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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G100760
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 26130426-26133138 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1629 bp · TkA08G100760|TK1151|cDNA

ATGGGTCGAGTTGTTGTGGCATTTGATGCGACTAAAGATCGAAATGAGCATAAGTTCCAGCATATTATCAATGGCATCGTATCAAGAGTTGACATGCTCAACAGGGGAGATACCATCCTGGTGTTTGGAATTTTGCATAAGGTTTCACATCCCTTTGGTTACCAAATGCATATAGAAGATGCAAACATTCGAGCCATGGAAGAGGATGTTATAAAAAAACTTGATATTTACATCAAAACGCTTCAAACAACCGCTGTAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1629 bp · TkA08G100760|TK1151|CDS

ATGGGTCGAGTTGTTGTGGCATTTGATGCGACTAAAGATCGAAATGAGCATAAGTTCCAGCATATTATCAATGGCATCGTATCAAGAGTTGACATGCTCAACAGGGGAGATACCATCCTGGTGTTTGGAATTTTGCATAAGGTTTCACATCCCTTTGGTTACCAAATGCATATAGAAGATGCAAACATTCGAGCCATGGAAGAGGATGTTATAAAAAAACTTGATATTTACATCAAAACGCTTCAAACAACCGCTGTAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

542 aa · TkA08G100760|TK1151|PROTEIN

MGRVVVAFDATKDRNEHKFQHIINGIVSRVDMLNRGDTILVFGILHKVSHPFGYQMHIEDANIRAMEEDVIKKLDIYIKTLQTTAVDCKVKGVTIEVKITCGTPLKSIVLQETTTSFASWLILDRHLSRDVQYYQSHVICKLAVILDNSTINPIKVNSNTYTDNTEVKIILYKSKYVFLSTPNDEVTPTILNYSNDLEEVPSHFVTKRQKNIGKKTCSDTFILCNVCEITTKLCIKESMRFSYLEIQNATSSFSVKNLIG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G100760
TK1151 IDTkA08G100760
OH-1004 IDLXL04_034032
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)75.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 57.934 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G100760
位置Chr08:26130426-26133138 (+)
描述Similar to CDG1: Serine/threonine-protein kinase CDG1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g70460 负向调控根毛伸长。 暂无已核实直接文献
At5g38560 可能参与根生长的负调控。
PERK-KIPK-KCBP signalling negatively regulates root growth in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1093/jxb/eru390
At1g23540 在枝条分枝过程中调节生长素相关的 MAX（更多侧枝生长）途径。
Over-expression of the IGI1 leading to altered shoot-branching development related to MAX pathway in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1007/s11103-010-9645-0
At3g24540 富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK3。 暂无已核实直接文献
At3g26940 参与正向调控油菜素甾醇（BR）信号转导和植物生长的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034032 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0032502 developmental process 生物过程
GO:1900459 positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:1990641 response to iron ion starvation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G23540
ath:AT1G70460
ath:AT3G26940
ath:AT5G38560
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.499
排名 1 · TkA08G100760 · TK1151
细胞质0.361
排名 2 · TkA08G100760 · TK1151
细胞核0.276
排名 3 · TkA08G100760 · TK1151
内质网0.046
排名 4 · TkA08G100760 · TK1151
高尔基体0.037
排名 5 · TkA08G100760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr72-109 aa
PF00069Pkinase253-519 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr255-521 aa
PF03109ABC1259-286 aa
PF03190Thioredox_DsbH334-358 aa
PF03109ABC1361-400 aa
PF03190Thioredox_DsbH487-518 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G100760PF07714PK_Tyr_Ser-Thr721093.9e-35122.1
TkA08G100760PF00069Pkinase2535192.7e-39135.9
TkA08G100760PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2555213.9e-35122.1
TkA08G100760PF03109ABC12592860.02514.5
TkA08G100760PF03190Thioredox_DsbH3343580.1812.5
TkA08G100760PF03109ABC13614000.02514.5
TkA08G100760PF03190Thioredox_DsbH4875180.1812.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAL8拟南芥sp|Q9CAL8|PEK13_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1344.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FFW5拟南芥sp|Q9FFW5|PERK8_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK844.800%Swiss-Prot中等置信
Q9ZUE0拟南芥sp|Q9ZUE0|PEK12_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1243.800%Swiss-Prot中等置信
Q1PEM5拟南芥sp|Q1PEM5|PERK3_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK344.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LSE1拟南芥sp|Q9LSE1|CDG1_ARATH Serine/threonine-protein kinase CDG144.400%Swiss-Prot中等置信

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