGTGTTTCTGGGAATTCTTCAAAGATGTCATCCTCCGTCTTCTTAATACTGTCACTTTCCATCGTCTCGCTTCTAGTCCCGTCGATCTCTTCGCACGAGTTTAAGGTCAATGGGAAGGTGTTGGTGCTTGATGAATCGAACTTCGAAGCCGCAATTTCTTCCTTCGACTTCATCTTCGTTAGTTTTTATGCCCCATGGTGTGGCCACTGCAAACGTCTTAATCCAGAGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

447 aa · TkA08G105040|TK1151|PROTEIN

MVLEQFSFHCGVSGNSSKMSSSVFLILSLSIVSLLVPSISSHEFKVNGKVLVLDESNFEAAISSFDFIFVSFYAPWCGHCKRLNPELDKAAPMLSGLKDPIVIAKIDADKYHRIAKKYDIDGFPTLKIFMHGLPTDYYGPRKADKLVRYLKKFVAPDITVLESDSGITEFVDSAGTFFPIFIGFGVDESALSKVSVKFKKNAWFSIAKDFSEKTMTLFDFDKTPALVALHPSFNEQNIFYGPFEEKFVEEFVQQSLLPLI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G105040
TK1151 IDTkA08G105040
OH-1004 IDLXL04_031404
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G105040
位置Chr08:27272873-27275099 (-)
描述Similar to PDIL5-2: Protein disulfide-isomerase 5-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g35620 作为蛋白质折叠催化剂，与新生多肽相互作用，催化二硫键的形成、异构化以及还原或氧化。 暂无已核实直接文献
At1g21750 蛋白质二硫键异构酶，与 RD21A 蛋白酶结合，从内质网通过高尔基体运输到发育种子中内皮细胞的裂解和蛋白质储存液泡。
Arabidopsis protein disulfide isomerase-5 inhibits cysteine proteases during trafficking to vacuoles before programmed cell death of the endothelium in developing seeds.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.058339

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0432500 作为蛋白质折叠催化剂，与新生多肽相互作用，催化二硫键的形成、异构化以及还原或氧化。 暂无已核实直接文献
Os02g0550300 作为蛋白质折叠催化剂，与新生多肽相互作用，催化二硫键的形成、异构化以及还原或氧化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031404 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010043 response to zinc ion 生物过程
GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress 生物过程
GO:0043067 regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0048316 seed development 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0000326 protein storage vacuole 细胞组分
GO:0000327 lytic vacuole within protein storage vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005788 endoplasmic reticulum lumen 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21750
ath:AT1G35620
dosa:Os02g0550300
dosa:Os04g0432500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.794
排名 1 · TkA08G105040 · TK1151
高尔基体0.128
排名 2 · TkA08G105040 · TK1151
细胞核0.094
排名 3 · TkA08G105040 · TK1151
细胞质0.092
排名 4 · TkA08G105040 · TK1151
细胞膜0.045
排名 5 · TkA08G105040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05296TAS2R17-68 aa
PF00085Thioredoxin50-152 aa
PF20207PedC-like53-132 aa
PF13098Thioredoxin_267-152 aa
PF13905Thioredoxin_868-110 aa
PF13899Thioredoxin_768-125 aa
PF13848Thioredoxin_697-154 aa
PF13905Thioredoxin_8107-128 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G105040PF05296TAS2R17680.2211.3
TkA08G105040PF00085Thioredoxin501525.4e-2794.5
TkA08G105040PF20207PedC-like531320.001319.5
TkA08G105040PF13098Thioredoxin_2671529.2e-0833.1
TkA08G105040PF13905Thioredoxin_8681106.8e-0523.9
TkA08G105040PF13899Thioredoxin_7681250.001219.7
TkA08G105040PF13848Thioredoxin_6971546.7e-0833.3
TkA08G105040PF13905Thioredoxin_81071286.8e-0523.9
TkA08G105040PF13905Thioredoxin_81752326.8e-0523.9
TkA08G105040PF13848Thioredoxin_61903466.7e-0833.3
TkA08G105040PF13098Thioredoxin_22102279.2e-0833.1
TkA08G105040PF20207PedC-like2162290.001319.5
TkA08G105040PF13098Thioredoxin_22663309.2e-0833.1
TkA08G105040PF13905Thioredoxin_82973386.8e-0523.9
TkA08G105040PF00085Thioredoxin3053515.4e-2794.5
TkA08G105040PF13899Thioredoxin_73183410.001219.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94F09拟南芥sp|Q94F09|PDI52_ARATH Protein disulfide-isomerase 5-259.100%Swiss-Prot高置信
Q9XI01拟南芥sp|Q9XI01|PDI11_ARATH Protein disulfide isomerase-like 1-134.700%Swiss-Prot中等置信
Q0JD42水稻sp|Q0JD42|PDI52_ORYSJ Protein disulfide isomerase-like 5-257.300%Swiss-Prot高置信
Q0E0I1水稻sp|Q0E0I1|PDI53_ORYSJ Protein disulfide isomerase-like 5-355.900%Swiss-Prot高置信

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