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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G103000
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 26706725-26713103 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3230 bp · TkA08G103000|TK1151|cDNA

TTAAATTTCAAAACCCCGCGCTGTCTTTCCATCTCCAACAAACACATACGCCTATAGCTATAGATATACATATACATGTATAGATTCATATACACACACATTAACACACCCAACGATAGTGAAAATGGAATTGCAGAACGGATTCAAGCTTTTGCTTCAACAATACAAAGCTTTGTTCACGAAGAACTTGCTGCTCGCATGGCGGAACAAGAGGGCTACATTCCTTCAGTTATTTTCATCAATATTCTTCATATTTTTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2808 bp · TkA08G103000|TK1151|CDS

ATGGAATTGCAGAACGGATTCAAGCTTTTGCTTCAACAATACAAAGCTTTGTTCACGAAGAACTTGCTGCTCGCATGGCGGAACAAGAGGGCTACATTCCTTCAGTTATTTTCATCAATATTCTTCATATTTTTACTTTTCGTTTTTCAAAAAGCAACTAATGCTCAATTCGGAACTTCGACTGCCTTCAAGGCTGTACGAGATCCCGAGCCGCTAATCGATCCTCCCATCCCTCCGTGTGAGGATAAGTATTACATTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

935 aa · TkA08G103000|TK1151|PROTEIN

MELQNGFKLLLQQYKALFTKNLLLAWRNKRATFLQLFSSIFFIFLLFVFQKATNAQFGTSTAFKAVRDPEPLIDPPIPPCEDKYYIKLPCFDFVWSGSDSARIGSIVDQIRANNPGRPIPSTKVKQFRTKTDVDAWFFANPMSCPGALHFVERNATVISYGLQTNSTPIAKRGHYEDPTFKFTIPLQIAAEREIARSLIGDPGFSWVVNLKEFAHPVVETYSSVAIVGPTFFLAIAMFGFVLQISSLITEKELKLRQAMA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G103000
TK1151 IDTkA08G103000
OH-1004 IDLXL04_031363
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)83.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.896
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G103000
位置Chr08:26706725-26713103 (-)
描述Similar to ABCA2: ABC transporter A family member 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g47730 ABC转运蛋白A家族成员2。 暂无已核实直接文献
At5g61690 ABC 转运蛋白 A 家族成员 11。 暂无已核实直接文献
At5g61730 介导酰基辅酶A和/或游离脂肪酸向内质网的转运。
AtABCA9 transporter supplies fatty acids for lipid synthesis to the endoplasmic reticulum.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1214159110
At3g47780 ABC 转运蛋白 A 家族成员 7。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031363 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006641 triglyceride metabolic process 生物过程
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0010867 positive regulation of triglyceride biosynthetic process 生物过程
GO:0034197 triglyceride transport 生物过程
GO:0048316 seed development 生物过程
GO:0048317 seed morphogenesis 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005319 lipid transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G47730
ath:AT3G47780
ath:AT5G61690
ath:AT5G61730
ddi:DDB_G0291994
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.450
排名 1 · TkA08G103000 · TK1151
溶酶体／液泡0.287
排名 2 · TkA08G103000 · TK1151
细胞质0.204
排名 3 · TkA08G103000 · TK1151
内质网0.146
排名 4 · TkA08G103000 · TK1151
高尔基体0.133
排名 5 · TkA08G103000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01061ABC2_membrane12-49 aa
PF12698ABC2_membrane_336-57 aa
PF12698ABC2_membrane_3222-437 aa
PF01061ABC2_membrane226-349 aa
PF03215Rad17543-577 aa
PF00005ABC_tran544-690 aa
PF13175AAA_15546-574 aa
PF13476AAA_23549-575 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G103000PF01061ABC2_membrane12490.5410.5
TkA08G103000PF12698ABC2_membrane_336572.1e-1764.0
TkA08G103000PF12698ABC2_membrane_32224372.1e-1764.0
TkA08G103000PF01061ABC2_membrane2263490.5410.5
TkA08G103000PF03215Rad175435770.3311.6
TkA08G103000PF00005ABC_tran5446905.9e-2485.9
TkA08G103000PF13175AAA_155465740.1512.3
TkA08G103000PF13476AAA_235495752e-0526.1
TkA08G103000PF13604AAA_305535770.1912.2
TkA08G103000PF02463SMC_N5545720.02514.7
TkA08G103000PF13304AAA_215565769.6e-1452.7
TkA08G103000PF01078Mg_chelatase5576040.2111.6
TkA08G103000PF13304AAA_216457229.6e-1452.7
TkA08G103000PF02463SMC_N6527320.02514.7
TkA08G103000PF01078Mg_chelatase6686930.2111.6
TkA08G103000PF13175AAA_156817190.1512.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84K47拟南芥sp|Q84K47|AB2A_ARATH ABC transporter A family member 268.800%Swiss-Prot高置信
Q9FKF2拟南芥sp|Q9FKF2|AB11A_ARATH ABC transporter A family member 1164.900%Swiss-Prot高置信
Q9FLT5拟南芥sp|Q9FLT5|AB9A_ARATH ABC transporter A family member 965.200%Swiss-Prot高置信
Q9STT5拟南芥sp|Q9STT5|AB7A_ARATH ABC transporter A family member 733.800%Swiss-Prot中等置信

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