基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA08G096040
当前版本: TK1151
染色体: Chr08
坐标: 24860164-24860571
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA408 bp · TkA08G096040|TK1151|cDNA
CTTTCTATCTCCAGGGACCAAAATGCTGTTTCGTTGGTTTGCAAGTCGTGGGACGAGATCGAGAGATGGTGCCGGAGGAGTATTTTCGTCGGGAACTGTTACGCTGTTAGTCCACAGATCATGATTCGGAGGTTTCCAGAAGTGAGATTCGTGGAGTTGAAAGGGAAGCCGCATTTTGCAGATTTCAATTTGGTACCGGATGGTTGGGGAGGGTATTTTTACCCTTGGATCTCTGAAATGTCTAGGGCTTACCCGTGGTT...
CDS
下载 CDS FASTA408 bp · TkA08G096040|TK1151|CDS
CTTTCTATCTCCAGGGACCAAAATGCTGTTTCGTTGGTTTGCAAGTCGTGGGACGAGATCGAGAGATGGTGCCGGAGGAGTATTTTCGTCGGGAACTGTTACGCTGTTAGTCCACAGATCATGATTCGGAGGTTTCCAGAAGTGAGATTCGTGGAGTTGAAAGGGAAGCCGCATTTTGCAGATTTCAATTTGGTACCGGATGGTTGGGGAGGGTATTTTTACCCTTGGATCTCTGAAATGTCTAGGGCTTACCCGTGGTT...
135 aa · TkA08G096040|TK1151|PROTEIN
LSISRDQNAVSLVCKSWDEIERWCRRSIFVGNCYAVSPQIMIRRFPEVRFVELKGKPHFADFNLVPDGWGGYFYPWISEMSRAYPWLEEIKLKQMVVTDEGLELISKSFRNFKVLVLSSCEFSTDGLAAIAANCR
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA08G096040 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA08G096040 |
| OH-1004 ID | LXL04_031232 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 97.700 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 98.519 / OH-1004 25.725覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA08G096040 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr08:24860164-24860571 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to TIR1: Protein TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0009733 response to auxin 生物过程 GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程 GO:0010152 pollen maturation 生物过程 GO:0010311 lateral root formation 生物过程 GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程 GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程 GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程 GO:0045014 carbon catabolite repression of transcription by glucose 生物过程 GO:0048443 stamen development 生物过程 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G12820 ath:AT3G26810 ath:AT3G62980 ath:AT4G03190 dosa:Os04g0395600 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.590
细胞质0.230
质体0.120
细胞膜0.051
线粒体0.042
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF18511F-box_54-26 aaPF18791Transp_inhibit46-92 aaPF13516LRR_697-106 aaPF13516LRR_6111-131 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA08G096040 | PF18511 | F-box_5 | 4 | 26 | 9.1e-08 | 32.2 |
| TkA08G096040 | PF18791 | Transp_inhibit | 46 | 92 | 6.1e-26 | 90.4 |
| TkA08G096040 | PF13516 | LRR_6 | 97 | 106 | 0.0039 | 17.8 |
| TkA08G096040 | PF13516 | LRR_6 | 111 | 131 | 0.0039 | 17.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q570C0 | 拟南芥 | sp|Q570C0|TIR1_ARATH Protein TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 | 77.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9ZR12 | 拟南芥 | sp|Q9ZR12|GRH1_ARATH GRR1-like protein 1 | 67.700% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9LPW7 | 拟南芥 | sp|Q9LPW7|AFB3_ARATH Protein AUXIN SIGNALING F-BOX 3 | 62.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9LW29 | 拟南芥 | sp|Q9LW29|AFB2_ARATH Protein AUXIN SIGNALING F-BOX 2 | 63.600% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q7XVM8 | 水稻 | sp|Q7XVM8|TIR1B_ORYSJ Transport inhibitor response 1-like protein Os04g0395600 | 60.300% | Swiss-Prot | 高置信 |